四重鎖DNAを利用したヘム錯体の空間配列制御とヘム核酸創製
四重鎖DNAを利用したヘム錯体の空間配列制御とヘム核酸創製
批准号:
18033006
负责人:
山本 泰彦
金额:
$2.43万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
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四重鎖DNAにおける自己組織化を利用してヘムの空間配置を制御し、調製される新規"ヘム核酸"の構造と機能の相関関係を解析することにより、ヘム核酸を新規機能性材料として展開するために必要な基礎的知見を得ることを目的に研究を行った。四重鎖DNAを構成するG・カルテットとヘムがほぼ同じ大きさのπ平面をもっことから、疎水性相互作用とヘム鉄への核酸塩基の配位により、ヒト染色体末端におけるテロメア部位の基本配列であるd(TTAGGG)により形成される平行型四重鎖DNA[d(TTAGGG)]_4はヘムと1:1複合体を形成することを見いだしている。また、[d(TTAGGG)]_4は、3'-末端のG-カルテットの分子間スタッキングにより二量化することも明らかにしている。本研究では、これらの知見に基づいて、四重鎖DNAを利用してヘム錯体の空間配列制御とヘム核酸の創製を行う。具体的には、四重鎖DNAの二量化反応などを利用し、2つのヘムを0.7-1.5nmの範囲に配置した複合体を調製し、ヘム間の相互作用について検討した。その結果、DNA塩基配列の選択により四重鎖DNAにヘム2分子を導入することが可能であることを見いだすと共に、四重鎖DNAの安定二量体を形成させる方法開発し、ヘムの空間配置を制御するための基礎的知見を得ることができた。また、ヘム核酸の軸配位子と酸化還元電位の関係:H_2O(orvacant)、イミダゾール、メルカプトエタノールを第六配位子としてもつヘム核酸それぞれの酸化還元電位(Em)をSquare wave voltammetry法により測定した(Em=-91mV(H_2O or vacant),Em=-145mV(イミダゾール),Em=90mV(メルカプトエタノール))が得ら、ヘム核酸においてもヘムタンパク質と同様に、第六配位子の元素がS、O、Nの順にEmが低下することが確認された。このように、軸配位子の交換によりさまざまな酸化還元電位を示すヘム核酸を創製できることも明らかにした。
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Thermodynamics of dimerization of parallel G-quadruplex DNAs through the end-to-end stacking of 3'-terminal G-quartets
通过 3 端 G 四联体的端到端堆叠实现平行 G 四联体 DNA 二聚化的热力学
DOI:
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发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[N. Sakuma, M. Ozawa, S. Kawano, H. Mita, H. Hemmi, and Y. Yamamoto]
通讯作者:
and Y. Yamamoto
Field dependence study of 19F NMR signal of hemoprotein recomstituted with a ring fluorinalted heme
用环状氟化血红素重组血红素蛋白的 19F NMR 信号场依赖性研究
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T, Miyazaki]
通讯作者:
Miyazaki
Local conformational transition of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 relevant to its redox potential
嗜热氢杆菌细胞色素 c552 的局部构象转变与其氧化还原电位相关
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biochemistry 46
影响因子:
--
作者:
[S. J. Takayama, Y. Takahashi, S. Mikami, K. Irie, S. Kawano, Y. Yamamoto, H. Hemmi, R. Kitahara, S. Yokoyama, and K. Akasaka]
通讯作者:
and K. Akasaka
^19F NMR study of the acid-alkaline transition of metmyoglobin and methemoglobin bearing a fluorinated heme
^19F NMR 研究高铁肌红蛋白和带有氟化血红素的高铁血红蛋白的酸碱转变
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T. Shibata, K. Mizuseki, S. Nagao, Y. Hirai, S. Kawano, S, Nagatomo, Y. Yamamoto, and A. Suzuki]
通讯作者:
and A. Suzuki
Dimerization of Parallel G-quadruplex DNAs Formed from d(TTAG3)and the Related Sequences
d(TTAG3) 形成的平行 G-四链体 DNA 的二聚化及相关序列
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sakuma, N.]
通讯作者:
N.
共 19 条
孤立した水分子によるヘム核酸複合体の触媒作用調節機構の解明と機能創発への応用
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批准号:22K05308
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2022
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
ヘム-核酸複合体の創製と機能制御
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批准号:17655072
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.79万
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财政年份:2005
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
フレッシュコンクリートの材料分離挙動に関する物性論的アプローチ
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批准号:03F00157
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.38万
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财政年份:2003
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
フレッシュコンクリートの材料分離挙動に関する物性論的アプローチ
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批准号:03F03157
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2003
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
疎水性コア構造変換によるヘムタンパク質の耐熱性発現機構の解明
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批准号:14045203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2002
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
耐熱性ヘムタンパク質の構造安定化に寄与する疎水性コアの構造とダイナミクスの解析
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批准号:13031005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2001
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
ヘム蛋白質,ヘム酵素の生理活性部位のNMRによる新規な構造決定法の構築
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批准号:05750797
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
ヘムタンパク質の生理活性中心部位及び近傍の微細構造決定
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批准号:63750846
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1988
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
減水剤を用いた高強度コンクリートにおけるシリカ質混和材の活用
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批准号:X00210----275258
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.25万
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财政年份:1977
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负责人:山本 泰彦
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依托单位:
海外基金