メダカ近縁種のゲノムライブラリーの作成とメダカゲノム情報による物理地図作成

青鳉相关物种基因组文库的创建以及利用青鳉基因组信息创建物理图谱

• 批准号: 18017006
• 负责人: 成瀬 清
• 金额: $ 5.12万
• 依托单位: National Institute for Basic Biology (2007)The University of Tokyo (2006)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18017006/
• 关键词: メダカ; ゲノム; 近縁種; 性決定; 性染色体; 進化; 性決定遺伝子; BACライブラリー; ルソンメダカ; インドメダカ; 3次元PCRスーパープール; フォスミドライブラリー; 培養細胞

インドメダカ関連研究インドメダカをもちいてメダカESTマーカーを中心にしてゲノム内をスキャンすることで性連鎖マーカーを同定した。その結果インドメダカ性染色体はメダカLG10と相同な染色体であることが明らかとなった。さらに詳細な遺伝学的解析の結果、インドメダカ性決定領域をメダカゲノム上で約300kbpの領域に絞り込むことが出来た。インドメダカXY雄と性転換XY雌を交配しXX,XY,YY胚を作成し、そのマーカーをもちいて遺伝子タイピングをおこないXX胚とYY胚を同定した。それぞれ1個体より由来する培養細胞系を樹立した後、それらの培養細胞をもちいて2種類のBACライブラリー(IMBYとIMBX)を構築し、それぞれのライブラリーを384穴プレート96枚に整列化させた。詳細な連鎖解析から同定できた性連鎖PCRマーカーをもちいてIMBYライブラリーのスクリーニングをおこない、インドメダカ性決定領域を完全に覆う物理地図を作成することが出来た。ハブスメダカ関連研究ハブスメダカではメダカESTマーカーを用いた連鎖解析の結果ZZ-ZW型の性決定システムをもっと共にその性染色体はメダカLG05に相同であることが明らかとなった。ジャワメダカ/ハブスメダカF1よりfosmidライブラリーを構築するとともにF1胚に由来する培養細胞系も樹立した。構築したfosmidライブラリーは約2000クローンをプールして、PCRスクリーニング用のDNAプールを作成した。これによりPCRとハイブリダイゼーション組み合わせてバブスメダカ性決定領域に由来するクローンのスクリーニングをおこなった。同定したクローンをもちいてハブスメダカ培養細胞から作成した染色体標本をもちいてFISH法によりハブスメダカZ染色体とW染色体をそれぞれ同定したところメダカ属では初めて形態的に性染色体が分化していることを明らかにすることが出来た。

I don't know what to do. I don't know. I don't know. The results showed that the sex chromosomes were the same as the LG10 chromosomes. In this paper, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the results of the study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, the results of the analysis of the field of study, and the results of the analysis of the field of study. The XY male sex, the XY female mating, the XX,XY,YY embryo, the XX,XY,YY embryo, the XX embryo, the YY embryo. This is the reason for the development of a body. After the establishment of the cell system, the cells were cultured in the same way as the first BAC (IMBYIMBX). In this way, the whole system was divided into 96 clusters. The resolution of the PCR connection is the same as that of the sexual link. The IMBY connection is the same as that of the sexual link.

项目成果

The medaka draft genome and insights into vertebrate genome evolution

• DOI: 10.1038/nature05846
• 发表时间: 2007-06-07
• 期刊: NATURE
• 影响因子: 64.8
• 作者: Kasahara, Masahiro;Naruse, Kiyoshi;Kohara, Yuji
• 通讯作者: Kohara, Yuji

The DMY gene induces male development in genetically fem ale(XX)medaka fish.

DMY 基因可诱导雌性 ale(XX) 青鳉鱼的雄性发育。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Pro. Natl. Acad. Sci 104,
• 作者: Matsuda M.;Shinomiya A.;Kinoshita M;et. al.
• 通讯作者: et. al.

Active digestion of sperm mitochondrial DNA in single living sperm revealed by optical tweezers

• DOI: 10.1073/pnas.0506911103
• 发表时间: 2006-01-31
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Nishimura, Y;Yoshinari, T;Kuroiwa, T
• 通讯作者: Kuroiwa, T

Evolution of different Y chromosomes in two medaka species, Oryzias dancena and O. Iatipes.

两种青鳉物种（Oryzias dancena 和 O. Iatipes）不同 Y 染色体的进化。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Genetics 175
• 作者: Takehana;Y.;Demiyah;D.;et. al.
• 通讯作者: et. al.

Analysis of the exon-intron structures of fish, amphibian, bird and mammalian hatching enzyme genes, with special reference to the intron loss evolution of hatching enzyme genes in Teleostei

• DOI: 10.1016/j.gene.2006.11.012
• 发表时间: 2007-05-01
• 期刊: GENE
• 影响因子: 3.5
• 作者: Kawaguchi, Marl;Yasumasu, Shigeki;Iuchi, Ichiro
• 通讯作者: Iuchi, Ichiro