课题基金 / 基金详情

DNAの折り畳み相転移と遺伝子群の発現制御

DNAの折り畳み相転移と遺伝子群の発現制御
DNA折叠相变与基因表达调控
批准号：
16014212
负责人：
吉川 研一
金额：
$2.88万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2004 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16014212/
关键词：
長鎖DNA高次構造転移遺伝子発現転写活性ナノ組織体ダイナミクスレーザーピンセット凝縮転移

项目摘要

项目成果

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長鎖DNAの折り畳み構造の多様性を生物学的な機能活性との関連で捉えなおし、発現制御に関する新しいモデルの構築を目指して研究を進めてきた。本特定領域研究では、実験・理論の両面からDNAの折り畳み転移こついてさらに研究を進め、その結果を踏まえて、複数の遺伝子にまたがるグローバルなDNAの高次構造変化が局所的な分子間相互作用に与える影響を明らかにすることで、遺伝子群の発現制御機構のダイナミクスについて考察することを目的とした。その結果、次に挙げるような成果が得られた。1、DNA溶液に界面活性剤や蛋白質などを添加することにより、DNAと複合体をつくり、一般的な凝縮剤である多価カチオンを用いて凝縮させたときとは異なる凝縮構造をとることが明らかになった。また、理論的には、これらの構造はDNAが複合体を作ることによって実効的な太さや硬さが変化すると考えることによって説明できることを示した。2、細胞を浸透圧によって破裂させ、レーザーピンセットを用いて細胞内のDNAのみをトラップして溶液中を運ぶことが可能になった。この技術により、生体内での状態に近い状態のDNAを直接観察することが可能になり、DNAの構造と転写活性の関連について研究を進めることができると考えられる。3、これまでは転写活性と構造の関係を研究する際、もっぱら線状DNAを用いてきた。しかし、真核細胞の染色体などを考える際には、蛋白質との複合体を作っており、局所的に見ると環状のDNAであるとみなすこともできる。そこで、環状DNAについての折り畳み転移の実験・理論の両面からの研究を行った。その結果、環状DNAについては線状DNAとは異なり連続的な折り畳み転移をすることが明らかになった。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Nanospheres for DNA separation chips
DOI： 10.1038/nbt939
发表时间： 2004-02
期刊： Nature Biotechnology
影响因子： 46.9
作者： [M. Tabuchi;M. Ueda;N. Kaji;Y. Yamasaki;Y. Nagasaki;K. Yoshikawa;K. Kataoka;Y. Baba]
通讯作者： M. Tabuchi;M. Ueda;N. Kaji;Y. Yamasaki;Y. Nagasaki;K. Yoshikawa;K. Kataoka;Y. Baba
On-site manipulation of single whole-genome DNA molecules using optical tweezers
使用光镊现场操作单个全基因组 DNA 分子
DOI： --
发表时间： 2004
期刊： Applied Physics Letters 85
影响因子： --
作者： [H.Oana, K.Kubo, K.Yoshikawa, H.Atomi, T.Imanaka]
通讯作者： T.Imanaka
A design of nanosized PEGylated-latax mixed polymer solution for microchip electrophoresis
用于微芯片电泳的纳米聚乙二醇化乳胶混合聚合物溶液的设计
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： Lab on a Chip 5
影响因子： --
作者： [M.Tabuchi, K.Yoshikawa, et al.]
通讯作者： et al.
Double-strand break of giant DNA : protection by glucosyl-hesperidin as evidenced through direct observation on individual DNA molecules
巨型 DNA 的双链断裂：通过直接观察单个 DNA 分子证明葡萄糖基橙皮苷的保护
DOI： --
发表时间： 2004
期刊： FEBS Lett. 566
影响因子： --
作者： [Noriko Takenaka, Yuko Yoshikawa]
通讯作者： Yuko Yoshikawa
共 6 条
    Real-world modeling of life: From DNA to Organoid
    • 批准号：
      20H01877
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.65万
    • 财政年份：
      2020
    • 负责人：
      吉川 研一
    • 依托单位：
      Doshisha University
    ミクロ環境場における単分子ゲノムDNAの高次構造相
    • 批准号：
      08F08023
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $0.51万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      吉川 研一
    • 依托单位：
      Kyoto University
    等温条件で働くマイクロ化学マシン
    • 批准号：
      18651072
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.3万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      吉川 研一
    • 依托单位：
      Kyoto University
    Real-World Modeling of Self-Emergent Active Cell
    • 批准号：
      17076007
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $55.87万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      吉川 研一
    • 依托单位：
      Kyoto University
    海外基金