piRNAシステムズバイオロジー：人工産生系を用いた機械学習的アプローチ

piRNA 系统生物学：使用人工生产系统的机器学习方法

• 批准号: 16KT0064
• 负责人: 勝間 進
• 金额: $ 11.9万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-07-19 至 2018-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16KT0064/
• 关键词: piRNA; 小分子RNA; カイコ; BmN-4; ピンポンサイクル; 機械学習; 培養細胞; カイコ培養細胞

小分子RNAの一つであるPIWI-interacting RNA (piRNA)は、生殖細胞において利己的な配列から自身を守る役割を果たす。カイコ培養細胞BmN-4はpiRNAの生合成経路の一つであるピンポンサイクルを保持する細胞である。私たちは、前年度にBmN-4を用いた「人工piRNA産生系」を確立し、それを利用してpiRNA-PIWI複合体の認識に必要な塩基数を同定した（Shoji et al., RNA, 2017）。今年度は以下の知見を得た。1.人工piRNA産生系にランダムなpiRNA前駆体配列を発現するライブラリーを導入し、piRNAの末端付近の規則性について検討した。そこで見出されたルールについて、現在生化学的な検証を行っている。2.BmN-4細胞に持続感染しているカイコマキュラウイルスの量がRNAi及びpiRNA経路によって抑制されていることが明らかになった。現在、論文投稿中である。

Small RNA (piRNA) is a small RNA that interacts with the reproductive cells. A study of the RNA synthesis pathway in cultured BmN-4 cells In the past year, Shoji et al.(Shoji et al., RNA, 2017）。This year, the following knowledge was obtained. 1. Artificial piRNA production is a process for the detection of piRNA precursor alignment and the regular detection of piRNA terminal alignment. This is the first time in history that we have seen such a phenomenon. 2. It is clear that the amount of Now, Paper submission.

项目成果

Artificial "ping-pong" cascade of PIWI-interacting RNA in silkworm cells.

Piwi相互作用RNA在蚕细胞中的人工“乒乓”级联。

• DOI: 10.1261/rna.058875.116
• 发表时间: 2017-01
• 期刊: RNA (New York, N.Y.)
• 作者: Shoji K;Suzuki Y;Sugano S;Shimada T;Katsuma S
• 通讯作者: Katsuma S

カイコ培養細胞において持続感染している昆虫マキュラウイルスに由来するpiRNA の性状

持续感染家蚕培养细胞的昆虫黄斑病毒来源的piRNA特征

• 发表时间: 2017
• 作者: Ikoma;Tadaaki;庄司佳祐・泉奈津子・鈴木穣・泊幸秀・岩永将司・勝間進
• 通讯作者: 庄司佳祐・泉奈津子・鈴木穣・泊幸秀・岩永将司・勝間進

東京大学-昆虫遺伝研究室 公式ウェブサイト

东京大学 - 昆虫遗传学实验室官方网站

カイコマキュラウイルスはpiRNA経路およびRNAi経路によってRNAサイレンシグを受ける

蚕病毒通过 piRNA 和 RNAi 途径进行 RNA 沉默

• 发表时间: 2017
• 作者: 萩森資;嶋田浩聡;池内和忠;若森晋之介;山田英俊;Xun Zhu and Yuriko Aoki;泉谷徳廣; 永倉悠登; 松本恵介; 長谷川英悦;蓮見雄;勝間進・庄司佳祐・川本宗孝・木内隆史・泉奈津子・泊 幸秀・鈴木 穣・岩永将司
• 通讯作者: 勝間進・庄司佳祐・川本宗孝・木内隆史・泉奈津子・泊 幸秀・鈴木 穣・岩永将司

東京大学昆虫遺伝研究室

东京大学昆虫遗传学实验室