異質倍数化による適応放散 : ゲノム障壁の打破がもたらす植物多様化の過程

通过异源多倍化的适应性辐射：打破基因组障碍带来的植物多样化过程

• 批准号: 19043010
• 负责人: 工藤 洋
• 金额: $ 11.26万
• 依托单位: Kyoto University (2008)Kobe University (2007)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19043010/
• 关键词: 植物; 進化; 遺伝学; ゲノム; 生物多様化; 異質倍数体; 適応放散; アプナラ科; タネツケバナ属; シロイヌナズナ属

本研究では、モデル植物シロイヌナズナのゲノム情報を活用できるシロイヌナズナ属とタネツケバナ属の野生種を用いて、ゲノム倍数化・受精前隔離・受精後隔離・自家不和合性といったゲノム障壁を担う遺伝子を解析するとともに、その進化生態的な機能を評価することを目的とした。(1) タネツケバナ属の種分化を解析するため、推定両親種を判定して異質倍数種を同定するマーカーをMYB2のフランキング領域の変異を用いて作成した。この領域は、種内で比較的変異が少なく、種特異的な配列長変異で特徴付けられ、少なくともこれまで研究対象としてきた4倍体種の判別には有効に用いることができるマーカーを開発した。さらに異質4倍体種と両親種2種(乾燥地の一年草種と湿地の多年草種)の3種1組を対象とした比較栽培試験を3組み合わせについて実施した。異質倍数体が乾燥と湿地条件が繰り返される変動条件においても旺盛に生育可能であることが明らかになった。今後、それぞれの環境下での遺伝子発現プロファイルを比較する予定である。2名のポスドク研究員は、スイス・チューリッヒ大学清水健太郎博士の研究室において、複数の低コピー核遺伝子の配列情報から属内の系統樹を作成するとともに、自家不和合性のスクリーニングを行った。その結果、タネツケバナ属において、不和合性が繰り返し進化したことが示唆された。(2) シロイヌナズナ属4倍体ミヤマハタザオの分布域全域かちサンプルについて複数の核遺伝子を解析した。この結果、ミヤマハタザオが異質倍数体であること、さらに倍数化が複数回起源したことが強く示唆された。

The purpose of this study is to evaluate the use of information on plant species, the use of wild species, the use of ploidy, pre-fertilization isolation, post-fertilization isolation, self-incompatibility, the analysis of genetic barriers, and the function of evolutionary ecology. (1)The species differentiation of the genus MYB is determined by the identification of the parent species MYB is determined by the identification of the parent species MYB is determined by the identification of the parent species MYB. The difference between the domain and the intraspecies is small, and the species-specific sequence length is small. A group of 3 species of heterotetraploid species and 2 parent species (annual species in dry land and perennial species in wet land) were compared with each other in the comparative cultivation test. heteroploidy In the future, there will be a comparison between the development of genetic materials in different environments. Two researchers from the laboratory of Dr. Kentaro Shimizu of the University of Tokyo conducted research on the generation of phylogenetic trees for multiple low level nuclear sequences. The result is that the property is not stable, and the property is not stable. (2)The analysis of tetraploid DNA in the genus The result is that the heteroploid is not the same as the heteroploid.

项目成果

Breeding system of the annual Cruciferae, Arabidopsis kamchatica ssp. Kawasakiana

一年生十字花科植物拟南芥 (Arabidopsis kamchatica ssp) 的育种系统。

• 发表时间: 2008
• 期刊: Journal of Plant Research 121
• 作者: Sugisaka;J. & Kudoh;H.
• 通讯作者: H.

Evolution and control of imprinted FWA genes in the genus Arabidopsis.

• DOI: 10.1371/journal.pgen.1000048
• 发表时间: 2008-04-04
• 期刊: PLoS genetics
• 影响因子: 4.5
• 作者: Fujimoto R;Kinoshita Y;Kawabe A;Kinoshita T;Takashima K;Nordborg M;Nasrallah ME;Shimizu KK;Kudoh H;Kakutani T
• 通讯作者: Kakutani T

Habitat exploitation and diversification through inter-ecological type allopolyploidization

通过生态间型异源多倍化进行栖息地开发和多样化

• 发表时间: 2008
• 作者: Kudoh;H.
• 通讯作者: H.