遺伝子発現と塩基多型に基づくオオムギ系統進化の推定

基于基因表达和核苷酸多态性的大麦谱系进化估计

• 批准号: 16011241
• 负责人: 佐藤 和広
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011241/
• 关键词: オオムギ; ゲノム解析; cDNA; EST; SNP; DNAアレイ; 遺伝地図

・岡山大学が保有する3'端オオムギESTのUnigeneに由来するプライマーを設計し,約3,000弱のESTを連鎖地図上にマップした(2005年3月現在).また,上記プライマーの六倍性コムギ(パンコムギ)におけるPCR増幅を確認し,コムギの遺伝背景にオオムギの染色体を添加した系統群を用いて約1,000のESTについて座乗染色体を決定した.また,二倍性コムギの分離集団に約100のオオムギESTをマップした.・オオムギ,コムギ,ライムギを含む近縁植物についてオオムギESTマーカーのプライマー配列に基づく類縁関係を推定した.さらに,近縁野生植物でストレス抵抗性に優れたハマニンニクおよびオオハマニンニクについて,染色体添加コムギ系統の添加染色体の識別と同祖群を決定するために,これらの異種染色体に特異的なマーカー各々約100をオオムギESTから得た.また,野生オオムギH.chilenseの染色体添加系統群の添加染色体をオオムギESTマーカーで同定することに成功した.・国際オオムギESTコンソシアムを形成している米国,ドイツ,フィンランド,英国のプロジェクトと共同でAffymetrix社からカスタムオリゴアレイを開発し,同社から発売した.さらに,オオムギGeneChipの発現データベースに関する大規模な国際共同実験を進め,成果を論文投稿した.・Unigeneのクローンを整列化して,品種間に存在するSNPを確認し,これらの配列および用途について米国およびEUに国際特許出願した(岡山大学).・cDNAアレイシステム,植物RNAの自動抽出システム,イネ-オオムギ比較ゲノム地図,BACライブラリーによる遺伝子単離システムなどを開発した.

·Okayama University maintains the design of the 3'end of the EST Unigene, and approximately 3,000 weak EST are linked to the Unigene (March 2005 now). In addition, PCR amplification was confirmed in the hexaploid chromosome of the above record, and the chromosome of the hexaploid chromosome was added to the phylogenetic group. About 1,000 EST were used to determine the chromosome of the locus. The diploidy was isolated from a population of about 100 individuals. The relationship between plant species and species is presumed. In recent years, the resistance of wild plants has been improved, and the identification of additional chromosomes and isotypes in chromosome addition system has been determined. The heterogeneous-chromosome-specific genes are about 100 times each. The chromosome addition system of wild type H.chilense was successfully established by adding chromosome to EST. The international community has developed a new system for the development of social services in the United States, Germany, the United Kingdom and the United Kingdom. Today, GeneChip's discovery is related to large-scale international cooperation, and the results are submitted. Unigene is organized, SNP are identified among varieties, and international licenses are issued for their alignment and use (Okayama University).·cDNA library, automatic extraction of plant RNA library, gene library,BAC library, DNA library

项目成果

Genotypic variation in Fe concentration of barley grain

• DOI: 10.1080/00380768.2004.10408583
• 发表时间: 2004-12-01
• 期刊: SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION
• 影响因子: 2
• 作者: Ma, HF;Higashitani, A;Takeda, K
• 通讯作者: Takeda, K

Genetic variation in component traits of heading date in Hordeum vulgare subsp spontaneum accessions characterized in controlled environments

• DOI: 10.2135/cropsci2004.1622
• 发表时间: 2004-09-01
• 期刊: CROP SCIENCE
• 影响因子: 2.3
• 作者: Karsai, I;Hayes, PM;Sato, K
• 通讯作者: Sato, K

遺伝子に生じた一塩基多型(SNP),およびその利用

基因中出现的单核苷酸多态性 (SNP) 及其用途

• 发表时间: 2004

Molecular mapping of a gene responsible for Al-activated secretion of citrate in barley

• DOI: 10.1093/jxb/erh152
• 发表时间: 2004-06-01
• 期刊: JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY
• 影响因子: 6.9
• 作者: Ma, JF;Nagao, S;Takeda, K
• 通讯作者: Takeda, K