Real-World Modeling of Self-Emergent Active Cell

自生活性细胞的真实世界建模

基本信息

  • 批准号:
    17076007
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 55.87万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 2009
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The main purpose of this project is the construction of "non-equilibrium dissipative"artificial cell models. To achieve the purpose, the following three axes are employed; (i) in vitro re-construction of chromosome, (ii) transcriptional regulation by DNA coil-globule transition, (iii) cell-sized space specificity in the dynamics of membrane, DNA, and protein. The representative results in relation to the cell engineering are as follows; (i) Establishment of the methodology to entrap bio-polymers and substrates in a cell-sized model system. (ii) Unraveling of the scenario on the higher-order structural transition of chromatin. (iii) Invention of the technique of noninvasive and noncontact manipulation of bio-macromolecules by laser. Main results on basic science are; (i) Clear experimental representation on the confined effect of cell-sized space was demonstrated. For example, actin exhibits the two-step transition in a confined space, whereas it shows single step transduction in bulk phase. (ii) Clear evidence was shown on the cross-talk between membrane fluidity and the bulk viscosity.
本计画的主要目的是建构“非平衡耗散”人工细胞模型。为了实现这一目的,采用了以下三个轴:(i)染色体的体外重建,(ii)通过DNA卷曲-小球转换的转录调控,(iii)膜,DNA和蛋白质动力学中的细胞大小空间特异性。与细胞工程相关的代表性结果如下:(i)在细胞大小的模型系统中捕获生物聚合物和底物的方法的建立。(ii)染色质高级结构转变的研究进展。(iii)发明了激光对生物大分子的非侵入性和非接触性操作技术。在基础科学方面的主要研究结果有:(1)明确了细胞大小空间的限制效应的实验表征。例如,肌动蛋白在有限空间中表现出两步转变,而在体相中表现出单步转导。(ii)在膜流动性和体积粘度之间的串扰上显示出明确的证据。

项目成果

期刊论文数量(90)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Modeling of living cell: Autonomous motion, micro-reactor and response to the environment
活细胞建模:自主运动、微反应器和对环境的响应
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    T.Fukuda;M.Nakajima;M.R.Ahmad;Y.Shen;M.Kojima;伊藤敏幸;K. Yoshikawa
  • 通讯作者:
    K. Yoshikawa
ゲル状相生成に伴う油滴のbleb形成
与凝胶相形成相关的油滴气泡形成
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西部達矢;井上康介;住野豊
  • 通讯作者:
    住野豊
Bundle Formation in Crowded Environment with Giant DNA and F-Actin inside a Micro-Meter Scale Closed-Space
微米级封闭空间内巨型 DNA 和 F-肌动蛋白在拥挤环境中形成束
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M. Negishi;T. Sakaue;K. Takiauchi;and K. Yoshikawa
  • 通讯作者:
    and K. Yoshikawa
Lively dynamic pattern formation in an active liquid film
在活性液膜中形成生动的动态图案
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    陳永軍;長峯祐子、吉川研
  • 通讯作者:
    長峯祐子、吉川研
細胞サイズリン脂質膜空間でのGiantDNAとF-acitnのクロストーク
细胞大小的磷脂膜空间中 GiantDNA 和 F-actin 之间的串扰
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Adachi M;Nonaka S;Katada A;Arakawa T;Ota R;Harada H;Takakusaki K;Harabuchi Y;根岸真紀子
  • 通讯作者:
    根岸真紀子
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吉川 研一其他文献

パリティ: 細胞の自己組織化"に物理の視点から迫る
Parity:从物理角度探讨“细胞自组织”
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉川 研一;岩城 貴史
  • 通讯作者:
    岩城 貴史
局所誘電場におけるミクロ相分離液滴の動的界面不安定性
局域介电场中微相分离液滴的动态界面不稳定性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    貞包 浩一朗;瀬戸 秀紀;北畑 裕之;吉川 研一
  • 通讯作者:
    吉川 研一
「仮名垣熊太郎の新居披露書画会と暁斎」
《金崎熊太郎新居书画会暨共斋》
自己創生し規則配列する水/水相分離液滴:DNAや細胞の自発的取り込み
自生成且规则排列的水/水相分离液滴:DNA和细胞的自发摄取
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    庄野 真由;伊藤 立樹;藤田 ふみか;作田 浩輝;塩井 章久;吉川 研一
  • 通讯作者:
    吉川 研一
塩析効果によって引き起こされるリン脂質積層膜のラメラーラメラ相分離
盐析效应引起的磷脂叠层膜层状相分离
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    菱田 真史;瀬戸 秀紀;吉川 研一
  • 通讯作者:
    吉川 研一

吉川 研一的其他文献

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Real-world modeling of life: From DNA to Organoid
真实世界的生命建模:从 DNA 到类器官
  • 批准号:
    20H01877
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 55.87万
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ミクロ環境場における単分子ゲノムDNAの高次構造相
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    16041225
  • 财政年份:
    2004
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    $ 55.87万
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DNAの折り畳み相転移と遺伝子群の発現制御
DNA折叠相变与基因表达调控
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    15014218
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 55.87万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
単一荷電高分子鎖の折り畳み転移の統計熱力学
单电荷聚合物链折叠转变的统计热力学
  • 批准号:
    03F03200
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 55.87万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
単一高分子鎖の折り畳み転移の統計熱力学
单聚合物链折叠转变的统计热力学
  • 批准号:
    03F00200
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 55.87万
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
単一荷電子分子鎖の高次構造相転移に関する研究
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  • 批准号:
    99F00232
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 55.87万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

人工細胞モデル構築のための基盤技術としての無細胞タンパク質合成システムの構築
无细胞蛋白质合成系统的构建作为构建人工细胞模型的基础技术
  • 批准号:
    20034009
  • 财政年份:
    2008
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    $ 55.87万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
油中水滴法で作成した分子モーター封入リポソームによる運動性人工細胞モデルの構築
使用油包水法创建的分子马达封装脂质体构建运动人工细胞模型
  • 批准号:
    20034024
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 55.87万
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機能性膜を自動生成する人工細胞モデルの構成と評価
自动生成功能膜的人工细胞模型的构建和评估
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    2008
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人工細胞モデル構築のための膜蛋白質複合システム機能の再構成
重建膜蛋白复合体系统功能以构建人工细胞模型
  • 批准号:
    20034029
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    2008
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    $ 55.87万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
人工細胞モデル構築のためのRNA転写後修飾複合体装置の試験管内再構成
用于构建人工细胞模型的RNA转录后修饰复杂装置的体外重建
  • 批准号:
    18048032
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 55.87万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
光触媒反応による生体分子損傷機構の人工細胞モデルを用いた解明
使用人工细胞模型阐明光催化反应引起的生物分子损伤的机制
  • 批准号:
    17029029
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 55.87万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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知道了