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Development of made-to-order sugar-chain-sensing-system

定制糖链传感系统的开发

基本信息

批准号：
22K18350
负责人：
長崎慶三
金额：
$ 16.47万
依托单位：
Kochi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-06-30 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

【目的】近年、疾病と糖鎖の密接な関係が注目されている。糖鎖マーカーの種類は疾病ごとに異なり、独特の量的・質的変化が起こる。よって、糖鎖をマーカーとすることで疾病の早期診断が可能であると考えられる。こうした状況を受け近年では、糖鎖の「量」ではなく「質」のセンシング技術の開発が望まれている。これまでのところ糖鎖構造を特異的に認識する蛋白質分子として知られているのはレクチンのみであり、より強力かつ特異的な（特異性を制御可能な）蛋白質分子の探索が求められている。そこで我々が注目したのは藻類ウイルスHaVが持つ超巨大蛋白質(VP492)上に存在する高度アミノ酸反復領域である(74aa×約30反復）。クロレラウイルスに関する先行研究より、この領域が宿主表面糖鎖の認識に関わっており、各74aa配列単位にみられるアミノ酸配列の多型はその糖鎖認識特性の多様性と対応している可能性が考えられる。これらの仮説について検証を行うことで、本反復領域をプラットフォームとした創薬技術の開発が期待される。【計画と進捗状況】初年度は、①ウイルス感受性の異なる宿主藻体株の糖鎖成分のLC-MS解析による比較、②各ウイルスタイプ代表株の高度アミノ酸反復領域の配列比較、③AlfaFold2を用いた反復アミノ酸配列の立体構造推定を行った。その結果、①宿主藻体株間において主成分を占めるN結合型糖鎖の構造に差異はみられなかった。②4株の当該領域の同一性はきわめて高いと推定された。③当該領域の分子構造はβヘリックスによる頑強な芯状構造であり、その一部がよれたステムループ状を呈することがわかった。これらの結果から、当初想定していた「74アミノ酸反復領域の違いが株特異的な宿主認識特性（感染特異性）を支持している」という単純な仮説で両者間の関係性を説明するのは難しいと考えられた。

[Purpose] In recent years, attention has been paid to the close relationship between diseases and sugar locks. Sugar locks are different types of diseases and unique quantitative and qualitative changes.よって, sugar lock をマーカーとすることで Disease の early diagnosis がであるとtest えられる.こうしたをReceived in recent yearsでは、sugar lockの「quantity」ではなく「quality」のセンシングTechnologyの开発が看まれている.これまでのところSpecific にKnowledge of するProtein moleculesとして知られているのはレクチンのみであり, よりStrong and かつSpecific な (specificity を control possible な) Exploration of protein molecules がられている. There is a high degree of algae repeatability in the ultra-large protein (VP492) that is present in the algae haV protein (VP492) (74aa × about 30 repeats).クロレラウイルスに关する advance research より, この domain が host surface sugar lock knowledge に关わっており, each 74aa matching Column unit にみられるアミノ acid ligation の polytype はその sugar lock recognition characteristics の様 properties と対応している possibility が考えられる. We are looking forward to the development of our technology in this repeated field. [Planning and progress status] In the first year, ① Comparison of LC-MS analysis of sugar-locked components of host algae strains and ① each ウイルスComparison of alignments in the highly アアミノacid repeating domain of the representative strain of タイプ, and ③AlfaFold2's prediction of three-dimensional structure using いたrepeating アミノacid alignment. As a result, ① The difference in the main component of the host algae strains and the structure of the N-binding sugar lock are the same. ②The identity of the four strains in this field is presumed to be high. ③When the molecular structure of this field is strong and the core-like structure is strongり、その一一がよれたステムループ色を成することがわかった. The results of the これらのから、The original idea of していた「74アミノAcid recurrence fieldのvioliいが strain-specific なhost recognition characteristics (sense) Specificity of dye)をsupportしている」という単pureな仮说で両人的性の性を Explainするのは多しいとtestえられた.

项目成果

期刊论文数量（15）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

海洋性真核微細藻類に対するウイルス感染が原核生物群集動態に及ぼす影響

海洋真核微藻病毒感染对原核群落动态的影响

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
武部紘明;廣本春奈;渡邉哲弘;山本圭吾;長崎慶三;神川龍馬;吉田天士
通讯作者：
吉田天士

HaV may give innovative insights for traditional algal virology.

HaV 可能为传统藻类病毒学提供创新见解。

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Keizo Nagasaki;Yusaku Funaoka;Haruna Hiromoto;Michiko Takahashi;Daichi Morimoto;Hiromichi Maeda;Kazuhiro Hanazaki;Kei Wada.
通讯作者：
Kei Wada.

藻類ウイルスクローン株における多様な宿主特異性発現の可能性.

藻类病毒克隆中多种宿主特异性表达的可能性。