Hochleistungsalgorithmen für die metabolische 13C Stofffluss-Analyse

Stofffluss-Analyse（SFA）是系统生物学和代谢工程中的一种标准化方法，用于代谢网络中Stoffflüsse（Fluxom）的体内定量实验。在许多生物化学方法的基础上，建立了一种新的SFA模型，该模型使用13 C-标记物（Rohdaten）作为韦尔登。对于系统生物学的实验（Hochdurchsatz-SFA，nichtlineare statistische Verfahren，Modellselection，isotopisch instationäre SFA）来说，性能最好的生物学实验并不梅尔，因此，实验室的能量消耗也就越大。这个项目是一个新的方法论和方法论的核心，它是从信息学的核心（网络分析、形式语言、计算机代数、代码生成、贝叶斯方法、集群和网格计算、可视化）出发，通过同位素标记的实验和数据挖掘的方法来实现最佳的统一。大北将是一个被逮捕的宇宙使者，他没有一个被逮捕的人。Netzwerktopologie oder Messconfiguration verlangt und alle zätzlich getroffenen Annahmen präzise documentiert.该方法韦尔登，可用于高强度的同位素实验，并可用于建立有效的方法。

Die Stofffluss-Analyse (SFA) hat sich in Systembiologie und Metabolic Engineering als Standardwerkzeug zur experimentellen In-vivo-Quantifizierung der Stoffflüsse („Fluxom“) in metabolischen Netzwerken etabliert. Im Gegensatz zu vielen anderen biochemischen Messmethoden erfordert die SFA ein aufwändiges, modellgestütztes Auswertungsverfahren, mit dem aus 13C-Markierungsmessdaten (Rohdaten) die gesuchten Stoffflüsse berechnet werden. Für die aktuellen Anforderungen der Systembiologie (Hochdurchsatz-SFA, nichtlineare statistische Verfahren, Modellselektion, isotopisch instationäre SFA) reicht die Performanz bestehender Algorithmen nicht mehr aus, so dass die erschöpfende rechnergestützte Auswertung der Experimente zum Engpass wird. Das Projekt hat das Ziel, eine Reihe von neuen Algorithmen und Methoden, die vornehmlich aus den Kerngebieten der Informatik stammen (Netzwerkanalyse, Formale Sprachen, Computeralgebra, Codegenerierung, Bayes-Methoden, Cluster- und Grid- Computing, Visualisierung), auf die Auswertung von Isotopen-Markierungsexperimenten anzuwenden und damit die Geschwindigkeit der rechnergestützten Datenauswertung um mehrere Zehnerpotenzen zu beschleunigen. Dabei wird ein durchgehend universeller Ansatz verfolgt, der keinerlei Einschränkungen bzgl. Netzwerktopologie oder Messkonfiguration verlangt und alle zusätzlich getroffenen Annahmen präzise dokumentiert. Die zu entwickelnden Methoden werden auf Hochdurchsatzexperimente sowie isotopisch instationäre Experimente angewandt und im Vergleich zu etablierten Methoden validiert.