Establishment of Plant Paleoproteomics
Establishment of Plant Paleoproteomics
批准号:
22K18486
负责人:
西内 巧
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-06-30 至 2024-03-31
中文摘要
本年度は、弥生時代を中心に地域の異なる8遺跡で出土した炭化米について、残存タンパク質の分析を行った。炭化米等の植物遺体中のタンパク質の残存状況は、試料によって大きく差異があることから、各遺跡から多数の試料を用いて、それぞれ独立して分析を行った。その結果、全ての遺跡からイネに特異的なタンパク質を検出することができたが、Cupinファミリーに属するタンパク質が検出されなかった試料も複数見られた。また、ジャポニカ種に特異的なアミノ酸配列が検出された試料も見られたことから、タンパク質の残存状況によっては、ジャポニカ種とインディカ種を判別可能であることが分かった。一方、約1400年前の炭化コムギ種子についても10点以上について分析を行ったが、いずれの試料においてもコムギに特異的なタンパク質を検出することはできなかった。出土土器の炭化付着物の残存タンパク質の分析についても、植物由来のタンパク質に着目して分析を行った。他の試料で既に検出されていたイネやダイズ属由来のCupinファミリータンパク質と同じタンパク質が検出される試料が多かった。一方で、縄文時代の遺跡の土器付着物から、クルミ属のCupinファミリーに属するグロブリンタンパク質を検出することができた。オニグルミである可能性が示唆されるが、オニグルミのタンパク質のデータベースが整備されていないため特定には至らなかった。今後、データベースの整備は課題となるが、これまでの穀物と豆類のCupinタンパク質に加えて、堅果類のCupinタンパク質を検出できたことは大きな成果であり、今後も同様に解析を進めることで、Cupinファミリータンパク質に着目した植物パレオプロテオミクスの研究基盤の確立を進めたい。
英文摘要
本年度は、弥生時代を中心に地域の異なる8遺跡で出土した炭化米について、残存タンパク質の分析を行った。炭化米等の植物遺体中のタンパク質の残存状況は、試料によって大きく差異があることから、各遺跡から多数の試料を用いて、それぞれ独立して分析を行った。その結果、全ての遺跡からイネに特異的なタンパク質を検出することができたが、Cupinファミリーに属するタンパク質が検出されなかった試料も複数見られた。また、ジャポニカ種に特異的なアミノ酸配列が検出された試料も見られたことから、タンパク質の残存状況によっては、ジャポニカ種とインディカ種を判別可能であることが分かった。一方、約1400年前の炭化コムギ種子についても10点以上について分析を行ったが、いずれの試料においてもコムギに特異的なタンパク質を検出することはできなかった。出土土器の炭化付着物の残存タンパク質の分析についても、植物由来のタンパク質に着目して分析を行った。他の試料で既に検出されていたイネやダイズ属由来のCupinファミリータンパク質と同じタンパク質が検出される試料が多かった。一方で、縄文時代の遺跡の土器付着物から、クルミ属のCupinファミリーに属するグロブリンタンパク質を検出することができた。オニグルミである可能性が示唆されるが、オニグルミのタンパク質のデータベースが整備されていないため特定には至らなかった。今後、データベースの整備は課題となるが、これまでの穀物と豆類のCupinタンパク質に加えて、堅果類のCupinタンパク質を検出できたことは大きな成果であり、今後も同様に解析を進めることで、Cupinファミリータンパク質に着目した植物パレオプロテオミクスの研究基盤の確立を進めたい。
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土器付着物を用いたプロテオミクスによる古代人の食生活の復元
利用陶器沉积物的蛋白质组学重建古人的饮食习惯
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西内巧, 庄田槙矢]
通讯作者:
庄田槙矢
土器付着物プロテオミクスで古代人の食生活を探る
利用陶器沉积物蛋白质组学探索古人的饮食习惯
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sidiq Y, Tamaoki D, Nishiuchi T, 西内巧]
通讯作者:
西内巧
Data for proteomic analysis of epidermis of Arabidopsis leaves inoculated with plant pathogenic fungi, <i>Fusarium graminearum</i>.
接种植物病原真菌禾谷镰刀菌的拟南芥叶表皮的蛋白质组分析数据。
DOI:
10.14889/jpdm.2023.0009
发表时间:
2023
期刊:
Journal of Proteome Data and Methods
影响因子:
--
作者:
[Sidiq Y, Tamaoki D, Nishiuchi T]
通讯作者:
Nishiuchi T
プロテオミクスを用いた土器付着物に含まれる作物種の同定
利用蛋白质组学鉴定陶器沉积物中所含的作物物种
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西内巧, 庄田槙矢]
通讯作者:
庄田槙矢
古代寺院の食を再現する
再现古寺美食
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[村上夏希, 西内巧, 庄田慎矢]
通讯作者:
庄田慎矢
縄文人による植物利用の解明に向けた土器付着物プロテオミクスの研究基盤の確立
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批准号:23K25390
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$6.82万
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财政年份:2024
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负责人:西内 巧
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依托单位:
paleoproteomic profiling of ancient plant remains in the pottery food crusts
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批准号:23H00693
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:西内 巧
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依托单位:
葉と根の間でのシステミックな傷応答遺伝子発現の解析
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批准号:17770031
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:西内 巧
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依托单位:
海外基金