Von einer 2D-Proteindatenbank zu einer "Response Regulation Map" der stationären Phase von Bacillus subtilis (adaptives Netzwerk)

从二维蛋白质数据库到枯草芽孢杆菌静止期的“响应调控图”(自适应网络)

基本信息

项目摘要

In unserer Arbeitsgruppe ist z.Zt. das internationale Referenzlabor für Proteomics von Bacillus subtilis angesiedelt. Die weltweit einzige Proteom-Datenbank Gram-positiver Bakterien Sub-2D (http://microbio2.biologie.uni-greifswald.de:8880/sub2d.htm), auf die täglich aus verschiedensten Laboratorien der Welt zugegriffen wird, wurde in unserem Labor erstellt und wird ständig ergänzt. Unser Forschungsschwerpunkt liegt eindeutig in der 'physiologischen Proteomics', d.h. in dem Bemühen, mit Hilfe der Proteomics zu neuen Erkenntnissen über die Bakterienphysiologie ganz allgemein zu gelangen. Dabei geht es nicht nur um die Analyse der Basismodule globaler Genregulation (Stimulons, Regulons, Modulons, regulatorische Netzwerke), sondern auch um die Voraussage der Funktion bisher unbekannter Proteine. Im Rahmen des DFG-Projektes He 1887/6-1 wird dieser Ansatz zur Beschreibung der Regulation, Struktur und Funktion bekannter sowie unbekannter Regulons verfolgt. Darüber hinaus planen wir, das Labor zu einem Referenzlabor für 'Proteomics pathogener Gram-positiver Bakterien' auszubauen, um neue Erkenntnisse über die Mechanismen der Pathogenität zu erlangen. Für die im Antrag aufgeührten Projekte ist die Beschaffung eines MALDI-TOF-MS oder Q-Q-TOF-MS unabdingbare Voraussetzung zur schnellen Identifizierung der Proteine.
在我们的工作组是z.Zt.枯草芽孢杆菌蛋白质组学的国际参考文献。世界蛋白质数据库中的革兰氏阳性菌Bakterien Sub-2D(http://microbio2.biologie.uni-greifswald.de:8880/sub2d.htm),在我们的劳动力市场中,我们将从世界范围内的微生物中获得。Unser Forschungsschwerpunkt liegt eindeutig in der 'physiologischen Proteomics',d.h.在本研究中,蛋白质组学帮助新的诊断方法使诊断生理学成为可能。本文不仅对基因调控的基本模块(刺激子、调节子、模块、调控网络)进行了分析,还对蛋白质以外的功能进行了研究。1887/6-1在DFG项目的框架中,将对规则、结构和功能进行分析,使其不受规则的约束。我们计划开展一项针对革兰氏阳性细菌蛋白质组学病原体的参考研究,以探索埃尔兰根的致病机制。在本研究中,我们使用MALDI-TOF-MS或Q-Q-TOF-MS对蛋白质进行鉴定。

项目成果

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