RIG-I、MDA-5からIRF-3に至るシグナル伝達の構造生物学

RIG-I、MDA-5 到 IRF-3 信号转导的结构生物学

• 批准号: 19041003
• 负责人: 稲垣 冬彦
• 金额: $ 4.8万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19041003/
• 关键词: ウイルス感染; RIG-1; MDA-5; LGP2; RNA結合ループ; dsRNA; 5'ppp-ssRNA; 二重連鎖DNA

RIG-I like receptor(RIG-I, MDA5, LGP2)は細胞内に侵入したウィルス由来の二重鎖RNA(dsRNA)や5'ppp-ssRNAを認識し、IFN産生を促す細胞質内レセプターである。それぞれ異なるタイプのウィルスを認識することが知られている。我々は、これらのタンパク質に比較的保存されたC末端ドメイン(CTD)を見出し、このドメインの構造をNMR法により決定した。ついで、dsRNA, 5'ppp-ssRNAを適定し、化学シフト変化より、RNA結合部位を同定するとともに、RNA認識の分子機構の解明を行った。RIG-I, MDA5, LGP2のCTDドメインはともによく似た立体構造を取っていた。分子中央部には塩基性の表面が存在し、良く保存された塩基性残基が存在していた。RIG-I, LGP2では、溝の一方の壁を形成するRNA結合ループが立ち上がり、比較的深い溝が形成されるのに対し、MDA5ではRNA結合ループはフラットな形状をとり浅い溝が認められるにすぎない。dsRNA, 5'ppp-ssRNAとRIG-I, MDA5, LGP2の結合をSPRにより測定したところ、RIG-I, LGP2はともに強くRNAを結合するのに対し、MDA5はほとんど結合しなかった。RNA結合ループがRNA結合に重要な役割を果たしていることがわかる。実際、RIG-I, LGP2に保存されたRNA結合ループ上のPheに変異を加えると、RNAの結合は認められなかった。今回の結果より、RLRによるウィルスの識別がCTDにより行われていることが明らかとなった。

RIG -i like receptor (RIG -i, MDA5 and LGP2) に は cell invasion し た ウ ィ ル ス origin の RNA (dsRNA) や 5 'double lock the PPP - ssRNA を know し, to promote the cytoplasm レ す IFN produce を セ プ タ ー で あ る. そ れ ぞ れ different な る タ イ プ の ウ ィ ル ス を know す る こ と が know ら れ て い る. I 々 は, こ れ ら の タ ン パ ク qualitative に compare save さ れ た C terminal ド メ イ ン (CTD) を see し, こ の ド メ イ ン の tectonic を NMR method に よ り decided し た. つ い で, dsRNA, 5 'PPP - ssRNA を well-posed し, chemical シ フ ト variations change よ り, rna-binding part を with す る と と も に, RNA known の molecular institutions の interpret を line っ た. RIG-I, MDA5, LGP2 is based on CTDドメ and <s:1> と と によく によく similar to た solid structures を take って た た た. In the central part of the molecule, the に に basic <s:1> surface が has が, and the された well-preserved された basic residue が has て て た た. RIG -i and LGP2 で は, ditch の の party developed を す る rna-binding ル ー プ が stand on ち が り, comparative deep い ditch が form さ れ る の に し, seaborne MDA5 で は rna-binding ル ー プ は フ ラ ッ ト な shape を と り shallow い ditch が recognize め ら れ る に す ぎ な い. DsRNA, 5 'PPP - ssRNA と RIG -i, MDA5 and LGP2 の combining を SPR に よ り determination し た と こ ろ, RIG -i and LGP2 は と も に を combined with strong く RNA す る の に し, seaborne MDA5 は ほ と ん ど combining し な か っ た. Rna-binding ル ー プ が rna-binding に important な "を cut fruit た し て い る こ と が わ か る. Be international, RIG -i and LGP2 に save さ れ た rna-binding ル ー プ の on Phe に - different を plus え る と, RNA の combining は め ら れ な か っ た. Today back to の results よ り, RLR に よ る ウ ィ ル ス の recognition が CTD に よ り line わ れ て い る こ と が Ming ら か と な っ た.

项目成果

RIG-I C末端側ドメインの機能解析

RIG-I C端结构域的功能分析

• 发表时间: 2008
• 作者: Ebihara;T.;Seya;T. et.al.;高橋清大
• 通讯作者: 高橋清大

Grb2 SH2の構造を基盤とした抗ガン剤の設計

基于Grb2 SH2结构的抗癌药物设计

• 发表时间: 2007
• 期刊: 医薬ジャーナル 43
• 作者: Unezaki S;Ito S (5人中5番目);et al.;関谷敬;Hiroko Miyauchi-Hashimoto;稲垣冬彦
• 通讯作者: 稲垣冬彦

オートファジーの構造生物学

自噬的结构生物学

• 发表时间: 2007
• 期刊: 生物物理 47
• 作者: Brownstein CA;Adler F;Nelson-Williams C;Iijima J;Li P;Imura A;Nabeshima Y;Reyes-Mugica M;Carpenter TO;Lifton RP.;鈴木展生
• 通讯作者: 鈴木展生

NMR構造生物学の新展開

核磁共振结构生物学新进展

• 发表时间: 2008
• 作者: Ohnishi;T.;稲垣冬彦;稲垣冬彦
• 通讯作者: 稲垣冬彦

構造が解き明かすアダプター蛋白質Crkの癌化機構

其结构揭示接头蛋白Crk的致瘤机制

• 发表时间: 2008
• 期刊: 蛋白質核酸酵素 53
• 作者: Seya;T. et.al.;小橋川敬博
• 通讯作者: 小橋川敬博