未知の食中毒に対応：遺伝情報と暴露環境から食中毒細菌の適応進化を導き出す予測技術

应对未知食物中毒：从遗传信息和暴露环境中推导食物中毒细菌适应性进化的预测技术

• 批准号: 22KJ3118
• 负责人: 安部 大樹
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: National Agriculture and Food Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3118/
• 关键词: 食品安全; 予測微生物学; 定量的微生物リスク評価; 加熱殺菌; 菌株差; 不確実性; カンピロバクター

本研究は、カンピロバクターの環境要因に対する応答挙動における菌株間の違いを環境情報及び遺伝子情報を用いて予測するモデルを開発することを目標としている。初年度（本年度）は，29菌株のCampylobacter jejuniの耐熱性について試験を行った。耐熱性の菌株差の予測モデルを最新の手法（最確曲線法: Most probable curve methodおよび多変量正規分布:Multivariate normal distribution）によって開発された。結果として10~15種類の程度の菌株の耐熱性をもとに菌株全体の変動性を予測できることが示された。開発された予測モデル及びその結果はInternational Association of Food Protection 2023及びInternational Conference of Predictive Microbiology on Food 12において発表することが決まっている（両学会査読通過済）。加えて，耐熱試験を行った菌株の内，16菌株について、Hi-Fiシーケンサを用いた全ゲノム解析が完了した。得られたシーケンスデータをアセンブリすることで、環状の全ゲノム情報を取得することができた。次年度は，全菌株のゲノム解析を完了させるとともに，初年度で得られた耐熱性との関連因子を分析し，機械学習法を用いて遺伝情報からの生存特性の予測モデルを開発する。

In this study, it is necessary for the environment to respond to environmental conditions, environmental conditions and environmental conditions. In the first year (this year), 29 strains were resistant to Campylobacter jejuni. When the resistant strains were poor, the latest methods (most sure method: Most probable curve method test: regular distribution of multiple doses: Multivariate normal distribution) were used to start the test. Results the results showed that all the strains with the same degree of tolerance and tolerance were tested in 10 and 15 years, and all the strains were resistant to bacteria. The results of International Association of Food Protection 2023 and International Conference of Predictive Microbiology on Food 12 were used to determine the performance of the program. In the strain strain, 16 strains were isolated, Hi-Fi strains were isolated, and the whole strain was analyzed. It is necessary to obtain the information in the first place and the whole environment in the first place. In the next year, the analysis of the whole strain was completed, and in the first year, the tolerance of the strain was analyzed by factor analysis, and the mechanical method was used to analyze the survival characteristics.

项目成果

Development of a thermal inactivation model considering the thermotolerance variability of 19 Campylobacter jejuni strains using the multi-variate normal distribution and the Most Probable Curve method

使用多变量正态分布和最可能曲线法开发考虑 19 种空肠弯曲杆菌菌株耐热性变异性的热失活模型

• 发表时间: 2023
• 作者: Hiroki Abe;and Susumu Kawasaki
• 通讯作者: and Susumu Kawasaki

Strain variability of reduction behaviors of 19 Campylobacter jejuni strains under isothermal inactivation and the Bayesian predictive model of the survival kinetics

19株空肠弯曲杆菌等温灭活还原行为的菌株变异性及生存动力学贝叶斯预测模型

• 发表时间: 2023
• 作者: Hiroki Abe;and Susumu Kawasaki
• 通讯作者: and Susumu Kawasaki