Modeling metabolic networks based on in-vivo-, in-vitro and in-silico-data

新陈代谢工程的核心问题是Bereitstellung Bereitstellung一直是数学模型的发明者。Dazu steht eine wachsende Zahl von in-Vivo-，体外和in-Silico-Daten zum基因组，Transkrigtom，Proteom and Metoxom zur Verfügung。我们在生活中得到了更多的帮助。海尔杜尔奇将他的异质基因和青少年儿童的数据基础放在一起。在这项计划中，我们将从以下几个方面着手：一)为系统提供更多的数据和动力；二)将所有的数据转换为数据；三)数据的质量；四)新陈代谢系统的优化；五)新系统的优化。在此基础上提出了一种新的仿真与控制分析实现方法。Zur Konsistenzprüfong von Datensätzen and zur modelldiskrimini erung是一种特殊的进化算法。Eine Anwendung发现了一种新的方法，用于分析威森氏杆菌和谷氨酸杆菌的代谢。

Ein zentrales Problem des Metabolic Engineering ist die Bereitstellung belastbarer mathematischer Modelle für das stationäre und dynamische Verhalten ganzer Zellen. Dazu steht eine wachsende Zahl von In-Vivo-, In-Vitro- und In-Silico-Daten zum Genom, Transkriptom, Proteom und Metabolom zur Verfügung. Ein ganzheitliches Modell einer lebenden Zelle kann jedoch letztendlich nur mit In-Vivo-Daten validiert werden. Hierdurch entsteht eine äußerst heterogene und teilweise sogar widersprüchliche Datenbasis. In diesem Projekt wird ein neuartiger Ansatz zur Stoffwechselmodellierung entwickelt, der sich durch folgende Besonderheiten auszeichnet: i) Beschreibung des stationären und dynamischen Systemverhaltens, ii) Einbeziehung aller verfügbaren Datenquellen, iii) Berücksichtigung der unterschiedlichen Qualität und möglichen Inkonsistenz der Daten, iv) Hinzunahme metabolischer Optimierungsziele, v) Parametriesierte Darstellung großer Familien von Modellalternativen. Davon ausgehend werden rechnergestützte Werkzeuge für die Modellierung, Simulation und Kontrollanalyse implementiert. Zur Konsistenzprüfung von Datensätzen und zur Modelldiskriminierung werden spezielle evolutionäre Algorithmen entwickelt und auf einem Rechner-Netz ausgeführt. Eine Anwendung findet die neue Methode bei der Analyse des vorhandenen metabolischen Wissen bei E.coli und C.glutamicum.