Molecular soft interactions regulating membrane-interface activities in living systems

调节生命系统膜界面活动的分子软相互作用

基本信息

批准号：
15083101
负责人：
AKUTSU Hideo
金额：
$ 61.25万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

生体分子による生命秩序形成において、秩序高度化の要はさまざまなレベルの秩序を繋ぐ生体膜のインターフェイスである。ここでは、情報や物質の交換を通して膜内外の秩序が有機的に結びつけられている。膜インターフェイスの機能発現は、複合体の形成、構造変化の誘起そして新たな相互作用の形成という過程で進むところに特徴がある。ここでの相互作用は、安定複合体の形成のような強固なものとは異なっており、ソフトな分子間相互作用と定義できる。本領域はソフトな分子間相互作用という新しい視点を踏まえつつ、膜インターフェイスを制御する分子メカニズムを構造生物学的な立場から解明することを目的に研究活動に取り組んできた。本年度は、特定領域の成果であるNa^+駆動V型ATPase K-ringの結晶構造の決定(Science)、ATP合成酵素の回転触媒機構の重要部分のNMRによる解明、Mg^<2+>トランスポーターの結晶構造の決定(Nature)、交差緩和法による巨大システムのNMRによる解析等、膜インターフェイスにおけるソフトな分子間相互作用の解明に大きく貢献した成果の取りまとめに取り組んだ。このとり組みを通して結晶構造解析と溶液NMR、固体NMR,計算機科学の組み合わせがソフトな相互作用の強力な解析法であることが明らかになった。この取りまとめでは、これらの成果と本特定領域のさまざまなとり組み、評価担当者の意見等を362ページの研究成果報告書にまとめて文部科学省に提出するとともに、各方面に広く配布した。また、この間に本特定領域の研究および活動金体についての事後評価があり、高い評価を得た。さらに、国際、国内学会において本領域の成果を広める活動に取り組んだ。

在使用生物分子创建生命顺序时，改善顺序的关键是连接各种级别级别的生物膜的接口。在这里，内部和外部秩序通过信息和材料的交换可以有机地联系起来。膜界面的功能表达的特征是复杂形成的过程，诱导结构变化并形成新的相互作用。这里的相互作用与稳定的稳定复合物的形成等强大的相互作用不同，可以定义为软分子间相互作用。从该领域的软分子间相互作用的新角度来看，我们一直在研究研究活动，目的是从结构生物学的角度阐明控制膜接口的分子机制。 This year, we worked on compiling results that have contributed significantly to the elucidation of soft intermolecular interactions in membrane interfaces, including the determination of the crystal structure of Na^+-driven V-type ATPase K-ring, which is a result of a specific area, elucidation of important parts of the rotational catalytic mechanism of ATP synthase by NMR, determination of the crystal structure of Mg^<2+>使用交叉释放弛豫方法对转运蛋白（自然）和大型系统分析。通过这种组合，已经揭示了晶体结构分析，溶液NMR，固态NMR和计算机科学的组合是一种分析软相互作用的有力方法。在此摘要中，这些结果是该特定领域的各种安排以及评估人员的意见，并在一份362页的研究结果报告中汇编，并提交给教育，文化，体育，科学和技术部，并向所有各方分发。在此期间，对该特定领域和活动资金进行的研究进行了评估，并受到了高度赞扬。此外，他们从事活动，在国际和国内学术会议上传播该领域的结果。

项目成果

期刊论文数量（327）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Structural basis for recognition of the nonclassical MHC molecule HLA-G by the leukocyte Ig-like receptor B2 (LILRB2/LIR2/ILT4/CD85d)

DOI：
10.1073/pnas.0605228103
发表时间：
2006-10-31
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
Shiroishi, Mitsunori;Kuroki, Kimiko;Maenaka, Katsumi
通讯作者：
Maenaka, Katsumi

Crystal structure of the Sec4p-Sec2p complex in the nucleotide exchanging intermediate state

DOI：
10.1073/pnas.0701550104
发表时间：
2007-05-15
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
Sato, Yusuke;Fukai, Shuya;Nureki, Osamu
通讯作者：
Nureki, Osamu

Suppression of the ligand-mediated down-regulation of epidermal growth factor receptor by Ymer, a novel tyrosine-phosphorylated and ubiquitinated protein

DOI：
10.1074/jbc.m604184200
发表时间：
2006-08-25
期刊：
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子：
4.8
作者：
Tashiro, Kyoko;Konishi, Hiroaki;Taniguchi, Hisaaki
通讯作者：
Taniguchi, Hisaaki

^1II-Detected ^1II-^1II correlation spectroscopy of a stereo-array isotope labeled amino acid under fast magic-angle spinning.

^1II-在快速魔角旋转下检测立体阵列同位素标记氨基酸的^1II-^1II相关光谱。

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
J.Magn.Reson. 203
影响因子：
0
作者：
Mitsuhiro Takeda;Shinji Ogino;Ryo Umemoto;Masayoshi Sakakura;Masahiro Kajiwara;Kazuki Sugahara;Hiroto Kawashima;Masayuki Miyasaka;Hiroaki Terasawa;and Ichio Shimada;H.Takahashi
通讯作者：
H.Takahashi

Stepwise propagation of the ATP-induced conformational change of the F_1-AfPase β subunit revealed by NMR.

NMR 显示 ATP 诱导的 F_1-AfPase β 亚基构象变化的逐步传播。