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巨大RNA-タンパク質複合体vaultの構造に基づいた機能解明

基于巨型RNA-蛋白质复合体穹窿结构的功能阐明

基本信息

批准号：
16048216
负责人：
田中秀明
金额：
$ 2.3万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16048216/
关键词：
vault RNA-蛋白質複合体 X線結晶構造解析核膜孔複合体

项目摘要

1986年に米国UCLAのRomeらのグループによってラット肝臓より単離されたvaultは3種類の蛋白質と1種類のRNAによって構成されており、分子量約13MDa、サイズが約34×60nmでウィルスを除けば今日までに報告されている中では最大のRNA-蛋白質複合体である。ほとんどの粒子は細胞質内に存在し、全体量の5%程度が核膜孔複合体(NPC)とその周辺に局在することは知られているが、発見から18年以上を経た現在もなお詳細な機能は明らかになっていない。したがって、我々はvaultを構成成分にばらすことなく生体内に存在するそのままの状態で結晶化し、X線結晶構造解析によって粒子全体の立体構造を原子レベルで解明することにより、分子の形からvaultの本質的な機能解明に迫ることを目的として研究を行った。出発材料としては量も良く研究されているラット肝臓を用いた。我々はすでにポリエチレングリコールを沈澱剤として用いた結晶化条件で9Å分解能の反射を示す正方晶系の結晶を得ていたが、条件をさらに最適化することで空間群P1、格子定数α=440.9Å、b=600.8Å、c=635.7Å、α=67.1°、β=77.7°、γ=70.0°の新しいタイプの結晶を得た。この結晶は放射光施設SPring-8の生体超分子専用ビームラインBL44XUにおいて最高で4.5Å分解能の反射を示す良質の結晶であった。したがって、現在はこの結晶を用いて構造解析を進めており、すでに10Å分解能のNativeデータとMIRで位相決定を行うために必要な重金属誘導体の回折強度データは得ている。

In 1986, the UCLA of the United States was isolated from vault protein 3 in the United States. The molecular weight of RNA protein was about 13MDa, and the molecular weight was about 34 × 60nm. In this report, the largest RNA- protein complex was found in today's report. The nuclear pore complex (NPC) has been known to exist in the cell for more than 18 years, and the whole body has been around for more than 18 years. In this paper, the results show that there are significant differences in the composition and composition of vault in vivo. The results of crystallization, X-ray analysis and X-ray analysis are used to analyze the whole body of particles. The results show that the whole body of particles can be used to understand the accuracy of the computer system, the molecular structure of the system, the computer of the computer, the computer of the computer, and the computer of the computer. Out of the material, the quantity, the quality, the research, the liver, the liver. We use the crystallization condition 9 to decompose the energy to show that the square crystal system has been crystallized, and the conditional temperature has been obtained. The space group P1, lattice constant α = 440.9, barium 600.8, cis 635.7, α = 67.1 °, β = 77.7 °, γ = 70.0 °have been obtained. The results show that the photolysis of SPring-8 living supramolecular materials by photoluminescence shows that the decomposition energy of the highest decomposition energy of 4.5A in the photoluminescence of SPring-8 biological supramolecular devices shows that the structure of the supermolecules is good. The results show that the mechanical properties of heavy metals can be determined by the phase analysis of heavy metals, the thermal analysis and the decomposition of temperature 10 can determine the necessary heavy metal recovery strength by Native phase analysis.