網羅的変異解析に基づく新規プロリン異性化酵素の発掘と創製
網羅的変異解析に基づく新規プロリン異性化酵素の発掘と創製
批准号:
18031009
负责人:
伊倉 貞吉
金额:
$3.2万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
タンパク質を構成するアミノ酸残基の中でプロリン残基は、その直前の残基とのペプチド結合(X-Pro)に関して、トランスもシスも容易に取りうる点で特異な残基である。近年、このX-Proの構造異性化が、プロリン異性化酵素(PPIase)により制御され、様々な生理活性に活用されている事が明らかになってきた。ところが、PPIaseの機能に関しては、「そもそも、なぜX-Proの構造異性化機能をもつのか?」という基本問題に対してさえ明確に答えられないのが現状である。そこで、私は、PPIaseの酵素活性に注目し、基質結合部位に導入した網羅的変異を手がかりに、PPIaseが酵素活性を発現するのに必要な条件を解析してきた。その結果、PPIase活性の発現には側鎖の関与は必ずしも必要とされず、適当なサイズのポケットだけがあれば発現される機能であると推察するに至っれ。この推察を確かめるため、本研究では、PPIase活性を示さないタンパク質としてバルナーゼ用い、アミノ酸残基置換により人為的にポケットを作成し、PPIase活性の発現を調べた。その結果、Phe56Gly/Arg59Gly/His102Tyr/Tyr103Glyの四重変異により、ポケットを導入したバルナーゼは、野生型FKBPの約4%の活性を示すことがわかった。このようにして、適当なサイズのポケットが存在することがPPIase活性発現に必要十分であることが実際に確認された。そこで、これらの実験結果に基づき、新たにPPIase活性発現機構モデルを提案した。
英文摘要
タンパク質を構成するアミノ酸残基の中でプロリン残基は、その直前の残基とのペプチド結合(X-Pro)に関して、トランスもシスも容易に取りうる点で特異な残基である。近年、このX-Proの構造異性化が、プロリン異性化酵素(PPIase)により制御され、様々な生理活性に活用されている事が明らかになってきた。ところが、PPIaseの機能に関しては、「そもそも、なぜX-Proの構造異性化機能をもつのか?」という基本問題に対してさえ明確に答えられないのが現状である。そこで、私は、PPIaseの酵素活性に注目し、基質結合部位に導入した網羅的変異を手がかりに、PPIaseが酵素活性を発現するのに必要な条件を解析してきた。その結果、PPIase活性の発現には側鎖の関与は必ずしも必要とされず、適当なサイズのポケットだけがあれば発現される機能であると推察するに至っれ。この推察を確かめるため、本研究では、PPIase活性を示さないタンパク質としてバルナーゼ用い、アミノ酸残基置換により人為的にポケットを作成し、PPIase活性の発現を調べた。その結果、Phe56Gly/Arg59Gly/His102Tyr/Tyr103Glyの四重変異により、ポケットを導入したバルナーゼは、野生型FKBPの約4%の活性を示すことがわかった。このようにして、適当なサイズのポケットが存在することがPPIase活性発現に必要十分であることが実際に確認された。そこで、これらの実験結果に基づき、新たにPPIase活性発現機構モデルを提案した。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
A cavity with an apppropriate size is the basis of the PPIase activity.
适当大小的空腔是PPIase活性的基础。
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Protein Engineering, Design, and Selection 21
影响因子:
--
作者:
[Ikura. T., Kinoshita, K., Ito, N.]
通讯作者:
N.
Crystal structural analysis of barnase-barstar interaction destabilized by a mutation.
因突变而不稳定的芽孢杆菌RNA酶-芽孢杆菌星相互作用的晶体结构分析。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
Protein Science (印刷中)
影响因子:
--
作者:
[Urakubo, Y., Ikura, T., Ito, N.]
通讯作者:
N.
DOI:
10.1110/ps.073203707
发表时间:
2007-12-01
期刊:
PROTEIN SCIENCE
影响因子:
8
作者:
[Ikura, Teikichi, Ito, Nobutoshi]
通讯作者:
Ito, Nobutoshi
プロリン異性化酵素活性をもつ蛋白質の発掘
发现具有脯氨酸异构酶活性的蛋白质
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[伊倉貞吉, 木下賢吾, 伊藤暢聡]
通讯作者:
伊藤暢聡
プロリン異性化酵素における触媒機能発現の物理化学的解析
-
批准号:16041210
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$5.82万
-
财政年份:2004
-
负责人:伊倉 貞吉
-
依托单位:
シクロフィリンによるプロリン残基異性化反応の触媒機構の研究
-
批准号:09680647
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
-
资助金额:$1.73万
-
财政年份:1997
-
负责人:伊倉 貞吉
-
依托单位:
スタフィロコッカルヌクレアーゼの変異体の作成と折れたたみ機構の解析
-
批准号:06780525
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$0.7万
-
财政年份:1994
-
负责人:伊倉 貞吉
-
依托单位:
海外基金