植物ペプチドが制御する新奇なチロシンキナーゼの構造研究
植物肽调控的新型酪氨酸激酶的结构研究
基本信息
- 批准号:17048023
- 负责人:
- 金额:$ 3.71万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2005
- 资助国家:日本
- 起止时间:2005 至 2006
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
レグインスリン結合タンパク質(LBP)は分子量約170kDaのタンパク質で、チロシンリン酸化活性を有する。この活性は、ダイズに存在するホルモン様ペプチドであるレグインスリンの結合によって促進される。LBPは植物の原形質膜や細胞壁に局在するため、細胞内外の何らかの信号変換を行い、植物の成長や分化に関する情報伝達に関与していると考えられている。レグインスリン/LBPの生理機能の詳細は解明されていないが、植物の成長や分化に関する情報伝達を担っていると考えられている。本研究では、レグインスリン/LBPの機能解明を目指し、LBP三次元構造を、X線結晶構造解析法によって決定することを目的とする。今年度は、1)ネイティブデータの収集、2)重原子誘導体の調製、3)結晶化条件の再検討を行った。1)ネイティブ結晶に関して、精製条件、クライオプロテクタントの条件を改良し、2.45Å分解能の回折データを得ることに成功した。2)様々な重原子化合物を用いて重原子誘導体の調製を進めてきたが、構造解析可能な電子密度は得られていない。しかし、ヨウ素誘導体は有意なパターソン図を示し、有望であると考えられる。3)結晶化条件の再検討を行ったところ、これまでとは異なる結晶系を得ることに成功した。得られた結晶は空間群P21に属し、格子定数はa=88.9,b=139.0,c=164.2,β=90.9°であった。この結晶を用いて、X線回折実験を行ったところ、2.10Å分解能という高分解能なネイティブデータを収集することに成功した。
The protein binding protein (LBP) has a molecular weight of about 170kDa and has a catalytic activity. The activity of this enzyme is promoted by the combination of enzyme and protein. LBP is related to the structure of protoplasma membrane and cell wall, the signal exchange between inside and outside cells, and the information transmission related to plant growth and differentiation. The physiological function of plant growth and differentiation is explained in detail. The purpose of this study is to clarify the function of LBP and determine the three-dimensional structure of LBP by X-ray crystallographic analysis. This year, 1) the collection of organic compounds, 2) the modulation of heavy atom inducers, 3) the re-evaluation of crystallization conditions. 1) The crystallization conditions, purification conditions, and decomposition energy were improved by 2.45%. 2) The modulation of heavy atom inducers in heavy atom compounds can be obtained by structural analysis. It's a good idea to have a good time, but it's a good idea. 3)Crystallization conditions are discussed again. Crystallization system is successful. The crystal space group P21 belongs to the lattice number a= 88.9, b = 139.0, c =164.2,β=90.9°. The crystallization process, X-ray reflection process, 2.10-degree decomposition process, high decomposition process, and high resolution process were successfully performed.
项目成果
期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of rat calcineurin B homologous protein 1
大鼠钙调神经磷酸酶 B 同源蛋白 1 的结晶和初步 X 射线晶体分析
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:TK.Mal;D.Liu;Y.Masutomi;L.Zheng;Y.Nakatani;T.Kokubo;M.Ikura;Naoe et al.;Naoe et al.
- 通讯作者:Naoe et al.
The first crystal structure of a family 31 carbohydrate-binding module with affinity to beta-1, 3-xylan.
具有 β-1, 3-木聚糖亲和力的家族 31 碳水化合物结合模块的第一个晶体结构。
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hashimoto;H.;Tamai;Y.;Okazaki;F.;Tamaru;Y.;Shimizu;T.;Araki;T.;Sato;M.
- 通讯作者:M.
Structural and biochemical characterization of a cyanobacterium circadian clock-modifier protein
- DOI:10.1074/jbc.m608148200
- 发表时间:2007-01-12
- 期刊:
- 影响因子:4.8
- 作者:Arita, Kyouhei;Hashimoto, Hiroshi;Shimizu, Toshiyuki
- 通讯作者:Shimizu, Toshiyuki
Structural characterization of calcineurin B homologous protein 1
- DOI:10.1074/jbc.m503390200
- 发表时间:2005-09-16
- 期刊:
- 影响因子:4.8
- 作者:Naoe, Y;Arita, K;Shimizu, T
- 通讯作者:Shimizu, T
Crystal structure of intein homing endonuclease II encoded in DNA polymerase gene from hyperthermophilic Archaeon Thermococcus kodakaraensis strain KOD1
- DOI:10.1002/prot.20858
- 发表时间:2006-05-15
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Matsumura, H;Takahashi, H;Kai, Y
- 通讯作者:Kai, Y
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
橋本 博其他文献
Structural basis of recruitment of DNA polymerase zeta by interaction between REV1 and REV7
REV1 和 REV7 之间相互作用招募 DNA 聚合酶 zeta 的结构基础
- DOI:
- 发表时间:
2012 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
菊池壮太郎;菱木麻美;Chandanamali Punchihewa;藤井直明;佐藤衛;橋本博;菊池 壮太郎;橋本 博;菊池 壮太郎;Sotaro Kikuchi;Sotaro Kikuchi - 通讯作者:
Sotaro Kikuchi
2014. 兵庫県豊岡市の42の水田における水生動物群集の類型化-環境保全型水田の生物はリッチか?
2014. 兵库县丰冈市42片稻田水生动物群落类型-环保稻田是否富含生物?
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
増田雄司;鈴木美紀;河合秀彦;菱木麻美;橋本 博;益谷央豪;神谷研二;丸山勇気・佐川志朗・田和康太・内藤和明 - 通讯作者:
丸山勇気・佐川志朗・田和康太・内藤和明
Structure determination of biological macromolecules using synchrotron radiation and X-ray free electron laser
利用同步辐射和X射线自由电子激光测定生物大分子的结构
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小西 佳史郎;横山 英志;原 幸大;石川 吉伸;松井 郁夫;Patrick Forterre;橋本 博;西山賢一;Atsushi Nakagawa - 通讯作者:
Atsushi Nakagawa
損傷乗り越えDNA合成に関わるREV1-REV7-REV3三者複合体の結晶構造解析
参与损伤克服 DNA 合成的 REV1-REV7-REV3 三元复合物的晶体结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2012 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
菊池壮太郎;菱木麻美;Chandanamali Punchihewa;藤井直明;佐藤衛;橋本博;菊池 壮太郎;橋本 博;菊池 壮太郎 - 通讯作者:
菊池 壮太郎
ギ酸誘導体の一酸化炭素生成機構およびこれを用いる実用的有機合成反応
甲酸衍生物的一氧化碳生产机理及使用其的实际有机合成反应
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小西 英之;上田 剛;松原 美香;森 敬介;石川 吉伸;橋本 博;常盤 広明;眞鍋 敬 - 通讯作者:
眞鍋 敬
橋本 博的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('橋本 博', 18)}}的其他基金
Structural basis for stimulation of DNA damage checkpoint by 9-1-1 interacting protein RHINO
9-1-1相互作用蛋白RHINO刺激DNA损伤检查点的结构基础
- 批准号:
23K05669 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
レグインスリン結合タンパク質のX線結晶構造解析
豆胰岛素结合蛋白的X射线晶体结构分析
- 批准号:
19036025 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ヒトDNAポリメラーゼζの損傷乗り越えDNA複製に関する構造研究
人类DNA聚合酶克服损伤的DNA复制的结构研究
- 批准号:
18770091 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
膜に局在する受容体タイロシンキナーゼの構造生物学的研究
膜定位受体酪氨酸激酶的结构生物学研究
- 批准号:
16048226 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ヒトDNAポリメラーゼκの損傷乗り越えDNA合成に関する構造生物学的研究
人类DNA聚合酶κ克服损伤的DNA合成的结构生物学研究
- 批准号:
14780515 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
耐熱性DNA複製・修復蛋白質の熱安定性に関する構造化学的研究
热稳定DNA复制/修复蛋白热稳定性的结构化学研究
- 批准号:
99J02271 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
膀胱内注入抗癌剤の組織内移行増強に関する研究
膀胱内注射抗癌药物增强组织迁移的研究
- 批准号:
03771019 - 财政年份:1991
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
抗BrdU抗体を用いた尿路悪性腫瘍の細胞動態の解析
抗BrdU抗体分析泌尿道恶性肿瘤细胞动力学
- 批准号:
62771158 - 财政年份:1987
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
キナーゼのリン酸化・脱リン酸化を介したシグナル伝達制御のNMR動的構造生物学
通过激酶磷酸化/去磷酸化控制信号转导的 NMR 动态结构生物学
- 批准号:
23K27310 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
構造生物学・物理化学・計算化学に基づくチロシンキナーゼ阻害剤剤選択性の解明
基于结构生物学、物理化学和计算化学阐明酪氨酸激酶抑制剂的选择性
- 批准号:
24K09762 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ミスマッチ修復を促進するクロマチンリモデラーの構造生物学的解明
促进错配修复的染色质重塑剂的结构生物学阐明
- 批准号:
24K09356 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
オートファジー脂質輸送システムの構造生物学的研究
自噬脂质转运系统的结构生物学研究
- 批准号:
24K09358 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
DNA複製におけるゲノム安定性維持機構の構造生物学的研究
DNA复制过程中基因组稳定性维持机制的结构生物学研究
- 批准号:
24K01966 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
クライオ電子顕微鏡による生体膜構造生物学
使用冷冻电子显微镜进行生物膜结构生物学
- 批准号:
23K27132 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
B型肝炎ウイルス細胞侵入機構とその制御に関する構造生物学研究
乙型肝炎病毒细胞侵袭机制及其调控的结构生物学研究
- 批准号:
23K27415 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
味覚受容体による「多対多」の化学物質認識メカニズムの構造生物学的究明
味觉受体“多对多”化学识别机制的结构生物学研究
- 批准号:
23K27117 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
薬物動態学や構造生物学に基づいた"真の尿毒症物質"の機能解析
基于药代动力学和结构生物学的“真尿毒症物质”功能分析
- 批准号:
24K18312 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
ユビキチンリガーゼが制御する病原菌感染と生体防御応答の構造生物学的解析
泛素连接酶调节的病原体感染和生物防御反应的结构生物学分析
- 批准号:
24K01968 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)














{{item.name}}会员




