Genetic regulation of tissue-specific Shh expression by long-range enhancers and chromosome dynamics

长程增强子和染色体动力学对组织特异性Shh表达的遗传调控

• 批准号: 19370003
• 负责人: SHIROISHI Toshihiko
• 金额: $ 11.56万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19370003/
• 关键词: Shh 遺伝子; 非翻訳保存配列; 遺伝子発現制御; 遠隔エンハンサー; 染色体動態; Shh遺伝子

マウス発生胚肢芽では、Shh 遺伝子の転写レベルの変化に応じてShh 遺伝子座から遠く離れた遠隔エンハンサーを含むシス配列とShh 翻訳領域の物理的距離が時期・組織特異的にダイナミックに変化する。本研究では、Shh 遺伝子の転写制御に絡む染色体高次構造変化の分子基盤を明らかにし、その生物学的意義を考察した。本研究成果により、マウス肢芽でのShh 遺伝子発現は、エンハンサーとプロモーターの物理的相互作用に加えて染色体テリトリーからのShh 遺伝子座のルーピングアウトという二段階の染色体高次構造の変化によって制御されることが明らかとなった。また、Shh 遺伝子の遠隔および近位エンハンサーの詳細な発現量の比較解析を行い、前者は短期で比較的低レベルの遺伝子発現を、後者は長期間にわたる高レベルの遺伝子発現を制御している可能性が示唆された。このように、染色体の高次構造のダイナミックな変化により、発生関連遺伝子の発現量について精巧な制御が行われていることが明らかとなった。また、本研究では、肢芽以外において、Shh 遺伝子の口腔から腸管の上皮組織での発現を特異的に制御するエンハンサーを新たに同定した。

In the case of embryo limb buds, the Shh sub-system is used to write information about how to make sure that the Shh sub-seat is equipped with a list of real-time organization features that are related to the field physics of Shh. The purpose of this study is to study the meaning of biology in the study of the molecular basis of the high-order production of chromosomes in Shh. The results of this study are as follows: the results of this study are as follows In addition, the Shh system is responsible for the analysis of the volume of data acquisition, the short-term comparison of the short-term performance of the former, and the long-term performance of the latter, indicating that it is possible to control the impact. In the first place, the chromosomes are in high order, and the chromosomes are in high order. In this case, the chromosomes are in high order, and the chromosomes are in high order. In this study, the epithelial tissue of oral cavity tube was detected in the patients with limb bud, limb bud, limb bud and Shh, and the results showed that the epithelial tissue of the oral cavity was significantly higher than that of the control group.

项目成果

Evolutionary conserved non-coding sequence 1Mb away from the Shh coding sequence acts as limb bud-specific Shhenhancer

距 Shh 编码序列 1Mb 的进化保守非编码序列充当肢芽特异性 Shhenhancer

• 发表时间: 2008
• 作者: Amano T;Sagai T;Tanabe H;Shiroishi T;Shiroishi T
• 通讯作者: Shiroishi T

Sonic hedgehog (Shh)遺伝子の発現制御にかかわる染色体ダイナミクス

染色体动力学参与音刺猬 (Shh) 基因表达的调节

• 发表时间: 2009
• 作者: Sakuraba Y;Kimura T;Masuya H;Noguchi H;Sezutsu H;Takahasi KR;Toyoda A;Fukumura R;Murata T;Sakaki Y;Yamamura M;Wakana S;Noda T;Shiroishi T ;Gondo Y;Sakuraba Y;Tamura M.;Tanaka S.;Tanaka S.;Yakushiji N.;城石俊彦
• 通讯作者: 城石俊彦

Shh signaling regulated by a highly conserved remote enhancer is essential for the development of posterior oro-pharyngeal apparatus

由高度保守的远程增强子调节的Shh信号对于后口咽器的发育至关重要

• 发表时间: 2007
• 作者: Sagai T;Amano T;Tamura M;Mizushina Y;Yamamoto H;Sumiyama K;Shiroishi T
• 通讯作者: Shiroishi T

A new Gsdma3 mutation affecting anagen phase of first hair cycle

• DOI: 10.1016/j.bbrc.2007.05.209
• 发表时间: 2007-08-10
• 期刊: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
• 影响因子: 3.1
• 作者: Tanaka, Shigekazu;Tamura, Masaru;Shiroishi, Toshihiko
• 通讯作者: Shiroishi, Toshihiko

Evolutionary conserved non-coding sequence 1Mb away from the Shh coding sequence acts as limb bud-specific Shh enhancer.

距Shh编码序列1Mb的进化保守非编码序列充当肢芽特异性Shh增强子。

• 发表时间: 2008
• 作者: Sakuraba Y;Kimura T;Masuya H;Noguchi H;Sezutsu H;Takahasi KR;Toyoda A;Fukumura R;Murata T;Sakaki Y;Yamamura M;Wakana S;Noda T;Shiroishi T ;Gondo Y;Sakuraba Y;Tamura M.;Tanaka S.;Tanaka S.;Yakushiji N.;城石俊彦;城石俊彦;Shiroishi T.
• 通讯作者: Shiroishi T.