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シトクロムcの構造形成と熱力学的安定性の関係

シトクロムcの構造形成と熱力学的安定性の関係
细胞色素c的结构形成与热力学稳定性的关系
批准号:
16041232
负责人:
三本木 至宏
金额:
$4.86万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005

项目摘要

项目成果

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翻译
本年度の計画を実行し,以下の成果を得た。1.高温性細菌Hydrogenophilus thermoluteolus由来のシトクロムc_<552>の安定性と構造解析:52℃に生育する標題菌のシトクロムc_<552>(PH)の安定性を測定し,X線結晶解析により構造面からPHの安定性の機構を明らかにした。具体的には,まずPHの遺伝子をクローン化し,大腸菌での発現,2.1Åの分解能でのX線結晶解析に成功した。CDスペクトルを指標にした変性実験から,PHの安定性は,常温菌Pseudomonas aeruginosa(最適生育温度37℃)のシトクロムc_<551>(PA)よりも高く,好熱菌Hydrogenobacter thermophilus(同72℃)由来のシトクロムc_<552>(HT)よりも低いことを明らかにした。2.超耐熱性シトクロムcの予期せぬ大腸菌での構造形成:超好熱性細菌Aquifrex aeolicusのシトクロムc_<555>(AA)遺伝子を大腸菌に導入すると,シトクロムcの成熟化に必要とされる因子がない状態でも,ホロ型蛋白質として発現することを見出した。一般的に,シトクロムcの構造的な特徴は,Cys-X-X-Cys-His配列が保存されていること,この2つのCysに活性中心であるヘムが共有結合していること,である。グラム陰性菌において,ポリペプチド鎖とヘムはペリプラズムで結合する。結合に際して,チオール・ジスルフィド酸化還元酵素(Dsb蛋白質)がCys残基側鎖の酸化還元状態を制御している。本研究では,AAがdsb欠損大腸菌株において野生株以上に発現し,さらにヘムが結合するCysを2つともAlaに置換してもヘムを保持することを示した。他のシトクロムcには見られないこのような性質は,AAがアポ型状態でも遊離のヘムを取り込むことができる構造を形成しているためと考えている。
英文摘要
本年度の計画を実行し,以下の成果を得た。1.高温性細菌Hydrogenophilus thermoluteolus由来のシトクロムc_<552>の安定性と構造解析:52℃に生育する標題菌のシトクロムc_<552>(PH)の安定性を測定し,X線結晶解析により構造面からPHの安定性の機構を明らかにした。具体的には,まずPHの遺伝子をクローン化し,大腸菌での発現,2.1Åの分解能でのX線結晶解析に成功した。CDスペクトルを指標にした変性実験から,PHの安定性は,常温菌Pseudomonas aeruginosa(最適生育温度37℃)のシトクロムc_<551>(PA)よりも高く,好熱菌Hydrogenobacter thermophilus(同72℃)由来のシトクロムc_<552>(HT)よりも低いことを明らかにした。2.超耐熱性シトクロムcの予期せぬ大腸菌での構造形成:超好熱性細菌Aquifrex aeolicusのシトクロムc_<555>(AA)遺伝子を大腸菌に導入すると,シトクロムcの成熟化に必要とされる因子がない状態でも,ホロ型蛋白質として発現することを見出した。一般的に,シトクロムcの構造的な特徴は,Cys-X-X-Cys-His配列が保存されていること,この2つのCysに活性中心であるヘムが共有結合していること,である。グラム陰性菌において,ポリペプチド鎖とヘムはペリプラズムで結合する。結合に際して,チオール・ジスルフィド酸化還元酵素(Dsb蛋白質)がCys残基側鎖の酸化還元状態を制御している。本研究では,AAがdsb欠損大腸菌株において野生株以上に発現し,さらにヘムが結合するCysを2つともAlaに置換してもヘムを保持することを示した。他のシトクロムcには見られないこのような性質は,AAがアポ型状態でも遊離のヘムを取り込むことができる構造を形成しているためと考えている。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1074/jbc.m412392200
发表时间: 2005-02-18
期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子: 4.8
作者: [Oikawa, K, Nakamura, S, Sambongi, Y]
通讯作者: Sambongi, Y
Unexpected and elevated production of Aquifex aeolicus cytochrome c_<555> in Escherichia coli cells lacking disulfide oxidoreductases.
在缺乏二硫键氧化还原酶的大肠杆菌细胞中,Aquifex aeolicus 细胞色素 c_<555> 的产量意外升高。
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Biosci.Biotech.Biochem. 69
影响因子: --
作者: [Kojima, N.]
通讯作者: N.
Control of the Redox Potential of Pseudomonas aeruginosa Cytochrome c_<551> through the Fe-Met Coordination Bond Strength and pKa ofa Buried Heme Propionic Acid Side Chain
通过 Fe-Met 配位键强度和埋藏血红素丙酸侧链的 pKa 控制铜绿假单胞菌细胞色素 c_<551> 的氧化还原电位
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Biochemistry 44
影响因子: --
作者: [S.J.Takayama, S.Mikami, N.Terui, H.Mita, J.Hasegawa, Y.Sambongi, Y.Yamamoto]
通讯作者: Y.Yamamoto
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Acta Cryst. F61
影响因子: --
作者: [三幣容子, 他, Shin-ichi Ichiki et al.]
通讯作者: Shin-ichi Ichiki et al.
6
    蛋白質の塩耐性・最適塩濃度を決定する構造要因の解明
    • 批准号:
      23K26831
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $8.57万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      三本木 至宏
    • 依托单位:
    Studies on structural factors that determine salt tolerance and most effective concentration for proteins
    • 批准号:
      23H02138
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.98万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      三本木 至宏
    • 依托单位:
    Genome and protein science, and environmental biology of high temperature adaptation of hot spring frog
    • 批准号:
      23K18154
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      三本木 至宏
    • 依托单位:
    耐熱性ATP合成酵素の回転モーターとしての特性評価
    • 批准号:
      16658139
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.11万
    • 财政年份:
      2004
    • 负责人:
      三本木 至宏
    • 依托单位:
    海外基金