大規模全ゲノム関連解析によるアトピー性喘息疾患遺伝子の探索

通过大规模全基因组关联分析寻找特应性哮喘疾病基因

基本信息

  • 批准号:
    18018003
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 5.44万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2006 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では一塩基置換多型(SNP)よる喘息全ゲノム関連解析の結果から陽性となったSNP(一次解析)をさらに家系およびケースコントロールのサンプルを用いて関連解析(二次解析、三次解析)を行うことにより疾患感受性遺伝子を探索することを目的とする。本年度は気管支喘息のSNPの全ゲノム解析により気管支喘息発症と関連するSNPとして同定されたPEX19-1073C/A(rs2820421)の機能解析実験およびin silico analysisを行った。疾患との関連が認められたrs2820421は50kbにまたがる大きな連鎖不平衡ブロックの中にありこのブロック内には4遺伝子が存在する。SNP発現解析ソフトウェアであるmRNA by SNPソフトウェアによるin silico analysisではrs2820421はWDR42R およびPEX19遺伝子の発現を調節しているという結果が示唆された。ルシフェラーゼアッセイによる転写解析ではrs2820421のCアレルの転写活性はAアレルと比較して有意に高く、さらにゲルシフトアッセイでは、Aアレルを含むオリゴヌクレオチドはCアレルを含むものよりも結合能が高いことが観察された。以上の結果から、rs2820421領域になんらかの転写因子が結合し、下流の遺伝子発現を調節することにより喘息の疾患感受性に関わっている可能性が示唆された(Fujimotoら、論文投稿中)。
In this study, the results of association analysis of SNP(primary analysis), family and family were used to explore disease-susceptible genes (secondary analysis, tertiary analysis). This year, the functional analysis of the SNP associated with PEC 19- 1073C/A(rs2820421) was performed in silico analysis. The association between the disease and rs2820421 is 50kb long and the linkage disequilibrium between the disease and rs2820421 is 4 alleles long. SNP expression analysis of WDR42R and PEX19 mRNA by SNP expression in silico analysis The analysis results show that the activity of the compound is higher than that of the compound in rs2820421, and the activity of the compound in rs2820421 is higher than that in rs2820421. The above results show that the possibility of the combination of the writing factors in the domain rs2820421 and the modulation of the occurrence of downstream genes in the field rs2820421 is related to the susceptibility of wheezing (Fujimoto, paper submission).

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
アレルギー疾患の遺伝子配列解析研究の進歩と現状
过敏性疾病基因序列分析研究进展及现状
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Toriba;Akira;間陽子;Khee-Gan Lee;野口恵美子
  • 通讯作者:
    野口恵美子
喘息の薬理遺伝学
哮喘的药物遗传学
Failure to find an association between CD14-159C/T polymorphism and asthma : a family-based association test and meta-analysis
未能找到 CD14-159C/T 多态性与哮喘之间的关联:基于家族的关联测试和荟萃分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nishimura F;Shibasaki M;Ichikawa K;Arinami T;Noguchi E
  • 通讯作者:
    Noguchi E
An association between asthma and TNF-308G/A polymorphism: meta-analysis.
  • DOI:
    10.1007/s10038-006-0007-3
  • 发表时间:
    2006-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Aoki, Takeshi;Hirota, Tomomitsu;Noguchi, Emiko
  • 通讯作者:
    Noguchi, Emiko
Monoallelic and unequal allelic expression of the HTR2A gene in human brain and peripheral lymphocytes
  • DOI:
    10.1016/j.biopsych.2006.06.024
  • 发表时间:
    2006-12-15
  • 期刊:
  • 影响因子:
    10.6
  • 作者:
    Fukuda, Yoshiko;Koga, Minori;Arinami, Tadao
  • 通讯作者:
    Arinami, Tadao
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
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    今川 和生;高山 和雄;磯山 茂美;野口 恵美子;新開 真人;立花 雅史;櫻井 文教;川端 健二;須磨崎 亮;水口 裕之
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    0
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  • 通讯作者:
    藤枝 重治
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    0
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  • 通讯作者:
    野口 恵美子

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    $ 5.44万
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知道了