Clarification of the mechanism for endogenous retrovirus to get involved in the antitumor immunity response

阐明内源性逆转录病毒参与抗肿瘤免疫反应的机制

• 批准号: 22K19561
• 负责人: 豊岡 伸一
• 金额: $ 4.08万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19561/
• 关键词: 内在性レトロウイルス; 肺癌; 腫瘍免疫応答

非小細胞肺癌を含む種々の悪性腫瘍においては、腫瘍が免疫系から逃避するために獲得する免疫チェックポイント分子に対する抗体（免疫チェックポイント阻害薬）により治療効果を認めており、癌治療の新たな選択肢として注目されている。しかし、約30%の患者にしか効果を認めないため、個々の患者で腫瘍免疫応答の機構は異なることが予想される。内在性レトロウイルス (ERV) は、生物の生殖細胞ゲノム中に存在するレトロウイルスゲノムに類似した塩基配列であり、ヒトのゲノムにおいては8%程度を占めると考えられているが、遺伝子発現および調節において不可欠な役割を果たしている。ERVが腫瘍免疫抑制に関わる可能性が報告されているが、一方でERVが腫瘍免疫応答を促進するという一見すると矛盾した報告もあり、ERVが腫瘍免疫応答に関与するメカニズムの詳細は未だ不明である。本研究では、肺癌におけるERV発現が腫瘍免疫応答に関与するメカニズムに焦点を当て、その本質の解明に挑戦する。令和4年度は、保管されている肺癌手術検体を使用してRNA-SeqによりERV発現の探索を進めている。また得られた遺伝子データを、腫瘍に含まれる各種細胞の構成比を推定する解析ツールであるCIBERSORTx (https://cibersortx.stanford.edu/) に入力して、T細胞やB細胞などの免疫細胞の分画を推定し、ERVの発現と免疫細胞の分画の関連を検討中である。

Non-small cell lung cancer contains various types of tumors, including tumors, immune system, immune system, immune system, and immune system molecules.対するAntibodies (Immune チェックポイントblocking 薬) によりtreatment effect を admitted めており, cancer treatment の新たな选択 Limb として NOTE されている.しかし、About 30% of patients have no effect on the disease, and each patient has a tumour-immune response mechanism and a different なることがされる. Innerness レトロウイルス (ERV)は、Biological germ cell ゲノム中するレトロウイルスゲノムに is similar to the した塩base arrangement であり、ヒトのゲノムにおいては 8% degree いるとtest えられているが, 缝子発appears および Adjustment においてcannot owe なservice cut を Fruit たしている. ERV is a tumor immunosuppressor, it is possible to report it, and it is a ERV tumor immune response, it is a promoter.う一见するとconflict reportしたもあり、ERVがtumor immune responseに口 and するメカニズムのdetailsは不だUnknownである. This study focuses on the relationship between lung cancer, ERV symptoms, tumor immune responses, and the focus of lung cancer, as well as the nature of lung cancer and the explanation of its nature. In the 4th year of Reiwa, the lung cancer surgery specimens were kept and used and the RNA-Seq ERV was discovered and explored.また得られた缝子データを、tumor ににれる Various cell composition ratios を estimation する analysis ツールであるCIBERSORTx (https://cibersortx.stanford.edu/)に入力して, T cells, B cells, and immune cells, and the division of immune cells are presumed.