siRNAライブラリーを用いた刷り込み遺伝子発現調節分子の同定

使用 siRNA 文库鉴定印迹基因表达调控分子

• 批准号: 17019054
• 负责人: 副島 英伸
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Saga University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019054/
• 关键词: ゲノム刷り込み; 刷り込みドメイン; siRNAライブラリー; non-coding RNA; ヒストンメチル化

ゲノム刷り込みはエピジェネティクスの代表的現象で、一対の対立遺伝子において一方の親由来の遺伝子のみが発現する。複数の刷り込み遺伝子がドメインを作り、ドメイン内の刷り込み調節領域(ICR)に付けられた刷り込みマークに基づき遺伝子発現が決定されている。しかし、その遺伝子発現調節機構はほとんど未解明のままである。本研究では、ヒト疾患に関連する11p15.5のKIP2/LIT1刷り込みドメインに着目し、刷り込み遺伝子の発現制御機構の解明を目的とする。1.刷り込み調節分子の同定:KIP2/LIT1ドメインの刷り込み破綻を単純な表現型(GFPの蛍光や薬剤耐性)で判定できる細胞を作製し、この細胞にsiRNAライブラリーを感染させ、表現型の変化で刷り込み破綻細胞を選別する。選別した刷り込み破綻細胞からsiRNAベクターを回収後、塩基配列を決定し、ゲノムデータベースを検索して刷り込み破綻を引きおこした候補遺伝子を同定する。また、non-coding RNAであるLIT1遺伝子の転写物を様々な長さで発現するような細胞を作製し、刷り込み破綻の有無を解析して、刷り込み調節分子としての可能性を検証する。上記目的のために、細胞系構築に必要なベクター合計5種類を作製した。現在、これらのベクターを細胞に導入している。2.新規刷り込みマークの同定:F1マウス由来線維芽細胞を用いたクロマチン免疫沈降法(ChIP法)によりICRのヒストンH3K9、H3K27、H4K20のモノ、ジ、トリメチル化について解析した。その結果、H3K20のモノメチル化のみが父アレルに優位に存在することが判明した。ヒストンH3のメチル化は遺伝子抑制のマークであり、父アレル上ではLit1を除く他の刷り込み遺伝子は抑制されていることから、H3K20モノメチル化がドメイン内の刷り込み遺伝子の発現を抑制するマークである可能性が示唆された。

Please tell me that the image represented by the child, which is represented by the child, is the symbol of the image, which is represented by the image, the image. A copy of the data is required to make a decision in the field of field (ICR) in which a decision is made. It has been found that the financial institutions have not explained the information about the operation of the police. In this study, patients with diseases, diseases, 1. The KIP2/ LIT1 filter was used to break the cell profile (GFP tolerance) to determine whether the cell was infected, the cell was infected, and the cell was selected. After you choose to change the number of users, the siRNA cell will be returned, the basic configuration column will be decided, and the request will be made if you want to determine the number of candidates. The computer, non-coding RNA, LIT1, and writing materials can be read by the computer, and you can see that there is a failure to analyze the data, and the possibility that the data may not be resolved. For the last purpose, it is necessary to make a total of 5 years of information on the population of the family. Now, you have to pay attention to the number of people you are living in. two。 The new specification is the same: the origin of the F1 virus is maintained by immunoprecipitation method (ChIP). The H3K9, H3K27, H4K20, H3K9, H3K27, H4K20 are analyzed by the immunoprecipitation method. The results show that there is an error in the location of the parent of the H3K20. The child suppresses the child and the Lit1 on the parent suppresses the child. Except that he brushes the child, the H3K20 suppresses the child. The possibility indicates that the suppression is not possible.

项目成果

Epigenetic silencing of the MGMT gene in cancer

• DOI: 10.1139/o05-140
• 发表时间: 2005-08-01
• 期刊: BIOCHEMISTRY AND CELL BIOLOGY
• 影响因子: 2.9
• 作者: Soejima, H;Zhao, W;Mukai, T
• 通讯作者: Mukai, T

インプリンティングと先天異常、癌

印记、出生缺陷和癌症

• 发表时间: 2005
• 期刊: Molecular Medicine 42・2
• 作者: Matsumoto S;Kanekiyo M;Ami Y;Oiso R;松本 壮吉;松本 壮吉;Zhang Z;Soejima H;Arima T;Yamasaki Y;Soejima H;Haruta M;副島英伸
• 通讯作者: 副島英伸

Comparative analyses of genomic imprinting and CpG island-methylation in mouse Murrl and human MURR1 loci revealed a putative imprinting control region in mice.

对小鼠 Murrl 和人类 MURR1 基因座的基因组印记和 CpG 岛甲基化的比较分析揭示了小鼠中假定的印记控制区域。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Gene 366・1
• 作者: Matsumoto S;Kanekiyo M;Ami Y;Oiso R;松本 壮吉;松本 壮吉;Zhang Z
• 通讯作者: Zhang Z

ZAC, LIT1 (KCNQ1OT1) and p57KIP2 (CDKN1C) are in an imprinted gene network that may play a role in Beckwith-Wiedemann syndrome.

ZAC，LIT1（KCNQ1OT1）和P57KIP2（CDKN1C）处于一个烙印基因网络中，可能在Beckwith-Wiedemann综合征中发挥作用。

• DOI: 10.1093/nar/gki555
• 发表时间: 2005
• 期刊: NUCLEIC ACIDS RESEARCH
• 影响因子: 14.9
• 作者: Arima, T;Kamikihara, T;Hayashida, T;Kato, K;Inoue, T;Shirayoshi, Y;Oshimura, M;Soejima, H;Mukai, T;Wake, N
• 通讯作者: Wake, N

Imprinting, Chromatin Structure, and Disease.

印记、染色质结构和疾病。

• 发表时间: 2005
• 期刊: J Cell Biochem 95・2
• 作者: Matsumoto S;Kanekiyo M;Ami Y;Oiso R;松本 壮吉;松本 壮吉;Zhang Z;Soejima H
• 通讯作者: Soejima H