新規リボソーム合成翻訳後修飾型ペプチドハイブリッド化合物の生合成研究
新規リボソーム合成翻訳後修飾型ペプチドハイブリッド化合物の生合成研究
批准号:
17K15243
负责人:
菅井 佳宣
金额:
$2.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-01 至 2018-03-31
中文摘要
放線菌Streptomyces sp. TP-A0584のゲノム中に存在するリボソーム合成翻訳後修飾ペプチド (RiPPs)-ポリケタイドハイブリッド化合物生合成遺伝子クラスターの解析を行った。これまでに行われた異種発現実験により、予想されたハイブリッド型化合物が生産されることが示唆されていた。そこでこの生合成遺伝子クラスターの機能を解析するために、特にペプチド部分の構造解析と生合成機構解明に取り組んだ。コスミド上で複数の遺伝子を破壊し異種発現を行なったところ、ペプチド部分のみを蓄積する破壊株 (Δorf14) を見出した。その破壊株の培養液から単離・精製した目的ペプチド化合物を、高分解能質量分析と各種NMR解析に供し、その構造を決定した。この分子中にはaminovinyl-cysteineとlanthionine構造が融合した新規構造が含まれていた。この新規構造の生合成機構を解明するために、無細胞翻訳系と組換え修飾酵素を組合せることで生合成経路の試験管内再構成を行なった。構築した系を用いて、組み換え修飾酵素の機能解析を行なったところ、2種類の修飾酵素が協働して機能することにより新規構造が形成されることが示され、生合成機構を解明することに成功した。また、ペプチド部分と脂肪酸・ポリケタイド部分を融合させる酵素に関しても解析を行なった。配列情報から、上述の実験で破壊した遺伝子 (orf14) はペプチドのN末端にポリケタイドアシル鎖を転移させると予想された。そこでこの組換え酵素を調製し、結晶構造解析を行なった。その結果、再現性良く結晶が得られる条件を見出し、得られた結晶から3.5 オングストロームの分解能の結晶構造を得ることに成功した。これら実験結果は新規ペプチド構造の創製や、ハイブリッド化によるペプチド化合物の構造多様性の拡大のための基盤となることが期待される。
英文摘要
放線菌Streptomyces sp. TP-A0584のゲノム中に存在するリボソーム合成翻訳後修飾ペプチド (RiPPs)-ポリケタイドハイブリッド化合物生合成遺伝子クラスターの解析を行った。これまでに行われた異種発現実験により、予想されたハイブリッド型化合物が生産されることが示唆されていた。そこでこの生合成遺伝子クラスターの機能を解析するために、特にペプチド部分の構造解析と生合成機構解明に取り組んだ。コスミド上で複数の遺伝子を破壊し異種発現を行なったところ、ペプチド部分のみを蓄積する破壊株 (Δorf14) を見出した。その破壊株の培養液から単離・精製した目的ペプチド化合物を、高分解能質量分析と各種NMR解析に供し、その構造を決定した。この分子中にはaminovinyl-cysteineとlanthionine構造が融合した新規構造が含まれていた。この新規構造の生合成機構を解明するために、無細胞翻訳系と組換え修飾酵素を組合せることで生合成経路の試験管内再構成を行なった。構築した系を用いて、組み換え修飾酵素の機能解析を行なったところ、2種類の修飾酵素が協働して機能することにより新規構造が形成されることが示され、生合成機構を解明することに成功した。また、ペプチド部分と脂肪酸・ポリケタイド部分を融合させる酵素に関しても解析を行なった。配列情報から、上述の実験で破壊した遺伝子 (orf14) はペプチドのN末端にポリケタイドアシル鎖を転移させると予想された。そこでこの組換え酵素を調製し、結晶構造解析を行なった。その結果、再現性良く結晶が得られる条件を見出し、得られた結晶から3.5 オングストロームの分解能の結晶構造を得ることに成功した。これら実験結果は新規ペプチド構造の創製や、ハイブリッド化によるペプチド化合物の構造多様性の拡大のための基盤となることが期待される。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Biosynthetic Studies on the Class III Lantipeptide Synthetase Found in the Goadsporin Producing Strain Streptomyces sp. TP-A0584.
产高孢菌素菌株链霉菌中 III 类羊毛肽合成酶的生物合成研究。
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yoshinori Sugai, Shumpei Asamizu, Hiroyasu Onaka]
通讯作者:
Hiroyasu Onaka
RiPP-polyketideハイブリッド化合物の生合成に関与する GNAT型アシル基転移酵素の解析
RiPP-聚酮化合物生物合成中涉及的 GNAT 型酰基转移酶分析
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[菅井 佳宣, 千田 美紀, 小野 拓人, 浅水 俊平, 千田 俊哉, 尾仲 宏康]
通讯作者:
尾仲 宏康
菅井佳宣、江畑一真、浅水俊平、後藤佑樹、菅裕明、尾仲宏康
菅井义信、江端田一马、麻美俊平、后藤佑树、菅义伟、小中博康
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Enomoto Gen, Okuda Yukiko, Ikeuchi Masahiko, Yue Chen,Takuya Katayama,Ozgur Bayram,Gerhard H. Braus,Katsuhiko Kitamoto,Jun-ichi Maruyama, 新規decarboxydehydrolabionin構造の形成に関与するlanthipeptide合成酵素の解析]
通讯作者:
新規decarboxydehydrolabionin構造の形成に関与するlanthipeptide合成酵素の解析
生合成酵素を用いたテルペノイドの酵素的全合成とゲノム科学的新奇生合成遺伝子の探索
-
批准号:10J07977
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$0.9万
-
财政年份:2010
-
负责人:菅井 佳宣
-
依托单位:
国内基金
海外基金
登录
查看更多内容
新型肝脏类器官培养体系的建立及其在花色
苷等天然物质功能评价中的应用
-
批准号:HZSZ24C200002
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:--
-
批准年份:2024
-
负责人:伍义行
-
依托单位:
PPARγ2-PTEN信号轴调制人前列腺癌变细胞程序性坏死(necroptosis) 的分子机制及其化学预防应用
-
批准号:81874171
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:53.0万元
-
批准年份:2018
-
负责人:董福禄
-
依托单位:
细菌基因组歧化和遗传界限的产生:新物种形成的分子基础
-
批准号:31600001
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:21.0万元
-
批准年份:2016
-
负责人:唐乐
-
依托单位:
基于炔丙醇为原料的若干天然物和药物的合成
-
批准号:21272190
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:80.0万元
-
批准年份:2012
-
负责人:詹庄平
-
依托单位:
以糖为手性源的新骨架天然物Dinemasones的合成及抗菌活性研究
-
批准号:81273369
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:90.0万元
-
批准年份:2012
-
负责人:李中军
-
依托单位:
沙漠芦苇特有的一高丰度天然产物及其在抗逆性中的意义
-
批准号:39870062
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:14.0万元
-
批准年份:1998
-
负责人:浦铜良
-
依托单位:
天然药物对植物病毒核酸的选择性抑制
-
批准号:39770844
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:9.0万元
-
批准年份:1997
-
负责人:李重九
-
依托单位:
从天然物中寻找神经生长因子诱导剂(NGF-inducers)研究
-
批准号:39670089
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:9.0万元
-
批准年份:1996
-
负责人:闵知大
-
依托单位:
植物花叶病毒病化学防治的探讨
-
批准号:39570488
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:9.0万元
-
批准年份:1995
-
负责人:李重九
-
依托单位:
微量或超微量天然物质的结构鉴定与分离技术
-
批准号:29132054
-
项目类别:重点项目
-
资助金额:6.0万元
-
批准年份:1991
-
负责人:陈耀祖
-
依托单位: