乳児腸内フローラの形成機構の包括的理解と新規制御法への応用

全面认识婴儿肠道菌群形成机制及新防治方法的应用

• 批准号: 22KJ1790
• 负责人: 小酒井 智也
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1790/
• 关键词: ビフィズス菌; 腸内細菌叢; 共生; 乳児

乳児期における有益な細菌叢形成は、生涯にわたり宿主の健康に影響を及ぼすことがわかっている。本研究では、乳児期の腸内細菌叢の形成メカニズムの解明、および有益な菌叢の形成手法の確立を目的とする。乳児期の有益な腸内細菌叢の形成メカニズムの解明にあたり、2022年度は、乳児腸内に棲息する腸内細菌種の特定を実施した。具体的には、数名の健康な母乳栄養児の糞便サンプルから様々な培養条件によって腸内細菌種の単離を行った。種の同定は、完全長の16S rRNA配列を決定することで行った。その結果、乳児腸内でよく検出される既報の細菌種（いくつかのBifidobacterium種やStaphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalisなど）が大多数を占めていたものの、新種と推定されるBacteroides種も単離することに成功した。本年度は、さらに上記の新種と推定されるBacteroides種について解析を実施した。具体的にはまず、次世代シークエンサーを用いてゲノム解析を実施した。その結果、3つのコンティグから構成されるクオリティの高いゲノム配列を取得することに成功した。また、当該ゲノム配列を公開されている既存のゲノム配列とAverage nucleotide identity解析により比較したところ、高くても95 %の配列類似性しか示さないことが明らかとなった。以上のことから、本菌種は、新種の可能性が高く、本菌種の性状を今後さらに解析することは、乳児期の腸内細菌叢を理解するうえで重要であることが示唆された。

During lactation, beneficial bacterial flora formation, life cycle, host health effects, and reproductive health The purpose of this study was to clarify the formation of intestinal flora in infancy and lactation and to establish the formation methods of beneficial flora. In 2022, we will implement specific measures for intestinal bacterial species inhabiting the intestine of infants. Specific culture conditions for the isolation of intestinal bacterial species include: The species identity, complete length and 16S rRNA alignment are determined. As a result, most of the previously reported bacterial species (Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis) were identified in the breast intestine, and new species were identified. This year, the analysis of new species and presumptions of Bacteroides species was carried out. The specific analysis of the next generation is carried out. The result is that the number of entries in the list is higher than the number of entries in the list When the nucleotide sequence is disclosed, the existing nucleotide sequence is analyzed by comparing the nucleotide sequence similarity with the nucleotide sequence similarity of 95%. The above results show that the species is highly probable as a new species, and the characters of the species are important for understanding the intestinal flora in lactation.