メダカ近縁種のBACライブラリーの作成とメダカゲノム情報による物理地図作成
メダカ近縁種のBACライブラリーの作成とメダカゲノム情報による物理地図作成
批准号:
17018011
负责人:
成瀬 清
金额:
$3.84万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 --
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1.BACライブラリーの作成新潟大学で性転換により作成したXX雄と正常な雌を交配させX染色体のみをもつ稚魚を多数作成した。またこのようして作成したXX胚から培養細胞系を樹立した。これらをもちいて支援班の協力の下にX染色体のみを含むルソンメダカBACライブラリーの作成をおこなった。これらのクローンは現在132枚の384穴プレートに整列化され、東京大学及び新潟大学で保存されている。このうち384穴プレート96枚分のクローン(ゲノムカバー率で約5X相当)をもちいてPCRスクリーニング用の3次元PCRスーパープールの作成をおこなった。またルソンメダカX染色体とY染色体を比較するために性転換XY雌と正常雄(XY)を交配してYY個体を作成し、Y染色体のみをもつYY雄1個体からfosmidライブラリーの構築もおこなった(クローン数の推定ではゲノム10X相当)。2.ルソンメダカ及びハブスメダカ性決定領域の詳細な遺伝子地図作成ルソンメダカ性染色体地図の作成ではメダカでLG12上にマッピングされたESTマーカーをもちいてルソンメダカの詳細な性染色体地図を作成した。その結果ルソンメダカの性決定遺伝子はメダカゲノム上で換算すると約750kbpの範囲に存在することが明らかとなった。作成した3次元PCRスーパープールをもちいて当該領域のBACクローンのスクリーニングをおこなっている。3.他の近縁種における形決定機構の解明他の近縁種における性決定領域に関する研究ではインドメダカでの性決定領域が明らかとなった。インドメダカは他の単腕型染色体グループ(ジャワメダカ、ハブスメダカ)とは異なり、驚くことにXX-XY型の性決定機構を持っていた。またその性染色体はメダカのLG10とほぼ全染色体にわたって相同であった。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1016/j.ympev.2005.01.016
发表时间:
2005-08-01
期刊:
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION
影响因子:
4.1
作者:
[Takehana, Y, Naruse, K, Sakaizumi, M]
通讯作者:
Sakaizumi, M
Genetic linkage map of medaka with polymerase chain reaction length polymorphism
聚合酶链反应长度多态性青鳉遗传连锁图谱
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Gene 363
影响因子:
--
作者:
[Kimura T, Yoshida K, Shimada A, Jindo T, Sakaizumi M, Mitani H, Naruse K, Takeda H, Inoko H, Tamiya G, Shinya M.]
通讯作者:
Shinya M.
メダカ近縁種ゲノム基盤の整備とそれを用いた新規遺伝子機能獲得機構の解明
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批准号:20017026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.38万
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财政年份:2008
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
メダカ近縁種のゲノムライブラリーの作成とメダカゲノム情報による物理地図作成
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批准号:18017006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.12万
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财政年份:2006
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
PCR-RFLP多型をもちいたメダカ連鎖地図の作成と発現遺伝子のマッピング
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批准号:09780621
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
核DNAに基づくメダカ亜目魚類の系統に関する研究
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批准号:08740661
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
ミトコンドリアと核DNAに基づくメダカ亜目魚類の系統とその上位分類に関する研究
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批准号:07740657
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1995
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
ミトコンドリ3DNAをもちいたメダカ亜目魚類の系統とその上位分類に関する研究
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批准号:06740642
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
反復配例DNAをもちいたメダカ属魚類の系統分類に関する研究
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批准号:04854083
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
反復配列DNAをもちいたメガタ属魚類の系統分類に関する研究
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批准号:03854096
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:成瀬 清
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依托单位:
海外基金