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単一荷電高分子鎖の折り畳み転移の統計熱力学

单电荷聚合物链折叠转变的统计热力学

基本信息

批准号：
03F03200
负责人：
吉川研一
金额：
$ 0.77万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

凝縮剤の存在下、単分子の長鎖DNAはコイル状態と凝縮状態の間を一次相転移することが知られている。その理論的背景を考察し、統計熱力学的な議論を行うため、実験・理論の両面から研究を進め、次のような成果が得られた。・水溶液の比誘電率を80から170程度まで変化させ、DNAの一分子での凝縮過程を観察した。誘電率は、グリセリンなど、DNAと直接相互作用しない物質を水に溶解させて調整した。DNAの凝縮転移は、凝縮剤として4価のカチオンのスペルミンを用い、蛍光顕微鏡および透過型電子顕微鏡により観察した。その結果、一定の誘電率では、凝縮剤であるスペルミンの加える量を増やしていくにつれ、DNAは凝縮した。一方、スペルミン濃度を一定にした場合、比誘電率を上げていくと、DNAの凝縮は解けた。比誘電率とスペルミン濃度を変化させて観察することにより、DNAの凝縮転移が起こるスペルミン濃度は、比誘電率の指数関数になっていることが明らかになった。この結果から考察すると、凝縮転移の際、DNAの電荷の87〜88%が中和されていることになる。また、電子顕微鏡によって、比誘電率が大きくなると、DNAが凝縮した際のトロイド構造において、周辺部でDNA鎖が一部ほどけている状態も観察された。・DNAと正荷電を持つコアヒストン8量体との複合体は、クロマチンの基礎単位になっており、遺伝子発現を考える際にも重要である。そこで、DNAとさまざまなサイズの正荷電を持つナノパーティクルとの相互作用について実験的に研究した。蛍光顕微鏡ならびに透過型電子顕微鏡による観察によって、実際のクロマチン構造とよく似たrings-on-a-string構造が観察された。これは、クロマチンがどのように構成されているのかを統計熱力学的に考える上で重要な知見となるであろう。

In the presence of condensing agents, the long chain DNA of a single molecule undergoes a phase shift between the condensed state and the condensed state. The background of the theory is investigated, the discussion of statistical thermodynamics is carried out, the theory is studied, and the results are obtained The specific inductivity of aqueous solution varies from 80 to 170 degrees, and the condensation process of DNA molecules is observed. Inductance is regulated by direct interaction between DNA and water. DNA condensation is observed by optical microscopy and transmission electron microscopy. As a result, a certain induction rate is reduced, and the amount of DNA is reduced. For example, when the concentration of DNA is constant, the specific inductivity increases, and the condensation of DNA decreases. The specific inductivity and the concentration of DNA are observed in different ways, and the condensation and migration of DNA are observed in different ways, such as the concentration and the index of specific inductivity. The results show that the charge of DNA is 87 ~ 88% neutral when it is condensed and transferred. The electron microscope detects the state of DNA condensation, structure, and periphery. DNA is positively charged and the complex is important for the development of DNA molecules. The interaction between DNA and positive charge is studied. Optical micromirrors and transmission electronic micromirrors are used for observation and real-time rings-on-a-string structures. This is the first time in history that we've seen this phenomenon.