シトクロムcの構造形成と熱力学的安定性の関係
细胞色素c的结构形成与热力学稳定性的关系
基本信息
- 批准号:16041232
- 负责人:
- 金额:$ 4.86万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2004
- 资助国家:日本
- 起止时间:2004 至 2005
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本年度の計画を実行し,以下の成果を得た。1.高温性細菌Hydrogenophilus thermoluteolus由来のシトクロムc_<552>の安定性と構造解析:52℃に生育する標題菌のシトクロムc_<552>(PH)の安定性を測定し,X線結晶解析により構造面からPHの安定性の機構を明らかにした。具体的には,まずPHの遺伝子をクローン化し,大腸菌での発現,2.1Åの分解能でのX線結晶解析に成功した。CDスペクトルを指標にした変性実験から,PHの安定性は,常温菌Pseudomonas aeruginosa(最適生育温度37℃)のシトクロムc_<551>(PA)よりも高く,好熱菌Hydrogenobacter thermophilus(同72℃)由来のシトクロムc_<552>(HT)よりも低いことを明らかにした。2.超耐熱性シトクロムcの予期せぬ大腸菌での構造形成:超好熱性細菌Aquifrex aeolicusのシトクロムc_<555>(AA)遺伝子を大腸菌に導入すると,シトクロムcの成熟化に必要とされる因子がない状態でも,ホロ型蛋白質として発現することを見出した。一般的に,シトクロムcの構造的な特徴は,Cys-X-X-Cys-His配列が保存されていること,この2つのCysに活性中心であるヘムが共有結合していること,である。グラム陰性菌において,ポリペプチド鎖とヘムはペリプラズムで結合する。結合に際して,チオール・ジスルフィド酸化還元酵素(Dsb蛋白質)がCys残基側鎖の酸化還元状態を制御している。本研究では,AAがdsb欠損大腸菌株において野生株以上に発現し,さらにヘムが結合するCysを2つともAlaに置換してもヘムを保持することを示した。他のシトクロムcには見られないこのような性質は,AAがアポ型状態でも遊離のヘムを取り込むことができる構造を形成しているためと考えている。
The plan for the year was implemented and the following results were achieved. 1. Stability <552>and structural analysis of the origin of thermophilic bacterium Hydrogenophilus thermoluteolus: Stability of the thermophilic bacterium Hydrogenophilus thermoluteolus c (PH) at 52℃ <552>was determined. X-ray crystallographic analysis revealed the structural plane and mechanism of PH stability. Specifically, the PH gene was detected by PCR, the Escherichia coli was detected, and the X-ray crystallization analysis of 2.1 μ g of decomposition energy was successfully performed. The stability of pH is different. Pseudomonas aerogenosa (optimum growth temperature: 37℃) is higher than C_<551>(PA). Hydrogenbacter thermophilus(same as 72℃) is lower than C_<552>(HT). 2. The structure formation of E. coli: The superthermophilic bacterium Aquifrex aeolicus is a member of the C_<555>(AA) gene family. The factors necessary for maturation of C_ (AA) are introduced into E. coli. In general, the structural characteristics of Cys-X-X-Cys-His are preserved, and the active center of Cys is preserved. When it comes to negative bacteria, the selection button lock and the selection button are combined. When binding, the enzyme (Dsb protein) controls the acidification of Cys residues. In this study,AA and dsb deficient E. coli strains were found above wild strains, and the results showed that the combination of Cys and Ala was maintained. The structure of the structure is formed in the state of AA.
项目成果
期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Five amino acid residues responsible for the high stability of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 -: Reciprocal mutation analysis
- DOI:10.1074/jbc.m412392200
- 发表时间:2005-02-18
- 期刊:
- 影响因子:4.8
- 作者:Oikawa, K;Nakamura, S;Sambongi, Y
- 通讯作者:Sambongi, Y
Unexpected and elevated production of Aquifex aeolicus cytochrome c_<555> in Escherichia coli cells lacking disulfide oxidoreductases.
在缺乏二硫键氧化还原酶的大肠杆菌细胞中,Aquifex aeolicus 细胞色素 c_<555> 的产量意外升高。
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kojima;N.
- 通讯作者:N.
Cloning, expression, crystallization and preliminary X-raycharacterization of cytochrome c_552 from a moderate thermophilic bacterium, Hydrogenophilus thermoluteolus
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- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:三幣容子;他;Shin-ichi Ichiki et al.
- 通讯作者:Shin-ichi Ichiki et al.
Control of the Redox Potential of Pseudomonas aeruginosa Cytochrome c_<551> through the Fe-Met Coordination Bond Strength and pKa ofa Buried Heme Propionic Acid Side Chain
通过 Fe-Met 配位键强度和埋藏血红素丙酸侧链的 pKa 控制铜绿假单胞菌细胞色素 c_<551> 的氧化还原电位
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S.J.Takayama;S.Mikami;N.Terui;H.Mita;J.Hasegawa;Y.Sambongi;Y.Yamamoto
- 通讯作者:Y.Yamamoto
Why isn't 'standard' heme good enough for c-type and d1-type cytochromes?
- DOI:10.1039/b508139b
- 发表时间:2005-01-01
- 期刊:
- 影响因子:4
- 作者:Allen, JWA;Barker, PD;Ferguson, SJ
- 通讯作者:Ferguson, SJ
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