Clarification of the mechanism for endogenous retrovirus to get involved in the antitumor immunity response

阐明内源性逆转录病毒参与抗肿瘤免疫反应的机制

• 批准号: 22K19561
• 负责人: 豊岡 伸一
• 金额: $ 4.08万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19561/
• 关键词: 内在性レトロウイルス; 肺癌; 腫瘍免疫応答

非小細胞肺癌を含む種々の悪性腫瘍においては、腫瘍が免疫系から逃避するために獲得する免疫チェックポイント分子に対する抗体（免疫チェックポイント阻害薬）により治療効果を認めており、癌治療の新たな選択肢として注目されている。しかし、約30%の患者にしか効果を認めないため、個々の患者で腫瘍免疫応答の機構は異なることが予想される。内在性レトロウイルス (ERV) は、生物の生殖細胞ゲノム中に存在するレトロウイルスゲノムに類似した塩基配列であり、ヒトのゲノムにおいては8%程度を占めると考えられているが、遺伝子発現および調節において不可欠な役割を果たしている。ERVが腫瘍免疫抑制に関わる可能性が報告されているが、一方でERVが腫瘍免疫応答を促進するという一見すると矛盾した報告もあり、ERVが腫瘍免疫応答に関与するメカニズムの詳細は未だ不明である。本研究では、肺癌におけるERV発現が腫瘍免疫応答に関与するメカニズムに焦点を当て、その本質の解明に挑戦する。令和4年度は、保管されている肺癌手術検体を使用してRNA-SeqによりERV発現の探索を進めている。また得られた遺伝子データを、腫瘍に含まれる各種細胞の構成比を推定する解析ツールであるCIBERSORTx (https://cibersortx.stanford.edu/) に入力して、T細胞やB細胞などの免疫細胞の分画を推定し、ERVの発現と免疫細胞の分画の関連を検討中である。

在包括非小细胞肺癌在内的多种恶性肿瘤中，使用抗体（免疫检查点抑制剂）观察到治疗作用，以获得免疫检查点分子以避免免疫系统，并引起人们的注意作为对癌症治疗的新选择。但是，由于大约30％的患者只能看到这种作用，因此可以预期，个别患者的肿瘤免疫反应机理将有所不同。内源性逆转录病毒（ERV）是类似于生物体生殖细胞基因组中的核苷酸序列，被认为占人类基因组的8％，但在基因表达和调节中起着至关重要的作用。尽管有报道说ERV可能参与肿瘤免疫抑制的可能性，但也有矛盾的报道说ERV促进了肿瘤免疫反应，以及ERV参与肿瘤免疫反应的机制的细节仍然未知。这项研究的重点是肺癌中ERV表达参与肿瘤免疫反应的机制，以及阐明其本质的挑战。在2022年，使用储存的肺癌手术标本使用RNA-Seq搜索ERV表达。所获得的遗传数据还输入到cibersortx（https://cibersortx.stanford.edu/）中，该工具估计了肿瘤中包含的各种细胞的组成比，目前正在研究ERV表达和免疫细胞分数之间的关系。