O-フタルアルデヒド基を用いたペプチドの高効率マクロ環化とその応用
O-フタルアルデヒド基を用いたペプチドの高効率マクロ環化とその応用
批准号:
22KF0114
负责人:
菅 裕明
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2023
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2023-03-08 至 2025-03-31
中文摘要
从2022年10月到2023年3月,我们的目标是研究基于OPA的技术,利用FIT系统构建非标准环肽库。由于OPA的高反应性,我们首先探索了3,4-THDA,一种反应性较低的二醛化合物。我们的实验证明了与赖氨酸和硫醇催化的硫代吡咯的选择性环化反应。与已报道的OPA化学方法相比,该方法具有更好的转化率和稳定性,但体外翻译的苛刻条件需要优化。我们还致力于OPA-CME衍生物的研究,用于Flexizyme介导的OPA酰化tRNA合成,旨在创建非标准文库。正在开发OPAON/OFF方法来控制翻译和翻译后环化过程中的OPA反应性。这一策略有助于识别针对结合口袋中含有半胱氨酸和赖氨酸残基的蛋白激酶的多肽抑制剂。
英文摘要
From Oct 2022 to Mar 2023, we aimed to investigate OPA-based technology for constructing nonstandard cyclic peptide libraries using FIT system. Due to OPA's high reactivity, we first explored 3,4-ThDA, a di-aldehyde compound with lower reactivity. Our experiments demonstrated selective cyclization with lysine and thiol-catalyzed thienopyrrole formation. This method yielded good conversion and better stability than the reported OPA chemistry, but the harsh conditions need optimization for in vitro translation.We are also working on OPA-CME derivatives for flexizyme-mediated OPA-acylated tRNA synthesis, aiming to create non-standard libraries. The OPAon/off method is being developed for controlling OPA reactivity during translation and post-translational cyclization. This strategy helps identify peptide inhibitors targeting protein kinases containing cysteine and lysine residues in the binding pockets.
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1021/acs.orglett.2c02870
发表时间:
2022
期刊:
Organic Letters
影响因子:
5.2
作者:
[Zhang Yue, Vinogradov Alexander A., Chang Jun Shi, Goto Yuki, Suga Hiroaki]
通讯作者:
Suga Hiroaki
擬天然物ライブラリーを用いた細胞膜透過性生理活性化合物の発見
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批准号:24KF0022
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2024
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
疾患原因タンパク質を分解するUボディによる新規創薬戦略
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批准号:23KF0197
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2023
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
医薬品応用に向けた新奇ジスルフィドリッチペプチドのデザイン戦略
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批准号:23KF0020
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2023
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
天然遺伝暗号の拡張によるペプチドミメティックスの翻訳合成
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批准号:23KF0109
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2023
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
特殊ペプチド・フォールダマーハイブリッド分子の研究
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批准号:22KF0096
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2023
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
抗KRAS環状ペプチドファマコフォアの小型タンパク質へのラソグラフト体の創出
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批准号:22KF0089
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2023
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
Challenges to the remaining issues of therapeutically valuable pseudo-natural peptides and products
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批准号:20H05618
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项目类别:Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
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资助金额:$404.19万
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财政年份:2020
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
ペプチドセレクションによる酵素ミミック創薬のための戦略
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批准号:18F18727
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2018
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
中性子捕捉療法を指向したホウ素含有環状ペプチドの開発
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批准号:16F16412
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2016
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
チアゾール含有環状ペプチドの翻訳合成法
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批准号:16F16033
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2016
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
抗菌作用を発揮する大環状特殊ペプチドの発見と開発
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批准号:16F16810
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2016
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
薬剤活性向上した大環状ペプチドを開発する新規戦略
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批准号:15F15333
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
プロリル-4-ヒドロキシダーゼをアイソフォーム選択的に阻害する大環状化合物の発見
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批准号:14F04065
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2014
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
Keap1-Nrf2の相互作用を阻害する擬天然物特殊ペプチドのプロドラッグ化
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批准号:13F03730
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2013
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
低酸素誘導因子を阻害する特殊ペプチドの創出
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批准号:13F03026
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2013
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
チオオキシ主鎖骨格ペプチドの翻訳合成技術の開発
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批准号:13F03766
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2013
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
ペプチドーペプトイド複合骨格をもつエピゲノム酵素阻害剤の発見
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批准号:11F01344
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2011
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
擬天然物の翻訳プログラム合成と薬剤探索
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批准号:21241051
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$18.14万
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财政年份:2009
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负责人:菅 裕明
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依托单位:
海外基金