Highly Accurate Comparative Genome Mapping and Structural Genomics

高精度比较基因组作图和结构基因组学

• 批准号: 17018031
• 负责人: FUJIYAMA Asao
• 金额: $ 108.99万
• 依托单位: National Institute of Informatics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018031/
• 关键词: ゲノム; 比較ゲノム; ゲノム情報; 染色体; ゲノムライブラリ; ゲノム科学; 遺伝学; ハイスループット解析; 遺伝子; ゲノム地図; ゲノム構造; ゲノム進化

In this research, we aimed to clarify the genomic events that could be important during the evolutionary processes toward development of human. One of the major discoveries of this project is that the identification of the importance of species specific amplification of repetitive sequences after the separation of human and chimpanzee about 5-milllion years ago. To do so, we carried out highly accurate structural analysis of chimpanzee chromosome22 and Y, and compared them with human genome.

在这项研究中，我们的目的是澄清基因组事件，可能是重要的进化过程中对人类的发展。该项目的主要发现之一是，在大约500万年前人类和黑猩猩分离之后，鉴定了重复序列的物种特异性扩增的重要性。为此，我们对黑猩猩22号染色体和Y染色体进行了高度精确的结构分析，并将其与人类基因组进行了比较。

项目成果

UTGB/medaka: genomic resource database for medaka biology.

• DOI: 10.1093/nar/gkm765
• 发表时间: 2008-01
• 期刊: NUCLEIC ACIDS RESEARCH
• 影响因子: 14.9
• 作者: Ahsan, Budrul;Kobayashi, Daisuke;Yamada, Tomoyuki;Kasahara, Masahiro;Sasaki, Shin;Saito, Taro L.;Nagayasu, Yukinobu;Doi, Koichiro;Nakatani, Yoichiro;Qu, Wei;Jindo, Tomoko;Shimada, Atsuko;Naruse, Kiyoshi;Toyoda, Atsushi;Kuroki, Yoko;Fujiyama, Asao;Sasaki, Takashi;Shimizu, Atsushi;Asakawa, Shuichi;Shimizu, Nobuyoshi;Hashimoto, Shin-Ichi;Yang, Jun;Lee, Yongjun;Matsushima, Kouji;Sugano, Sumio;Sakaizumi, Mitsuru;Narita, Takanori;Ohishi, Kazuko;Haga, Shinobu;Ohta, Fumiko;Nomoto, Hisayo;Nogata, Keiko;Morishita, Tomomi;Endo, Tomoko;Shin-I, Tadasu;Takeda, Hiroyuki;Kohara, Yuji;Morishita, Shinichi
• 通讯作者: Morishita, Shinichi

The genome size evolution of medaka (Oryzias latipes) and fugu (Takifugu rubripes)

• DOI: 10.1266/ggs.82.135
• 发表时间: 2007-04-01
• 期刊: GENES & GENETIC SYSTEMS
• 影响因子: 1.1
• 作者: Imai, Shuichiro;Sasaki, Takashi;Shimizu, Nobuyoshi
• 通讯作者: Shimizu, Nobuyoshi

次世代シークエンサーによるゲノム解読と今後の動向

使用下一代测序仪进行基因组解码和未来趋势

• 发表时间: 2009
• 期刊: 実験医学 27
• 作者: 岩部直之;他;Goto H;豊田敦
• 通讯作者: 豊田敦

緑藻クラミドモナスの完全長cDNA配列解析とゲ

绿藻衣藻全长cDNA序列分析和基因组分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 久保雄昭;山野隆志;佐竹知也;鈴木穣;菅野純夫;藤山秋佐夫;黒木陽子;小原雄治;新井理;伊藤武彦;福澤秀哉
• 通讯作者: 福澤秀哉

オキゴンドウMHC領域のゲノム配列決定と比較ゲノム解析

假虎鲸MHC区域的基因组测序和比较基因组分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 渡辺舞;細道一善;野口英樹;黒木陽子;豊田敦;田中彰;猪子英俊;藤山秋佐夫;椎名隆
• 通讯作者: 椎名隆