メダカ近縁種ゲノム基盤の整備とそれを用いた新規遺伝子機能獲得機構の解明

青鳉近缘种基因组基础的制备及利用其获取新基因功能的机制的阐明

基本信息

  • 批准号:
    20017026
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 5.38万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2008 至 2009
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

インドメダカ性決定遺伝子の同定X染色体とY染色体を区別して作成した2種類のBACライブラリーとFosmidライブラリーをもちいてXおよびY染色体それぞれについて性決定領域を完全にカバーする物理地図を作成し、インドメダカ性決定領域の塩基配列を完全に決定することができた。インドメダカY染色体の性決定領域にはX染色体にはない特異的領域が存在することが明らかとなった。しかしその領域には逆転写酵素の一部と見られる塩基配列が反復配列として多く含まれるのみでインドメダカ性決定遺伝子の候補となるような配列を塩基配列のみから絞り込むことはできなかった。そこで現在は性決定領域に由来するBAC/FosmidクローンをXX個体に遺伝子導入することで雄への性転換能を有するクローンの同定を行っている。ハブスメダカ性染色体のFISHによる同定:ハブスメダカfosmidライブラリーから性連鎖マーカーがのっているクローンをコロニーハイブリダイゼーション法により単離し、染色体FISH法によってハブスメダカ性染色体を同定した。ハブスメダカZZ個体からの培養細胞系の樹立とBACライブラリーの作成:遺伝子タイピングによって同定したハブスメダカZZ個体(雄)より培養細胞系の樹立をおこなった。L-15培地+15%FBSをもちいて1個体より初代培養細胞を作成し、それを継代することで培養細胞系を樹立することができたことから国立遺伝学研究所比較ゲノム解析研究室(支援班)に持参し、アガロースプラグの作成をおこなった。現在はBACライブラリーの作成をおこなっている。セレベスメダカ及びジャワメダカZZ個体からの培養細胞系の樹立とBACライブラリーの作成セレベスメダカ及びジャワメダカZZ個体よりそれぞれ初代培養細胞を樹立した後、培養細胞を国立遺伝学研究所比較ゲノム解析研究室に持参し、アガロースプラグの作成をおこない、BACライブラリーを作成した。完成したBACライブラリーをもちいて3DPCRによるスクリーニングシステムを完成した。
イ ン ド メ ダ カ traces of sex determination 伝 の son be X chromosome と Y chromosome を difference し て made し た 2 kinds の BAC ラ イ ブ ラ リ ー と Fosmid ラ イ ブ ラ リ ー を も ち い て X お よ び Y chromosome そ れ ぞ れ に つ い て を sex decided to field completely に カ バ ー す る physically 図 を し, consummate イ ン ド メ ダ カ sex decided to field の を salt base distribution Completely に determines する とがで とがで た. イ ン ド メ ダ カ Y chromosome の sex decided to field に は X chromosome に は な い specific domains exist が す る こ と が Ming ら か と な っ た. し か し そ の field に は inverse planning write enzyme の see a と ら れ る salt base with column が repeatedly with column と し て く more contain ま れ る の み で イ ン ド メ ダ カ traces of sex determination 伝 の son alternate と な る よ う な match column を salt base with column の み か ら ground り 込 む こ と は で き な か っ た. そ こ で は sex has now decided to field に origin す る BAC/Fosmid ク ロ ー ン を XX individual に heritage 伝 son import す る こ と で male へ の sex change planning can have す を る ク ロ ー ン の with fixed line を っ て い る. ハ ブ ス メ ダ カ sex chromosome の FISH に よ る with: ハ ブ ス メ ダ カ fosmid ラ イ ブ ラ リ ー か ら sex linkage マ ー カ ー が の っ て い る ク ロ ー ン を コ ロ ニ ー ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン method に よ り 単 from し, chromosome FISH に よ っ て ハ ブ ス メ ダ カ sex chromosome を be し た. ハ ブ ス メ ダ カ ZZ individual か ら の culture cell lines の set と BAC ラ イ ブ ラ リ ー の is made: heritage 伝 son タ イ ピ ン グ に よ っ て with fixed し た ハ ブ ス メ ダ カ ZZ individuals (male) よ り culture cell lines の set を お こ な っ た. L - 15 petty + 15% FBS を も ち い て 1 individual よ り original culture cell を し, consummate そ れ を 継 generation す る こ と で culture cell lines を set す る こ と が で き た こ と か ら national heritage 伝 institute for comparative ゲ ノ ム analytical laboratory class (support) に hold し refs, ア ガ ロ ー ス プ ラ グ の made を お こ な っ た. Now ラ BACラ ブラリ ブラリ ブラリ る る is made as をお なって なって る る. セ レ ベ ス メ ダ カ and び ジ ャ ワ メ ダ カ ZZ individual か ら の culture cell lines の set と BAC ラ イ ブ ラ リ ー の made セ レ ベ ス メ ダ カ and び ジ ャ ワ メ ダ カ ZZ individual よ り そ れ ぞ れ original culture cell を set し た after, national heritage of culture cell を 伝 institute for comparative ゲ ノ ム analytical laboratory に hold し refs, ア ガ ロ ー ス プ ラ グ の is made Youdaoplaceholder0 た な な をお and BACラ ブラリ ブラリ and を are made as た. Complete し た BAC ラ イ ブ ラ リ ー を も ち い て 3 DPCR に よ る ス ク リ ー ニ ン グ シ ス テ ム を complete し た.

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Sox3: A transcription factor for Cyp19 expression in the frog Rana rugosa
  • DOI:
    10.1016/j.gene.2009.05.011
  • 发表时间:
    2009-09-15
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Oshima, Yuki;Naruse, Kiyoshi;Nakamura, Masahisa
  • 通讯作者:
    Nakamura, Masahisa
ナショナルバイオリソースプロジェクト紹介シンポジウムーメダカー
国家生物资源项目引进研讨会-青鳉
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nuchnoi;et.al.;成瀬清
  • 通讯作者:
    成瀬清
Identification of the sex-determining locus in the Thai medaka, Oryzias minutillus
  • DOI:
    10.1159/000125839
  • 发表时间:
    2008-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.7
  • 作者:
    Nagai, T.;Takehana, Y.;Sakaizumi, M.
  • 通讯作者:
    Sakaizumi, M.
Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes): insights into the post-transcriptional gene regulation in early development.
  • DOI:
    10.1016/j.gene.2009.09.005
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Saori Tani;R. Kusakabe;K. Naruse;H. Sakamoto;Kunio Inoue
  • 通讯作者:
    Saori Tani;R. Kusakabe;K. Naruse;H. Sakamoto;Kunio Inoue
Medaka: Biology, Management, and Experimental Protocols
  • DOI:
    10.1002/9780813818849
  • 发表时间:
    2009-06
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M. Kinoshita;K. Murata;K. Naruse;Minoru Tanaka
  • 通讯作者:
    M. Kinoshita;K. Murata;K. Naruse;Minoru Tanaka
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成瀬 清其他文献

ヘルペスウイルスと一体化した巨大DNAトランスポゾンAlbatross
巨型 DNA 转座子信天翁与疱疹病毒整合
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    ○井上 雄介;佐賀 友則;相川 拓海;森下 真一;成瀬 清;島田 敦子;古賀 彰彦;武田 洋幸
  • 通讯作者:
    武田 洋幸
腸管閉鎖を示すメダカ突然変異体の解析-細胞死とEMTに関する検討-
表现出肠闭锁的青鳉突变体分析 - 细胞死亡和 EMT 的研究 -
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    ○小林 大介;木村 哲晃;安齋 賢;木下 政人;成瀬 清;武田 洋幸;八代 健太
  • 通讯作者:
    八代 健太
魚類の黄色素胞発生を支える転写制御ネットワーク
支持鱼类黄色素发育的转录调控网络
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    橋本寿史;白石陽子;杉若佳祐;小林輝;木村哲晃;安齋 賢;田中理映子;山平寿智;Kawilarang WA Mesengi;宮台元裕;長尾勇佑;Kelsh RN;成瀬 清;日比正彦
  • 通讯作者:
    日比正彦
ツメガエルにおけるCRISPR/Cas9と長鎖一本鎖DNAを用いた簡便な遺伝子ノックイン
使用 CRISPR/Cas9 和长单链 DNA 在非洲爪蟾中进行简单的基因敲入
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    欧 語詩;鈴木 誠;成瀬 清;笹倉 靖徳;Paix Alexandre;荻野 肇
  • 通讯作者:
    荻野 肇
Searching for genes affecting visually-evoked startle response properties in Medaka (Oryzias latipes
寻找影响青鳉(Oryzias latipes)视觉诱发惊吓反应特性的基因
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    坪子理美;木村 哲晃;末廣 勇司;奥山 輝大;島田 敦子;武田 洋幸;成瀬 清;久保 健雄;竹内 秀明
  • 通讯作者:
    竹内 秀明

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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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メダカ近縁種のゲノムライブラリーの作成とメダカゲノム情報による物理地図作成
青鳉相关物种基因组文库的创建以及利用青鳉基因组信息创建物理图谱
  • 批准号:
    18017006
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 5.38万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
メダカ近縁種のBACライブラリーの作成とメダカゲノム情報による物理地図作成
建立青鳉相关物种的BAC文库并利用青鳉基因组信息创建物理图谱
  • 批准号:
    17018011
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 5.38万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
PCR-RFLP多型をもちいたメダカ連鎖地図の作成と発現遺伝子のマッピング
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    09780621
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    1997
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    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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基于核DNA的青鳉亚目鱼类系统发育研究
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    08740661
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    $ 5.38万
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ミトコンドリアと核DNAに基づくメダカ亜目魚類の系統とその上位分類に関する研究
基于线粒体和核DNA的青鳉亚目鱼类系统发育及高等分类研究
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    07740657
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 5.38万
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    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ミトコンドリ3DNAをもちいたメダカ亜目魚類の系統とその上位分類に関する研究
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  • 批准号:
    06740642
  • 财政年份:
    1994
  • 资助金额:
    $ 5.38万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
反復配例DNAをもちいたメダカ属魚類の系統分類に関する研究
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  • 批准号:
    04854083
  • 财政年份:
    1992
  • 资助金额:
    $ 5.38万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
反復配列DNAをもちいたメガタ属魚類の系統分類に関する研究
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  • 批准号:
    03854096
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 5.38万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

インドメダカ性決定遺伝子のポジショナルクローニング
印度青鳉性别决定基因的定位克隆
  • 批准号:
    08J01897
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 5.38万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
メダカ近縁種のゲノムライブラリーの作成とメダカゲノム情報による物理地図作成
青鳉相关物种基因组文库的创建以及利用青鳉基因组信息创建物理图谱
  • 批准号:
    18017006
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 5.38万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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知道了