未知の食中毒に対応:遺伝情報と暴露環境から食中毒細菌の適応進化を導き出す予測技術

应对未知食物中毒:从遗传信息和暴露环境中推导食物中毒细菌适应性进化的预测技术

基本信息

项目摘要

本研究は、カンピロバクターの環境要因に対する応答挙動における菌株間の違いを環境情報及び遺伝子情報を用いて予測するモデルを開発することを目標としている。初年度(本年度)は,29菌株のCampylobacter jejuniの耐熱性について試験を行った。耐熱性の菌株差の予測モデルを最新の手法(最確曲線法: Most probable curve methodおよび多変量正規分布:Multivariate normal distribution)によって開発された。結果として10~15種類の程度の菌株の耐熱性をもとに菌株全体の変動性を予測できることが示された。開発された予測モデル及びその結果はInternational Association of Food Protection 2023及びInternational Conference of Predictive Microbiology on Food 12において発表することが決まっている(両学会査読通過済)。加えて,耐熱試験を行った菌株の内,16菌株について、Hi-Fiシーケンサを用いた全ゲノム解析が完了した。得られたシーケンスデータをアセンブリすることで、環状の全ゲノム情報を取得することができた。次年度は,全菌株のゲノム解析を完了させるとともに,初年度で得られた耐熱性との関連因子を分析し,機械学習法を用いて遺伝情報からの生存特性の予測モデルを開発する。
The purpose of this study is to predict the environmental factors of bacteria and to develop the environmental information and genetic information of bacteria and bacteria. In the first year (this year), 29 strains of Campylobacter jejuni were tested for heat resistance. The latest method for predicting the difference of heat resistance strains (Most probable curve method and Multivariate normal distribution) is developed. The results showed that the degree of heat tolerance of 10~15 strains was higher than that of 10 ~ 15 strains. The results of the development of predictive microbiology and the development of predictive microbiology were reviewed by the International Association of Food Protection 2023 and the International Conference of Predictive Microbiology on Food 12. The analysis of 16 strains in the heat-resistant test was completed. Get the information from the ring and all the information from the ring. In the second year, the analysis of the whole strain was completed, and in the first year, the analysis of the heat resistance and the correlation factors was obtained. The prediction of the survival characteristics was developed by using the mechanical learning method.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Development of a thermal inactivation model considering the thermotolerance variability of 19 Campylobacter jejuni strains using the multi-variate normal distribution and the Most Probable Curve method
使用多变量正态分布和最可能曲线法开发考虑 19 种空肠弯曲杆菌菌株耐热性变异性的热失活模型
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hiroki Abe;and Susumu Kawasaki
  • 通讯作者:
    and Susumu Kawasaki
Strain variability of reduction behaviors of 19 Campylobacter jejuni strains under isothermal inactivation and the Bayesian predictive model of the survival kinetics
19株空肠弯曲杆菌等温灭活还原行为的菌株变异性及生存动力学贝叶斯预测模型
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hiroki Abe;and Susumu Kawasaki
  • 通讯作者:
    and Susumu Kawasaki
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

安部 大樹其他文献

安部 大樹的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('安部 大樹', 18)}}的其他基金

食物消化過程における食中毒細菌の生存確率を予測:食中毒発症リスク評価モデルの開発
预测食物消化过程中食物中毒细菌的存活概率:食物中毒风险评估模型的开发
  • 批准号:
    20J11550
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

Brazil-UK: Supporting training and research in predictive microbiology, using ComBase and related software tools
巴西-英国:使用 ComBase 和相关软件工具支持预测微生物学的培训和研究
  • 批准号:
    BB/J020389/1
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Research Grant
DEVELOPMENTS OF SAFE FOOD PRODUCTION SYSTEM BASED ON PREDICTIVE MICROBIOLOGY
基于预测微生物学的安全食品生产系统的发展
  • 批准号:
    19580297
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Non/semi-parametric methods and their applications for regression, survival analysis and predictive microbiology
非/半参数方法及其在回归、生存分析和预测微生物学中的应用
  • 批准号:
    261567-2003
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Non/semi-parametric methods and their applications for regression, survival analysis and predictive microbiology
非/半参数方法及其在回归、生存分析和预测微生物学中的应用
  • 批准号:
    261567-2003
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Non/semi-parametric methods and their applications for regression, survival analysis and predictive microbiology
非/半参数方法及其在回归、生存分析和预测微生物学中的应用
  • 批准号:
    261567-2003
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Non/semi-parametric methods and their applications for regression, survival analysis and predictive microbiology
非/半参数方法及其在回归、生存分析和预测微生物学中的应用
  • 批准号:
    261567-2003
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
Non/semi-parametric methods and their applications for regression, survival analysis and predictive microbiology
非/半参数方法及其在回归、生存分析和预测微生物学中的应用
  • 批准号:
    261567-2003
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
予測微生物学的手法によるHACCP管理のための動的菌体数予測法の確立
利用预测微生物学方法建立 HACCP 管理的动态细菌细胞计数预测方法
  • 批准号:
    13760182
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 3.33万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了