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蛋白質凝集体モデル結晶の表面における水和構造とその生理活性に及ぼす影響

蛋白质聚集体模型晶体表面水化结构及其对生理活性的影响

基本信息

批准号：
19029015
负责人：
玉井良則
金额：
$ 1.22万
依托单位：
University of Fukui
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19029015/
关键词：
蛋白質計算物理化学物理シミュレーション生物物理

项目摘要

アミロイド線維は,βシートコンホーメーションをとった蛋白質が多数集積して形成された,マイクロメートルオーダーの線維状集積体である。脳内に蓄積することにより,アルツハイマー病や狂牛病などの神経変性疾患の原因となる。このため,凝集体形成のメカニズムや凝集体が生理活性に及ぼす影響を明らかにすることが急務となっている。最近,蛋白質凝集体を対象とした生物化学的な実験が多数行われているが,これらのメカニズムを解明するためには,物理化学的な観点からの研究が欠かせない。たとえば,凝集体の核形成とその安定性,臨界核の成長,線維状凝集体が細胞内溶液に及ぼす摂動の効果,および,これらに対する水分子の役割などである。これらの現象に対して,本研究では,高分子物理化学の立場からのアプローチを行っている。今年度の課題研究においては,アミロイド線維のモデルとしてポリ-L-グルタミンをとりあげ,分子動力学(MD)シミュレーションを用いて,凝集体表面の溶媒和構造を解析し,凝集体が水の構造やダイナミックスに及ぼす影響を明らにした。さらに,種々の生理活性分子の水和構造が凝集体の形成する分子場から受ける影響を調べるために,神経伝達物質として知られるドーパミンを対象として,分子軌道法(MO)計算により水和構造の解析を行った。さらに,ドーパミン水溶液についてMDシミュレーションを行い,MO計算との対応について検討した。また,医学的により実際的な系として,アルツハイマー病アミロイドβ(Aβ)蛋白質凝集体の水和構造の解析にも着手した。

In the first place, the majority of the proteins were collected. The majority of the samples were collected. The majority of the samples were collected to form an active body. The cause of the sexual disease was known as mad cow disease, mad cow disease and sexual disease. The formation of the condensate, the physiological activity of the coagulant, the physiological activity and the physiological activity of the coagulum. Recently, protein agglutination is similar to that of biochemistry, and most of the lines of biochemistry have not been studied in this way. The condensate nucleus forms the stability of the condensate, the growth of the boundary nucleus, the accumulation of the intracellular solution and the activity of the condensate, the condensation of the condensate, the condensation of the condensate, the formation of the nucleus of the condensate, the formation of the nucleus of the condensate, the growth of the nucleus of the condensate, the intracellular solution of the condensate and the activity of the condensate. In this study, the physical and chemical properties of polymers are studied. This year's problem research project was completed. This year, the molecular dynamics (MD), the solvent and the analysis of the condensate surface, and the water of the condensate were used in this year's research. Compounds, physiologically active molecules such as water and agglutination collectives form molecular fields that are affected by environmental impact. God knows that the molecular field is sensitive to environmental pollution, the molecular pathway method (MO) is used to calculate the molecular water, and the molecular pathway method (MO) is used to calculate the molecular water and create the analytical instrument. In the case of aqueous solution, the MD solution is in good condition. The MO calculates the temperature difference between the two groups. Medicine, medical science, medical science, medicine, medicine, medicine and medicine.