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Regulatory mechanism of the gene expression using sUTR

使用 sUTR 的基因表达调控机制

基本信息

批准号：
22K19168
负责人：
山次康幸
金额：
$ 4.08万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-06-30 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19168/
关键词：
リーキースキャニング植物ウイルス 5'UTR

项目摘要

本研究ではuORFによる遺伝子発現制御機構の全容解明を目指し、sUTRを介したリーキースキャニングの制御機構に関する研究を展開する。今年度はsUTRの植物ウイルス間における保存状況とsUTRの機能について研究を行った。TGBpsをコードする多数の植物ウイルスについてTGBpsをコードするsgRNAの5'UTRの長さをディープシンクエンシングによる網羅的RACE法により解析したところ、いずれも10塩基以下の短い配列しか保持していなかったことからsUTRはこれらのウイルスの間で普遍的な性質であることを示した。そこで、リーキースキャニングにおけるsUTRの機能を解明するため、下流遺伝子TGBp1, TGBp2, TGBp3の発現量への影響を解析した。まず、sUTRの長さを短くしたところ、sUTR直下のTGBp1の発現量が減少し、下流のTGBp2/TGBp3の発現量が増加した。次いでsUTRを長くしたところ、TGBp1の発現量に変化はないが、TGBp2/TGBp3の発現量が減少した。sUTRの長さはそのままに配列を変化させても下流遺伝子の発現量への影響はなかったことから、sUTRの長さが下流遺伝子の発現量を調整する働きがあることを示した。これらの結果はリーキースキャニングのレギュレーターとしてこれまで知られていたKozak配列以外に、5'UTRの長さもリーキースキャニングのレギュレーターとしての働きを持つことを示唆するものである。

This study is aimed at the overall understanding of the regulatory mechanism of uORF and the research on the regulatory mechanism of sUTR. This year, the study on the preservation status and function of sUTR was carried out. The RACE method for analyzing TGBps in most plant species shows that the 5'UTR length of TGBps in most plant species is shorter than 10 bp and the 5' UTR length of TGBps in most plant species is shorter than 10 bp. The function of sUTR is explained, and the influence of downstream genes TGBp1, TGBp2, TGBp3 on the occurrence of sUTR is analyzed. The occurrence of TGBp1 in the lower part of sUTR decreased and the occurrence of TGBp2/TGBp3 in the lower part increased. In the second place, the UTR is longer, the TGBp1 is more visible, and the TGBp2/TGBp3 is less visible. The length of the sUTR is adjusted to reflect the influence of downstream gene expression. The result is that Kozak has a long history of separation and separation.

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Complete genome sequence of a novel polerovirus infecting Cynanchum rostellatum

感染白首乌的新型极病毒的完整基因组序列

DOI：
10.1007/s00705-022-05625-1
发表时间：
2023
期刊：
Archives of Virology
影响因子：
2.7
作者：
Tokuda Ryosuke;Watanabe Kiyoto;Koinuma Hiroaki;Okano Yukari;Nijo Takamichi;Yamamoto Toya;Suzuki Masato;Maejima Kensaku;Namba Shigetou;Yamaji Yasuyuki
通讯作者：
Yamaji Yasuyuki

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DOI：
发表时间：
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期刊：
影响因子：
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作者：
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通讯作者：
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DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ishikawa K.;Hashimoto M.;Yusa A.;Koinuma H.;Kitazawa Y.;Netsu O.;Yamaji Y.;Namba S.;山次康幸;藤本祐司・煉谷裕太朗・橋本将典・吉田哲也・桂馬拓也・徳丸　海・前島健作・根津修・難波成任・山次康幸;煉谷裕太朗・遊佐礼・橋本将典・吉田哲也・藤本祐司・前島健作・難波成任・山次康幸;吉田哲也・岡野夕香里・西田萩子・松本旺樹・鈴木拓海・前島健作・難波成任・山次康幸;岡野夕香里・前島健作・吉田哲也・鈴木拓海・松本旺樹・難波成任・山次康幸
通讯作者：
岡野夕香里・前島健作・吉田哲也・鈴木拓海・松本旺樹・難波成任・山次康幸

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DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ishikawa K.;Hashimoto M.;Yusa A.;Koinuma H.;Kitazawa Y.;Netsu O.;Yamaji Y.;Namba S.;山次康幸;藤本祐司・煉谷裕太朗・橋本将典・吉田哲也・桂馬拓也・徳丸　海・前島健作・根津修・難波成任・山次康幸;煉谷裕太朗・遊佐礼・橋本将典・吉田哲也・藤本祐司・前島健作・難波成任・山次康幸
通讯作者：
煉谷裕太朗・遊佐礼・橋本将典・吉田哲也・藤本祐司・前島健作・難波成任・山次康幸