Entschlüsselung und Modellierung genregulatorischer Netzwerke in Form gerichteter Graphen

以有向图的形式解码和建模基因调控网络

• 批准号: 5131364
• 负责人: Dr. Ralf Schneider
• 金额: --
• 依托单位: Bioinformatics Program
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Priority Programmes
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 1997-12-31 至 2005-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5131364?language=en
• 关键词: Entschl; sselung; und; Modellierung; genregulatorischer

Regulatorische Netzwerke der Transkription werden über ein komplexes System hierarchischer Faktoren gesteuert. Teildaten über regulatorische Netzwerke stehen aus der Literatur, sowie aus speziellen Datenbanken zur Verfügung. Beide Quellen liefern in den meisten Fällen nur eng begrenzte Ausschnittsbilder (z.B. Gen A reguliert Gen B). Die Informationen der NukleotidsequenzDatenbanken ist nur sehr unvollständig in diese Daten eingebunden, läßt sich aber mit Hilfe bereits von uns entwickelter Methoden in dieser Beziehung auswerten. Aus dem gesammelten Datenbestand dieser drei Ansätze können regulatorische Netzwerke in Form gerichteter Graphen modelliert werden, wobei eine dynamische Anpassung an den aktuell verfügbaren Datensatz erreicht werden kann. Derartige Modelle repräsentieren ein wichtiges Hilfsmittel zur Identifizierung potentieller Zielgene einzelner Transkriptionsfaktoren. Zusammen mit in silico Promotor-Analysen tragen sie dazu bei, die Ergebnisse des Screenings genomischer Sequenzen auf potentielle Targets zu verbessern. Dies wird den Wert zunächst anonymer genomischer Sequenzen für die pharmazeutische Forschung erheblich steigern und allgemein zu verbesserter Annotation der Sequenzen beitragen.

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