レグインスリン結合タンパク質のX線結晶構造解析

豆胰岛素结合蛋白的X射线晶体结构分析

• 批准号: 19036025
• 负责人: 橋本 博
• 金额: $ 4.22万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19036025/
• 关键词: X線結晶構造解析; 植物; ダイズ; ニンジン; 防御応答; 情報伝達

レグインスリンはダイズの種子で存在が確認された37アミノ酸残基からなる生理活性ペプチドであり、その受容体タンパク質であるレグインスリン結合タンパク質(LBP)に特異的に結合する。ダイズLBPはチロシンをリン酸化する活性を有し、この活性はレグインスリンの結合によって促進される。また、レグインスリンによってニンジンカルスの成長が促進されることが報告されている。レグインスリン/LBP系の生理機能の詳細は解明されていないが、LBPは植物の原形質膜や細胞壁、細胞外に存在が確認されており、細胞内外の何らかの信号変換や病原菌に対する防御応答に関与すると考えられている。本研究では、ダイズおよびニンジン由来のLBPを研究対象とする。ダイズおよびニンジンLBPの立体構造をX線結晶構造解析によって明らかとし、細胞壁や原形質膜近傍におけるLBPのタンパク質間相互作用を構造生物学的に解明することを目指す。ダイズLBPはダイズ種子から精製し、ニンジンLBPはニンジン細胞の培養液から精製した。ニンジンおよびダイズLBPの結晶化に成功し、ニンジンLBPの結晶構造は重原子同型置換法を利用して決定することに成功した。重原子データの収集はPF-ARNW12Aで行った。ネイティブデータの収集はSPring8 BL41XUを利用し、最終的には0.95Åという超高分解能で構造精密化を行った。ダイズLBPとニンジンLBPのアミノ酸配列の相同性はおよそ30%である。ダイズLBPの結晶構造は、ニンジンLBPをモデル分子とした分子置換法を用いて1.9Å分解能で決定した。

There is a combination for confirming the physiological activity of the acid residue, the physiological activity, the recipient, the recipient, the In order to improve the performance of acidizing, the effect of LBP on acidification was studied. It is necessary to promote the growth of government reports and reports on the basis of economic growth. The Department of Physiology

项目成果

Structural biology of a nuclear import of proteins by transportin 1

转运蛋白 1 向核输入蛋白质的结构生物学

• 发表时间: 2008
• 作者: M. Sato;T. Imasaki;T. Shimizu;H. Hashimoto;H. Ishida;D. Kamei M. Yamada
• 通讯作者: D. Kamei M. Yamada

Structural Basis for Novel Interactions between Human Translesion Synthesis Polymerases and Proliferating Cell Nuclear Antigen

• DOI: 10.1074/jbc.m809745200
• 发表时间: 2009-04-17
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Hishiki, Asami;Hashimoto, Hiroshi;Sato, Mamoru
• 通讯作者: Sato, Mamoru

TLS ポリメラーゼと PCNA の相互作用に関する構造生物学的研究

TLS聚合酶与PCNA相互作用的结构生物学研究

• 发表时间: 2007
• 作者: 菱木 麻美;橋本 博;亀井 慶二郎;花房 朋;大橋 英治;清水 敏之;大森 治夫;佐藤 衛
• 通讯作者: 佐藤 衛

Dynamics of Eco0109I studied by small-angle X-ray scattering and molecular dynamics simulation

通过小角X射线散射和分子动力学模拟研究Eco0109I的动力学

• 发表时间: 2008
• 作者: T. Oroguchi;H. Hashimoto;T. Shimizu;M. Sato;M. Ikeguchi
• 通讯作者: M. Ikeguchi

The crystal structure of plant-specific calcium-binding protein AtCBL2 in complex with the regulatory domain of AtCIPK14

• DOI: 10.1016/j.jmb.2008.01.006
• 发表时间: 2008-03-14
• 期刊: JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.6
• 作者: Akaboshi, Mayuko;Hashimoto, Hiroshi;Shimizu, Toshiyuki
• 通讯作者: Shimizu, Toshiyuki