In silico解析とin vitro解析によるRNAスプライシング機構の研究

RNA剪接机制的计算机和体外分析研究

• 批准号: 20016011
• 负责人: 大野 欽司
• 金额: $ 4.86万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20016011/
• 关键词: スプライシング遺伝子変異; 3'スプライスサイト; スプライシングブランチポイント; siRNA設計アルゴリズム

スプライシング異常を惹起するエクソン5'末端遺伝子変異の予測アルゴリズムの構築を試みた。ヒトゲノム上に存在するすべてのスプライス受容部位の解析にてエクソン5'味端の塩基がGの時ポリピリミジントラクトが短いことを明らかにした。つまり、ポリピリミジントラクトが長いイントロンはAG-independentであり、スプライセオソーム集合の第1段階においてU2AF35を必要としないために、エクソン5'味端のGを必要としない。次にエクソン5'末端のGの変異がエクソンスキッピングを起こすFECH, GHI, EYA1遺伝子においてそれぞれ13,15,10塩基以上のポリピリミジンストレッチを導入することによりスプライシングが正常化することを見出した。一方、遺伝子変異がエクソンスキッピングを起こさないLPL, HEXA遺伝子においてはポリピリミジントラクトを徐々に短縮させることにより、両者とも正常なsplicingのためには10塩基以上のポリピリミジンストレッチが必要であることが判明した。さらにミスセンス変異として報告をされた6種類の既報告遺伝子変異がスプライシング異常を起こす変異であることを新たに見出した。さらに、エクソン5'末端の変異がエクソンスキッピングを起こすイントロンにおいてはU2AF65とのin vitro結合能が低下していることを認めた。また、AG-dependent3'スプライスサイトにおいてはU2AF35のノックダウンにてエクソンスキッピングが誘導され仮説が実証された。

Please tell me that there is a problem at the end of 5'. Please do not know if you are going to make an attempt. There is a problem that there is an error in the tolerance part of the system. This is the most important part of the system. In this case, there is a problem that there is a problem in the tolerance part of the system. The first paragraph of the collection, the first paragraph of the AG-independent collection, the first paragraph of the collection. At the end of 5', there are some questions about FECH, GHI, EYA1, and so on. At the end of the day, there is no question of whether to normalize or normalize. On the other hand, the child

项目成果

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SD 分数网络服务

hnRNP H enhances skipping of a nonfunctional exon P3A in CHRNA1 and a mutation disrupting its binding causes congenital myasthenic syndrome

• DOI: 10.1093/hmg/ddn305
• 发表时间: 2008-12-15
• 期刊: HUMAN MOLECULAR GENETICS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Masuda, Akio;Shen, Xin-Ming;Ohno, Kinji
• 通讯作者: Ohno, Kinji

Alu-Mediated Acquisition of Unstable ATTCT Pentanucleotide Repeats in the Human ATXN10 Gene

• DOI: 10.1093/molbev/msp172
• 发表时间: 2009-11-01
• 期刊: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION
• 影响因子: 10.7
• 作者: Kurosaki, Tatsuaki;Matsuura, Tohru;Ueda, Shintaroh
• 通讯作者: Ueda, Shintaroh

Myasthenic syndrome due to defects in rapsyn Clinical and molecular findings in 39 patients

• DOI: 10.1212/wnl.0b013e3181ae7cbc
• 发表时间: 2009-07-21
• 期刊: NEUROLOGY
• 影响因子: 9.9
• 作者: Milone, M.;Shen, X. M.;Engel, A. G.
• 通讯作者: Engel, A. G.