ミトコンドリアと核DNAに基づくメダカ亜目魚類の系統とその上位分類に関する研究
基于线粒体和核DNA的青鳉亚目鱼类系统发育及高等分类研究
基本信息
- 批准号:07740657
- 负责人:
- 金额:$ 0.58万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- 财政年份:1995
- 资助国家:日本
- 起止时间:1995 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
メダカ亜目魚類14種からDNAを抽出し、PCR法によりミトコンドリアにコードされるチトクロームbおよび12SリボソームRNA遺伝子を増幅、単離し、塩基配列を決定した。それらの塩基配列をもとにメダカ亜目に属する魚類の系統関係を推定した。その結果、ゼノポエシルス属の魚類は、スラベシ島のメダカ属魚類を含む単系統群を形成することが明らかとなった。またゼノポエシルス属の1種(X.saracinorum)の核型を分析した結果、大型の両腕型染色体を持つことが分かった。これは核型からみても、X.saracinorumがスラベシ島のメダカ属魚類に近縁であることを示している。これらの結果は、ゼノポエシルス属の魚類がスラベシ島のメダカ属魚類とともに単系統群を形成するのはミトコンドリアの移入交雑によるのではないことを示唆している。つまり別属とされるほどの形態的な変化はニッチの変化による形態進化の加速によるものではないかと推定されるわけである。これらのことをさらに明らかにするためには、核にコードされている遺伝子配列に基づく系統解析をおこなう必要がある。現在、光回復酵素遺伝子の一部を、材料とする総ての魚種からPCR法により単離する事ができた。一部分については塩基配列も決定した。その結果エクソン部分にはほとんど変異がないが、イントロン部分には挿入や欠失あるいは塩基置換などの多数の変化があることが明らかとなった。また日本メダカの種内にも挿入/欠失型の変異があることが分かった。これを用いて、光回復酵素遺伝子の連鎖解析をおこない、連鎖する他の遺伝子座も明らかとなった。今後は単離したフラグメントの全塩基配列を決定し、それに基づく分子系統学的解析をさらに詳細におこなう予定である。
メ ダ カ 亜 fish 14 species か ら を DNA extraction し, PCR method に よ り ミ ト コ ン ド リ ア に コ ー ド さ れ る チ ト ク ロ ー ム b お よ び 12 s リ ボ ソ ー ム RNA heritage 伝 を raised picture, 単 from し, salt base with column を decided し た. Youdaoplaceholder0 <s:1> basic sequence を とにメダカ亜 とにメダカ亜 とにメダカ亜 order に genus する fish <s:1> system relationship を presumed た. そ の results, ゼ ノ ポ エ シ ル ス は の fish and ス ラ ベ シ island の メ ダ カ contains fish を む 単 system を formation す る こ と が Ming ら か と な っ た. ま た ゼ ノ ポ エ シ ル ス の 1 species (X.s aracinorum) の karyotype analysis を し た results, large の struck wrist type chromosome を hold つ こ と が points か っ た. こ れ は karyotype か ら み て も, X.s aracinorum が ス ラ ベ シ island の メ ダ カ fish に nearly try で あ る こ と を shown し て い る. こ れ ら の results は, ゼ ノ ポ エ シ ル ス is の fish が ス ラ ベ シ island の メ ダ カ fish と と も に 単 system を formation す る の は ミ ト コ ン ド リ ア の moved to pay 雑 に よ る の で は な い こ と を in stopping し て い る. つ ま り don't belong to と さ れ る ほ ど な の form - the は ニ ッ チ の variations change に よ る morphological evolution の speed に よ る も の で は な い か と presumption さ れ る わ け で あ る. こ れ ら の こ と を さ ら に Ming ら か に す る た め に は, nuclear に コ ー ド さ れ て い る heritage 伝 with sequence に base づ く system analytic を お こ な う necessary が あ る. Now, traces of light response enzyme 伝 の a を, material と す る 総 て の species か ら PCR method に よ り 単 from す る matter が で き た. A portion of the に, に, て, て, て of the bases is arranged に to determine た. そ の results エ ク ソ ン part に は ほ と ん ど - different が な い が, イ ン ト ロ ン part に は scions into や owe lost あ る い は salt base displacement な ど の most の variations change が あ る こ と が Ming ら か と な っ た. Youdaoplaceholder0 Japanese メダカ <s:1> intratecspecific に に insert/underloss type <s:1> variation がある とが とが division った った. こ れ を with い て, light response enzyme but 伝 の chain analytic を お こ な い, chain す る he の heritage 伝 stroma も Ming ら か と な っ た. Future は 単 from し た フ ラ グ メ ン ト の salt base full を decided し, そ れ に base づ く molecular phylogeny of parsing を さ ら に detailed に お こ な う designated で あ る.
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
K. Naruse: "Medaka as a model orgahism for recearch in eyperlmental Biology" The Fish Biology Journal : MEDAKA. 6. 47-52 (1994)
K. Naruse:“青鳉作为高级心理生物学研究的模型有机体”鱼类生物学杂志:MEDAKA。
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- 影响因子:0
- 作者:
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H.Wada: "Agenetic linkages map of a fish, the Japanese Medaka, Oryzias larpes." Mol. Marine Biol. Biotech.4. 269-274 (1995)
H.Wada:“日本青鳉鱼(Oryzias larpes)的遗传连锁图。”
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- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
A. Arai: "cloning and characuerization of cDNAs for 70K-Da heat-shock proteins (Hisppo) from two fish specles of the genus Uryzias." Jpn. J. Genet.70. 423-433 (1995)
A. Arai:“从 Uryzias 属的两种鱼类中克隆和表征 70K Da 热休克蛋白 (Hisppo) 的 cDNA。”
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
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T.Mukai:“基于同种酶多态性的三叉戟属(双鱼座;Gobiidac)的基因治疗”Zool。
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