水素代謝に関与する膜タンパク質複合体の構造化学的研究
水素代謝に関与する膜タンパク質複合体の構造化学的研究
批准号:
20051022
负责人:
庄村 康人
金额:
$1.98万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009
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英文摘要
原核生物における水素代謝は,水素分子の酸化によるエネルギーの獲得と酸化還元電位の調節に関与しており,細胞の恒常性を維持する上で基本的且つ重要な機構として知られている.次世代型エネルギーとして期待される水素を生物工学的に効率よく利用するためには,これらの代謝経路を原子レベルで解明することが不可欠である.本研究では,主にヒドロゲナーゼと電子伝達体の複合体について,立体構造および詳細な反応機構の解明に取り組んできた.今年度の第一の成果は,チトクロームb共役型[NiFe]ヒドロゲナーゼの触媒部位の結晶構造の決定である.水素酸化細菌より単離された本酵素は,水素をエネルギー源として用いるのに必須であり,高い酸素耐性を持つという特徴がある.これまでに唯一結晶構造が報告されている硫酸還元菌由来の[NiFe]ヒドロゲナーゼは可溶性のチトクロームcを電子受容体とし,ヘテロ2量体を機能単位とするが,今回構造を決定した水素酸化細菌由来ヒドロゲナーゼはヘテロ2量体の2量体という会合状態をとっていた.また,チトクロームbとの3者複合体は溶液中ではヘテロ3量体の2量体として存在している事が明らかとなり,得られた結晶構造は溶液中での会合状態を反映していることが示唆された.この2量体化によって活性部位への気体分子の進入がより制限されている様子が明らかになり,本酵素の高い酸素耐性と熱安定性を議論する上での基盤となった.また,精製酵素のEPRスペクトルは活性中心のニッケルの酸化状態は酸化型,還元型ともに3価であり,COの結合ではスペクトルの形状が大きく変化しないことを示したが,結晶構造解析もこれと矛盾しない結果となった.その他にも,6Cys-[4Fe3S]クラスターなどこれまでに例の無い興味深い構造的特徴が見られた.
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異化型亜硫酸還元酵素のX線結晶構造解析
分解代谢亚硫酸盐还原酶的X射线晶体结构分析
DOI:
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发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
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作者:
[Kosugi M, Katashima Y, Aikawa S, Tanabe Y, Kudoh S, Kashino Y, Koike H, Satoh K, 庄村康人]
通讯作者:
庄村康人
生物系ビ-ムラインでの利用を目的としたキャピラリ-マウントシステムの開発
开发用于生物束线的毛细管安装系统
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[清水敏之, 佐藤衛, 庄村康人]
通讯作者:
庄村康人
異化型亜硫酸還元酵素の構造化学的研究
分解代谢亚硫酸盐还原酶的结构化学研究
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Nagao R, Tomo T, Noguchi E, Nakajima S, Suzuki T, Okumura A, Kashino Y, Mimuro M, Ikeuchi M, Enami I, 庄村康人]
通讯作者:
庄村康人
Structural studies on dissimilatory sulfite reductase
异化亚硫酸还原酶的结构研究
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shomura, Y.]
通讯作者:
Y.
鉄ニッケル型ヒドロゲナーゼの金属クラスター形成における構造生物学的研究
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批准号:18054029
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2006
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负责人:庄村 康人
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依托单位:
海外基金