膜に局在する受容体タイロシンキナーゼの構造生物学的研究

膜定位受体酪氨酸激酶的结构生物学研究

基本信息

  • 批准号:
    16048226
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.24万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

レグインスリンは、ダイズ由来分子量4kDaの生理活性ペプチドであり、その受容体タンパク質であるLBPに特異的に結合する。LBPは、分子量170kDaのタンパク質であり、レグインスリンの結合によって活性が促進する新奇な受容体様タイロシンキナーゼである。LBPは植物の原形質膜や細胞壁に局在するため、細胞内外の信号変換を行い、成長や分化に関する情報伝達に関与すると考えられている。すでにLBPの結晶化に成功しているが、結晶性の再現性が悪く、同型な結晶を恒常的に得ることが困難であった。今回精製条件を再検討することで、同型な結晶を再現性良く得ることに成功し、かつX線回折の分解能が飛躍的に向上した。LBPはダイズ種子から精製し、その過程において硫安分画を行う。今回、硫安分画の行程を省き、代わりにイオン交換カラムを用いたことで、収量および純度を上げることができた。得られた試料で結晶化を行ったところ、これまでと同様な条件で結晶を得ることができた。現在得られている結晶は、前回までの結晶よりもサイズは小さい。しかし、PF BL5においてX線回折実験を行ったところ、2.6Å分解能までの回折強度データを収集することに成功した。LBPはシステインを12個有するため、水銀誘導体結晶の調製が可能であると考えた。しかし、種々の水銀化合物を用いて水銀誘導体結晶の調製を試みたが、構造解析に有効な誘導体結晶を得ることができなかった。この結果から、LBPのシステインは全てジスルフィド結合に関与しているか、分子内部に存在しているのではないかと予想できる。今後は、網羅的に重原子誘導体結晶を調製し、構造解析を進めていく。また、LBPの結晶は回折方向に異方性があり、結晶の縦方向では、現在2.0Å分解能までの回折点を確認できる。したがって、結晶化条件を至適化することで、高分解能結晶構造解析可能になると考えている。
The protein is derived from a physiologically active protein with a molecular weight of 4 kDa and is specifically bound to LBP by a receptor. LBP has a molecular weight of 170kDa, and its binding activity promotes novel receptor properties. LBP is responsible for the regulation of protoplasmic cell wall, signal transduction in and out of cells, and information transmission in growth and differentiation. The crystallization of LBP is successful, the reproducibility of crystallization is difficult, and the crystallization of isotype is difficult. This time, the refining conditions are discussed again. The reproducibility of isotype crystallization is good. The success of X-ray folding and decomposition is improved. LBP is a process of seed refinement. This time, the process of sulfur painting is saved, and the exchange rate is increased. The sample was crystallized under the same conditions. Now you have to go back to the crystal, and then you have to go back to the crystal. PF BL5 X-ray reflection test results were successful with 2.6 mm resolution and reflection strength test results. LBP has 12 different types of crystals. It is possible to use various mercury compounds to try to modulate mercury-induced crystals and obtain effective mercury-induced crystals for structural analysis. As a result, LBP's structure is completely different from that of the molecular structure. In the future, the structure analysis of heavy atom induced crystals will be further developed. LBP crystal direction is different, crystal direction is different, now 2.0 ° decomposition energy is different. The crystallization conditions are suitable for the analysis of high decomposition energy crystal structures.

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Eco0109I and its complex with DNA.
Eco0109I 及其与 DNA 的复合物的结晶和初步 X 射线晶体分析。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Imasaki;T.;Hashimoto;H.;Shimizu;T.;Kato;M.;Tsuda;J.;Kita;K.;Sato;M.
  • 通讯作者:
    M.
Structural basis for Ca2+-induced activation of human PAD4
(略称)PAD IV阻害剤
(简称) PAD IV 抑制剂
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Crystal structure of type II restriction endonuclease Eco0109I and its complex with congnate DNA.
II 型限制性内切酶 Eco0109I 及其与同源 DNA 复合物的晶体结构。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hashimoto;H.;Shimizu;T.;Imasaki;T.;Kato;M.;Shichijo;N.;Kita;K.;Sato;M.
  • 通讯作者:
    M.
(略称)PAD IV複合体
(缩写) PAD IV 复合体
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
    Sotaro Kikuchi
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    増田雄司;鈴木美紀;河合秀彦;菱木麻美;橋本 博;益谷央豪;神谷研二;丸山勇気・佐川志朗・田和康太・内藤和明
  • 通讯作者:
    丸山勇気・佐川志朗・田和康太・内藤和明
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    小西 佳史郎;横山 英志;原 幸大;石川 吉伸;松井 郁夫;Patrick Forterre;橋本 博;西山賢一;Atsushi Nakagawa
  • 通讯作者:
    Atsushi Nakagawa
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    2012
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    0
  • 作者:
    菊池壮太郎;菱木麻美;Chandanamali Punchihewa;藤井直明;佐藤衛;橋本博;菊池 壮太郎;橋本 博;菊池 壮太郎
  • 通讯作者:
    菊池 壮太郎
ギ酸誘導体の一酸化炭素生成機構およびこれを用いる実用的有機合成反応
甲酸衍生物的一氧化碳生产机理及使用其的实际有机合成反应
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小西 英之;上田 剛;松原 美香;森 敬介;石川 吉伸;橋本 博;常盤 広明;眞鍋 敬
  • 通讯作者:
    眞鍋 敬

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知道了