乳児腸内フローラの形成機構の包括的理解と新規制御法への応用

全面认识婴儿肠道菌群形成机制及新防治方法的应用

• 批准号: 22KJ1790
• 负责人: 小酒井 智也
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1790/
• 关键词: ビフィズス菌; 腸内細菌叢; 共生; 乳児

乳児期における有益な細菌叢形成は、生涯にわたり宿主の健康に影響を及ぼすことがわかっている。本研究では、乳児期の腸内細菌叢の形成メカニズムの解明、および有益な菌叢の形成手法の確立を目的とする。乳児期の有益な腸内細菌叢の形成メカニズムの解明にあたり、2022年度は、乳児腸内に棲息する腸内細菌種の特定を実施した。具体的には、数名の健康な母乳栄養児の糞便サンプルから様々な培養条件によって腸内細菌種の単離を行った。種の同定は、完全長の16S rRNA配列を決定することで行った。その結果、乳児腸内でよく検出される既報の細菌種（いくつかのBifidobacterium種やStaphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalisなど）が大多数を占めていたものの、新種と推定されるBacteroides種も単離することに成功した。本年度は、さらに上記の新種と推定されるBacteroides種について解析を実施した。具体的にはまず、次世代シークエンサーを用いてゲノム解析を実施した。その結果、3つのコンティグから構成されるクオリティの高いゲノム配列を取得することに成功した。また、当該ゲノム配列を公開されている既存のゲノム配列とAverage nucleotide identity解析により比較したところ、高くても95 %の配列類似性しか示さないことが明らかとなった。以上のことから、本菌種は、新種の可能性が高く、本菌種の性状を今後さらに解析することは、乳児期の腸内細菌叢を理解するうえで重要であることが示唆された。

在婴儿期间，有益的微生物群形成会影响宿主健康。这项研究旨在阐明婴儿期肠道菌群形成的机制，并建立形成菌群的有益方法。在阐明婴儿期有益的肠道微生物组形成的机制时，我们在2022年确定了生活在婴儿肠中的肠道细菌。具体而言，在各种培养条件下，从几个健康母乳喂养婴儿的粪便样品中分离出肠道细菌。通过确定全长16S rRNA序列来鉴定物种。结果，尽管大多数以前是在婴儿肠道中通常检测到的细菌物种（例如几种双歧杆菌种类，金黄色葡萄球菌，葡萄球菌表皮菌，粪肠球菌，粪肠球菌等），也表明，这些物种也可以成功地隔离。今年，我们还对细菌物种进行了分析，这些物种被认为是上面提到的新物种。具体而言，首先使用下一代序列器进行基因组分析。结果，我们成功获得了由三个重叠群组成的高质量基因组序列。此外，当使用平均核苷酸同一性分析将基因组序列与已发表的现有基因组序列进行比较时，揭示了最多95％的序列相似性。从以上，已经提出该物种可能是一种新物种，并且对未来该物种的性质的进一步分析对于理解婴儿期肠道菌群很重要。