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piRNAシステムズバイオロジー：人工産生系を用いた機械学習的アプローチ

piRNAシステムズバイオロジー：人工産生系を用いた機械学習的アプローチ
piRNA 系统生物学：使用人工生产系统的机器学习方法
批准号：
16KT0064
负责人：
勝間 進
金额：
$11.9万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2016
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2016-07-19 至 2018-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16KT0064/
关键词：
piRNA小分子RNAカイコBmN-4ピンポンサイクル機械学習培養細胞カイコ培養細胞

项目摘要

项目成果

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小分子RNAの一つであるPIWI-interacting RNA (piRNA)は、生殖細胞において利己的な配列から自身を守る役割を果たす。カイコ培養細胞BmN-4はpiRNAの生合成経路の一つであるピンポンサイクルを保持する細胞である。私たちは、前年度にBmN-4を用いた「人工piRNA産生系」を確立し、それを利用してpiRNA-PIWI複合体の認識に必要な塩基数を同定した（Shoji et al., RNA, 2017）。今年度は以下の知見を得た。1.人工piRNA産生系にランダムなpiRNA前駆体配列を発現するライブラリーを導入し、piRNAの末端付近の規則性について検討した。そこで見出されたルールについて、現在生化学的な検証を行っている。2.BmN-4細胞に持続感染しているカイコマキュラウイルスの量がRNAi及びpiRNA経路によって抑制されていることが明らかになった。現在、論文投稿中である。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Artificial "ping-pong" cascade of PIWI-interacting RNA in silkworm cells.
Piwi相互作用RNA在蚕细胞中的人工“乒乓”级联。
DOI： 10.1261/rna.058875.116
发表时间： 2017-01
期刊： RNA (New York, N.Y.)
影响因子： --
作者： [Shoji K, Suzuki Y, Sugano S, Shimada T, Katsuma S]
通讯作者： Katsuma S
カイコ培養細胞において持続感染している昆虫マキュラウイルスに由来するpiRNA の性状
持续感染家蚕培养细胞的昆虫黄斑病毒来源的piRNA特征
DOI： --
发表时间： 2017
期刊：
影响因子： --
作者： [Ikoma, Tadaaki, 庄司佳祐・泉奈津子・鈴木穣・泊幸秀・岩永将司・勝間進]
通讯作者： 庄司佳祐・泉奈津子・鈴木穣・泊幸秀・岩永将司・勝間進
東京大学-昆虫遺伝研究室 公式ウェブサイト
东京大学 - 昆虫遗传学实验室官方网站
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
カイコマキュラウイルスはpiRNA経路およびRNAi経路によってRNAサイレンシグを受ける
蚕病毒通过 piRNA 和 RNAi 途径进行 RNA 沉默
DOI： --
发表时间： 2017
期刊：
影响因子： --
作者： [萩森資, 嶋田浩聡, 池内和忠, 若森晋之介, 山田英俊, Xun Zhu and Yuriko Aoki, 泉谷徳廣; 永倉悠登; 松本恵介; 長谷川英悦, 蓮見雄, 勝間進・庄司佳祐・川本宗孝・木内隆史・泉奈津子・泊 幸秀・鈴木 穣・岩永将司]
通讯作者： 勝間進・庄司佳祐・川本宗孝・木内隆史・泉奈津子・泊 幸秀・鈴木 穣・岩永将司
ボルバキアが宿主昆虫を時空間的に制御し、オス殺しを成立させる仕組みを解明する
  • 批准号：
    22H00366
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额：
    $27.12万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    勝間 進
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Gタンパク質共役型受容体を介した遊離脂肪酸によるアポトーシス阻害機構の解析
  • 批准号：
    17780081
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额：
    $2.18万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    勝間 進
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
国内基金
海外基金
基于深度学习技术的柴胡、黄芩及金银花抗病毒小分子RNA分子演化研究
  • 批准号：
    32360152
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    32.00万元
  • 批准年份：
    2023
  • 负责人：
    张昀
  • 依托单位：
    贵州中医药大学
拟南芥RCD1基因在小分子RNA途径及胁迫应答中的机制研究
  • 批准号：
    2020A1515010568
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    10.0万元
  • 批准年份：
    2020
  • 负责人：
    于宇
  • 依托单位：
    深圳大学
小麦小分子RNA TaMIR1118介导植株抵御低钾营养胁迫的分子机理
  • 批准号：
    31901539
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    24.0万元
  • 批准年份：
    2019
  • 负责人：
    赵勇
  • 依托单位：
    河北农业大学
小分子RNA介导的基因沉默协同调控泛素化蛋白降解的机制研究
  • 批准号：
    91640204
  • 项目类别：
    重大研究计划
  • 资助金额：
    270.0万元
  • 批准年份：
    2016
  • 负责人：
    陈大华
  • 依托单位：
    中国科学院动物研究所