Functional Genomics based upon mouse inter-subspecific consomic strain

基于小鼠亚种间康体菌株的功能基因组学

• 批准号: 17018033
• 负责人: SHIROISHI Toshihiko
• 金额: $ 114.75万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018033/
• 关键词: C57BL; 6; MSM; Ms; コンソミック系統; SNP; ゲノム多型性; 表現型多様性; QTL; サブコンソミック系統; マウス亜種; 表現型スクリーニング; エネルギー代謝; 行動特性; 遺伝学; ゲノム; 行動学; 進化; 糖尿病; マウス; 表現型; SNP解析

Based upon large genomic and phenotypic differences between two mouse subspecies, we have developed an analytic platform for mouse functional genomics. Systematic phenotyping of a full set of mouse inter-subspecific consomic strains, in which each chromosome of a standard inbred strain C57BL/6J is replaced by its counter part of Japanese wild mice-derived MSM/Ms, successfully detected more than 200 QTLs that affect growth, metabolism, and behavioral complex traits. Beside, we have constructed genome and phenotype databases, integrating SNPs and the QTLs detected by the consomic strains. These databases are now open to public.

基于两个小鼠亚种之间巨大的基因组和表型差异，我们开发了一个小鼠功能基因组学分析平台。用日本野鼠来源的MSM/MS替换标准近交系C57BL/6J的每条染色体，对一整套小鼠亚种间共体品系进行了系统的表型分析，成功地检测到了200多个影响生长、代谢和行为复杂性状的QTL。此外，我们还构建了基因组和表型数据库，整合了SNPs和共体菌株检测到的QTL。这些数据库现已向公众开放。

项目成果

糖尿病研究におけるforward geneticsアプローチ

糖尿病研究中的正向遗传学方法

• 发表时间: 2008
• 作者: Takeo Suzuki;Tomoyuki Numata;Takuo Osawa;Tsutomu Suzuki;城石俊彦
• 通讯作者: 城石俊彦

Complex genetic architecture of social interaction and aggressive behavior clarified using consomic strains derived from MSM and C57BL/6.

使用源自 MSM 和 C57BL/6 的染色体菌株阐明了社会互动和攻击行为的复杂遗传结构。

• 发表时间: 2008
• 作者: Takahashi;A.;Sugimoto;H.;Kimura;S.;Tomihara;K.;Tsuchiya;T.;Kakihara;S.;Tanemura;M.;Shiroishi;T.;Koide;T.
• 通讯作者: T.

Genetic analysis of inter-male aggression using consomic mouse strains established from C57BL/6J and MSM

使用 C57BL/6J 和 MSM 建立的体体小鼠品系进行雄性间攻击行为的遗传分析

• 发表时间: 2008
• 作者: Takahashi;A.;Tomihara;K.;Shiroishi;T.;Koide;T.
• 通讯作者: T.

Aberrant neurological development caused by genetic incompatibility between two wild-derived mouse strains.

两种野生小鼠品系之间的遗传不相容性导致神经发育异常。

• 发表时间: 2007
• 作者: Umemori;J.;Kondou;R.;Uno;T.;Yuasa;S.;Koide;T.:
• 通讯作者: T.:

Molecular evolution of cadherin-related neuronal receptor/protocadherin a (CNR/Pcdha) gene cluster in Mus musculus subspecies.

小家鼠亚种钙粘蛋白相关神经元受体/原钙粘蛋白 a (CNR/Pcdha) 基因簇的分子进化。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Mol.Biol.Evol. 22
• 作者: Sasaki T.;Nishihara H.;Hirakawa M.;Fujimura K.;Tanaka M.;Kokubo N.;Kimura-Yoshida C.;Matsuo I.;Sumiyama K.;Saitou N. Shimogori T.;Okada N.;Taguchi Y.
• 通讯作者: Taguchi Y.