Volvoxの多細胞体制構築機構の解明を目指したMicroRNAの網羅的解析

MicroRNA综合分析旨在阐明Volvox多细胞结构的构建机制

• 批准号: 15030223
• 负责人: 井川 善也
• 金额: $ 4.1万
• 依托单位: Kyushu University (2004)Kyoto University (2003)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15030223/
• 关键词: 系統進化; microRNA; RNA干渉; 緑藻; 多細胞; マイクロRNA; RNA; volvox; chlamydomonas

単細胞生物クラミドモナスとその近縁種である、もっとも単純な多細胞生物であるボルボックスは緑藻植物ボルボックス目の多細胞化過程を反映していると考えられている。本研究ではこれらに存在すると予想されるMicroRNAを同定し、2種間での配列比較、発現部位、時期の検討、比較を通じてMicroRNAレベルでの両生物の共通性と特異性を明らかにすることを目的とした。H15年度の研究で、クラミドモナスおよびボルボックスから低分子RNAを純度良く単離するプロトコルを確立し、両生物から複数のMicroRNA候補配列を同定した。H16年度は引き続いてMicroRNA候補配列の同定を継続し、最終的に両生物種から各約100ずつの候補配列を同定した。その後データベースによる検索でそれぞれ候補配列を約30に絞った後、ノザン解析によってそれらの配列中、実際にMicroRNAの鎖長で発現しているクローンを検索した。その結果、両生物からそれぞれ2-3の配列を同定することができたが、両種間で配列に共通性は見られなかった。それらのクローン中クラミドモナスにおいて最も強く発現していたクローンについてゲノムプロジェクトのデータベースから前後の配列を同定し、前駆体RNAの二次構造予測を行った結果、MicroRNAで見られるヘアピン型の前駆体構造をとることが明らかとなった。現在、さらにクローンの数を増やすと共に、発現しているMicroRNAをより直接的に単離、同定する新しい手法の開発を試みている。

The process of polycytization is reflected in the process of polycytization of the order of the alga. In this study, there are many reasons why you would like to use the same MicroRNA protocol, 2-year alignment ratio, detection site, time interval, and biological commonality in this study. The purpose of this study is to understand the purpose of this study. In the H15 study, the molecular weight of low molecular weight RNA was detected in the study, and the biological complex MicroRNA candidate was assigned to the same sequence. In the year H16, there are about 100 million MicroRNA candidates for each of the most advanced biological species, and the same number of candidates. In the future, we need to make sure that we are waiting for more than 30 years, and then we will find that we are in the middle of the train, and the international MicroRNA manager will be able to find out how much money we need. According to the results of the test, the same number of computers were assigned to each other in the second and third class of the biological system, and the common characteristics of the two groups were assigned to each other. This is the most important thing in this paper. The most important thing is to make sure that you have the same configuration before and after the configuration. The front and back parts of the RNA are used for the second time. The results show that the results are the same, and the results of the front and back parts are the same. The results of the results show that the front parts of the MicroRNA system are made in the first place, and the results are made in the first place. At present, it is necessary to make a number of negotiations, to make a direct departure from the MicroRNA, and to open a trade agreement with the new method of the agreement.

项目成果

リボザイムの分子設計法-RNA構造情報の分子デザインへの還元-

核酶的分子设计方法-将RNA结构信息还原为分子设计-

• 发表时间: 2004
• 期刊: 実験医学(増刊) 22・7
• 作者: 井川善也;井上丹
• 通讯作者: 井上丹

Ikawa, Y., Inoue, T.: "Designed structural rearrangement of an active group I ribozyme"Journal of Biochemistry (Tokyo). 133. 189-195 (2003)

Ikawa, Y., Inoue, T.：“活性 I 族核酶的设计结构重排”生物化学杂志（东京）。

De novo synthesis and development of an RNA enzyme

• DOI: 10.1073/pnas.0405886101
• 发表时间: 2004-09-21
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Ikawa, Y;Tsuda, K;Inoue, T
• 通讯作者: Inoue, T

Artificial modules for enhancing rate constants of a group I intron ribozyme without a P4-P6 core element

用于增强没有 P4-P6 核心元件的 I 组内含子核酶速率常数的人工模块

• 发表时间: 2004
• 期刊: Journal of the Biological Chemistry 279
• 作者: Ohuchi;SJ.;Ikawa;Y.;Shiraishi.H.;Inoue.T.
• 通讯作者: Inoue.T.

A ligase ribozyme obtained from a structural pool

从结构池中获得的连接酶核酶

• 发表时间: 2004
• 期刊: Nucleic Acids Research Symposium Series 48
• 作者: Yoshioka;Y.;Ikawa;Y.;Iaeger;L.;Inoue;T.
• 通讯作者: T.