Ca-ATPaseの電子線・X線結晶解析

Ca-ATP 酶的电子束/X 射线晶体分析

基本信息

  • 批准号:
    11169205
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 23.62万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1999
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1999 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では、筋小胞体カルシウムATPaseの結晶構造解析により、膜蛋白質の結晶中の脂質二重膜の可視化を主な目標とした。これは、カルシウムATPaseの結晶化にあたって脂質を添加しているために脂質二重膜が形成されていることを利用するものである。脂質二重膜は低分解能領域にしか寄与しないので、普通の結晶解析では棄てている。また、重原子置換体による位相情報は、低分解能領域では信頼性が無い。このために、コントラスト変調法が試みられて来た。また.MAD法(多波調異常分散法)の適用も試みられるべきである。この目的のために、現在最も安定して作成できるカルシウムATPaseの結晶である、Mg/F複合体結晶を用い、庶糖と金グルコースによる密度変調を試みた。この結果,庶糖の方が可変できる範囲は広いものの,格子定数の変化も著しいことがわかった。金グルコースの場合,最大濃度は15%程度であったが,金による異常分散効果を利用できるため,コントラスト変調を用いる必要はない。また、格子定数の変化も無視できる程度であることがわかった。そこで,最大濃度の金グルコースを用いて,SPring-8でMADデータの収集を行った。その結果は現在解析中であるが、統計的には十分な信号が得られた。MADデータから位相を決定することは、重原子位置が離散的でないため無理であるが、蛋白質部分からの位相を改良することは十分可能であろうと考えられる。この部分の方法論はまだ確立していないので、今後の課題としたい。
在这项研究中,主要目标是通过肌质网钙ATPase的晶体学通过晶体学中可视化膜蛋白晶体中的脂质双层膜。这是因为形成脂质双层是因为添加了脂质以结晶钙ATPase。脂质双层仅有助于低分辨率区域,并在普通晶体学中丢弃。此外,在低分辨率区域中,通过重原子取代获得的相信息并不可靠。因此,已经尝试了对比度调制方法。另外,应应用.MAD方法(多色调异常分散法)。为此,我们尝试使用糖和金葡萄糖使用MG/F复合物晶体来调节密度,后者目前是钙ATPase中最稳定的晶体。该结果表明,尽管糖的范围可以更宽,但晶格常数却大大变化。在金葡萄糖的情况下,最大浓度约为15%,但是由于可以利用黄金的异常分散效应,因此不需要对比度调节。还发现晶格常数的变化可以忽略不计。因此,使用弹簧-8使用金葡萄糖的最大浓度收集MAD数据。结果目前正在分析中,但是获得了足够的信号。由于沉重的原子位置不是离散的,因此无法从疯狂数据中确定相位的相位,但是认为从蛋白质部分改善相位是足够的。本节的方法尚未建立,因此我想将其视为将来的问题。

项目成果

期刊论文数量(65)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
J.V.Mφller: "Calcium transport by sarcoplasmic reticulum Ca^<2+>-ATPase : role of the A-domain and its C-terminal link with the transmembrane region"J.Biol.Chem.. 41. 38647-38659 (2002)
J.V.Mφller:“肌浆网Ca ^ 2+ -ATP酶的钙转运:A结构域的作用及其C末端与跨膜区域的连接”J.Biol.Chem.. 41. 38647-38659 (2002)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
江橋節郎: "カルシウムポンプの構造決定"パリティー. 15. 122-124 (2000)
Setsuro Ebashi:“钙泵的结构测定”Parity 15. 122-124 (2000)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
C.Toyoshima: "Modeling of the inhibitory interaction of phospholamban with the Ca^<2+>ATPase"Proc.Nat.Acad.Sci.USA. 100. 467-472 (2003)
C.Toyoshima:“受磷蛋白与Ca 2+ ATP酶的抑制相互作用的建模”Proc.Nat.Acad.Sci.USA。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
C. Toyoshima: "Structure determination of tubular crystals of membrane proteins. I. Indexing of diffraction patterns"Ultramicroscopy. (in press).
C. Toyoshima:“膜蛋白管状晶体的结构测定。I.衍射图样的索引”超显微镜检查。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
K.Yonekura: "Structure determination of tubular crystals of membrane proteins.II.Averaging of tubular crystals of different helical classes."Ultramicroscopy. 84. 15-28 (2000)
K.Yonekura:“膜蛋白管状晶体的结构测定。II.不同螺旋类别管状晶体的平均。”超显微镜检查。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

豊島 近其他文献

X-線結晶構造解析が明かすビセリングビアサイド類のCa2+ポンプ阻害機構
X射线晶体结构分析揭示Bisssel viasides Ca2+泵抑制机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    森田 真布;小川 治夫;杖田 淳子;大野 修;矢守 隆夫;豊島 近;末永 聖武
  • 通讯作者:
    末永 聖武
イオンポンプ蛋白質の構造生物学とSPring-8
离子泵蛋白和 SPring-8 的结构生物学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Arnold Beckmann;Norbert Preining;Naoki Kobayashi;Constantino Calancha;豊島 近
  • 通讯作者:
    豊島 近
雇用・賃金統計に見る先進各国の共通な流れと日本の特異性
从就业和工资统计看发达国家的共同趋势和日本的独特性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ueno;H.;X.Huang;Y.Tanaka;N.Hirokawa;常深博;豊島 近;樋口美雄・佐藤一磨
  • 通讯作者:
    樋口美雄・佐藤一磨
イオンポンプの構造生物学 : 全ての反射点の利用
离子泵的结构生物学:所有反射点的利用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Noda NN;Fujioka Y;Hanada T;Ohsumi Y;Inagaki F.;Ryosho Nakane;豊島 近
  • 通讯作者:
    豊島 近
筋強直性ジストロフィーの病態に関わる筋小胞体Ca2+-ATPase 1スプライスバリアントの機能的差異
肌浆网 Ca2+-ATPase 1 剪接变异体的功能差异参与强直性肌营养不良的病理学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    趙 一夢;小川 治夫;米倉 慎一郎;三橋 弘明;豊島 近;石浦 章一
  • 通讯作者:
    石浦 章一

豊島 近的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('豊島 近', 18)}}的其他基金

イオンポンプ蛋白質作動機構の構造的理解の完成とその高次機能の構造生物学への発展
完成离子泵蛋白运行机制的结构理解,并将其高阶功能发展为结构生物学
  • 批准号:
    23K27136
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of artificial reaction intermediates by introduction of steric hindrance
通过引入空间位阻开发人工反应中间体
  • 批准号:
    23K18106
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
イオンポンプ蛋白質作動機構の構造的理解の完成とその高次機能の構造生物学への発展
完成离子泵蛋白运行机制的结构理解,并将其高阶功能发展为结构生物学
  • 批准号:
    23H02443
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
薬剤開発を視野に入れたイオンポンプの構造研究
以药物开发为目的的离子泵结构研究
  • 批准号:
    19107005
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
P型イオンポンプによる能動輪送機構の構造的解明
P型离子泵主动轮传输机构的结构解析
  • 批准号:
    14GS0308
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
低温電子顕微鏡法による呼吸鎖酵素複合体二次元結晶の三次元構造解析
使用冷冻电子显微镜对呼吸链酶复合物二维晶体进行三维结构分析
  • 批准号:
    05259208
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
低温電子顕微鏡による呼吸鎖酵素複合合体二次元結晶の三次元構造解析
使用冷冻电子显微镜对呼吸链酶复合物二维晶体进行三维结构分析
  • 批准号:
    04266207
  • 财政年份:
    1992
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
氷包埋低温電子顕微鏡によるカルシウムATPaseの三次元構造解析
使用冰包埋冷冻电子显微镜对钙 ATP 酶进行三维结构分析
  • 批准号:
    03680228
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
膜蛋白質筒状結晶の氷包埋法による三次元像再構成法の開発
膜蛋白圆柱晶体冰嵌入三维图像重建方法的发展
  • 批准号:
    02780241
  • 财政年份:
    1990
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
氷に包埋したアクチン・ミオシンの構造の, 対称性を用いない三次元画像解析
不使用对称性对嵌入冰中的肌动蛋白和肌球蛋白结构进行三维图像分析
  • 批准号:
    60780295
  • 财政年份:
    1985
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

Structural biology of active transport and its regulation by P-type ATPases
主动转运的结构生物学及其 P 型 ATP 酶的调控
  • 批准号:
    19H00975
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Fine structures of reaction inter-mediates of bovine cytochrome c oxidase
牛细胞色素c氧化酶反应中间体的精细结构
  • 批准号:
    18K06092
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Structural basis for Na+-selectivity of the sodium pump
钠泵Na选择性的结构基础
  • 批准号:
    18K06148
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Structural physiology of the gastric proton pump
胃质子泵的结构生理学
  • 批准号:
    17H03653
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
structural basis of channelization of Na+-pump by palytoxin
海藻毒素钠泵通道化的结构基础
  • 批准号:
    16K18500
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 23.62万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了