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P型イオンポンプによる能動輪送機構の構造的解明

P型イオンポンプによる能動輪送機構の構造的解明
P型离子泵主动轮传输机构的结构解析
批准号:
14GS0308
负责人:
豊島 近
金额:
$260.42万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2006

项目摘要

项目成果

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本研究の最大の目標は筋小胞体カルシウムポンプ(ATPase)の反応中間体を結晶化し、原子構造に基づいてポンプの作動機構を明らかにすることであった。分解能が十分でなかったE2・AlFx複合体の結晶性を改良し、反応過程ほぼ全体をカバーする6つの状態に関し2.6Åを越える分解能で構造を決定出来た。しかし、真のE2Pアナログの結晶であるE2・BeFxに関しては不満足なものしか得られていなかった。そこで、研究期間を延長し、強力阻害剤タプシガーギン存在下ではあるが、この状態に関しても2.4Å分解能で構造を決定でき、燐酸化アスパラギン酸の処理と膜内イオン通路の開閉がどう連携しているかをある程度明らかにすることが出来た。第2の柱である計算構造生物学では、特に心筋における調節蛋白として重要なフォスフォランバンの燐酸化による制御に関し徹底的な計算を行い、燐酸化の構造的意味を明らかにした。第3の柱である、発現系に関しては、筋小胞体カルシウムポンプを一残基改変することによって、抗マラリア薬に反応することが判明したので、大量生産・精製を行い結晶化可能な標品を得ることが出来た。また、重金属ポンプに関しては、好熱菌銅イオンポンプCopAに関し、蛋白質分解酵素による限定分解によって、蛋白質のトポロジーは大きく異なるにもかかわらず、カルシウムポンプと同様の構造変化を示すことを明らかにし、未知であったN端末金属結合ドメインの役割をも明らかにした。さらに、細胞質領域の2つのドメインと核酸複合体の高分解能結晶解析に成功した。このように、研究のすべての面で大きく前進した。
期刊论文(22)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1021/ja0427505
发表时间: 2005-04
期刊: Journal of the American Chemical Society
影响因子: 15
作者: [Y. Sugita;N. Miyashita;M. Ikeguchi;A. Kidera;C. Toyoshima]
通讯作者: Y. Sugita;N. Miyashita;M. Ikeguchi;A. Kidera;C. Toyoshima
DOI: 10.1021/bi061255d
发表时间: 2006-11-21
期刊: BIOCHEMISTRY
影响因子: 2.9
作者: [Inesi, Giuseppe, Lewis, David, Prasad, Anand]
通讯作者: Prasad, Anand
C.Toyoshima: "Modeling of the inhibitory interaction of phospholamban with the Ca^<2+>ATPase"Proc.Nat.Acad.Sci.USA. 100. 467-472 (2003)
C.Toyoshima:“受磷蛋白与Ca 2+ ATP酶的抑制相互作用的建模”Proc.Nat.Acad.Sci.USA。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Effects of inhibitors on luminal opening of Ca^<2+> binding sites in an E2P-like complex of sarcoplasmic reticulum Ca^<2+>-ATPase with Be^<2+>-fluoride.
抑制剂对肌浆网Ca^2-ATP酶与Be^2-氟化物的E2P样复合物中Ca^2结合位点的管腔开放的影响。
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: J. Biol. Chem. 281
影响因子: --
作者: [S.Nakajima, D.Yokogawa, Y.Nakao, H.Sato, S.Sakaki, 〓 剣萍, D. Kobayashi, Ryoichiro Suzuki, M. Picard]
通讯作者: M. Picard
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    イオンポンプ蛋白質作動機構の構造的理解の完成とその高次機能の構造生物学への発展
    • 批准号:
      23K27136
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $7.82万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      豊島 近
    • 依托单位:
    Development of artificial reaction intermediates by introduction of steric hindrance
    • 批准号:
      23K18106
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.08万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      豊島 近
    • 依托单位:
    イオンポンプ蛋白質作動機構の構造的理解の完成とその高次機能の構造生物学への発展
    • 批准号:
      23H02443
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.98万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      豊島 近
    • 依托单位:
    薬剤開発を視野に入れたイオンポンプの構造研究
    • 批准号:
      19107005
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
    • 资助金额:
      $25.88万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      豊島 近
    • 依托单位:
    海外基金