乳児腸内フローラの形成機構の包括的理解と新規制御法への応用

全面认识婴儿肠道菌群形成机制及新防治方法的应用

• 批准号: 22KJ1790
• 负责人: 小酒井 智也
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1790/
• 关键词: ビフィズス菌; 腸内細菌叢; 共生; 乳児

乳児期における有益な細菌叢形成は、生涯にわたり宿主の健康に影響を及ぼすことがわかっている。本研究では、乳児期の腸内細菌叢の形成メカニズムの解明、および有益な菌叢の形成手法の確立を目的とする。乳児期の有益な腸内細菌叢の形成メカニズムの解明にあたり、2022年度は、乳児腸内に棲息する腸内細菌種の特定を実施した。具体的には、数名の健康な母乳栄養児の糞便サンプルから様々な培養条件によって腸内細菌種の単離を行った。種の同定は、完全長の16S rRNA配列を決定することで行った。その結果、乳児腸内でよく検出される既報の細菌種（いくつかのBifidobacterium種やStaphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalisなど）が大多数を占めていたものの、新種と推定されるBacteroides種も単離することに成功した。本年度は、さらに上記の新種と推定されるBacteroides種について解析を実施した。具体的にはまず、次世代シークエンサーを用いてゲノム解析を実施した。その結果、3つのコンティグから構成されるクオリティの高いゲノム配列を取得することに成功した。また、当該ゲノム配列を公開されている既存のゲノム配列とAverage nucleotide identity解析により比較したところ、高くても95 %の配列類似性しか示さないことが明らかとなった。以上のことから、本菌種は、新種の可能性が高く、本菌種の性状を今後さらに解析することは、乳児期の腸内細菌叢を理解するうえで重要であることが示唆された。

Good milk stage where に お け る な bacterial flora formation は, career に わ た り の health に host を and ぼ す こ と が わ か っ て い る. This study で は, milk stage where の intestinal bacterial flora の form メ カ ニ ズ ム の uttered, お よ び な beneficial flora の forming technique の establish を purpose と す る. Milk stage where の な beneficial intestinal bacterial flora の form メ カ ニ ズ ム の interpret に あ た り, 2022 annual は, milk where intestinal に perched す る intestinal bacterial の specific を be applied し た. Specific に は, several の health な breast tech students.their ownship where の feces サ ン プ ル か ら others 々 な culture conditions に よ っ て intestinal bacterial の 単 line from を っ た. The homophobic <s:1> and the arrangement of fully long <s:1> 16S rRNA を determine the する った とで とで line った. The そ <s:1> result shows that される reported bacterial species (く く 児 される <s:1> <s:1> Bifidobacterium species やStaphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus) are found in the 児 intestine of milk Faecalis な ど) accounted for most が を め て い た も の の presumption, new species と さ れ る Bacteroides kind も 単 from す る こ と に successful し た. This year, <s:1> and さらに are recorded. <s:1> new species と are presumed to be されるBacteroides species に さらに て て analysis を implementation た. Specific に は ま ず, next generation シ ー ク エ ン サ ー を with い て ゲ ノ ム parsing を be applied し た. そ の results, 3 つ の コ ン テ ィ グ か ら constitute さ れ る ク オ リ テ ィ の high い ゲ ノ ム match column を obtain す る こ と に successful し た. ま た, when the ゲ ノ ム match column を public さ れ て い る existing の ゲ ノ ム match column と business nucleotide identity resolution に よ り compare し た と こ ろ, high く て も の 95% similarity with column し か shown さ な い こ と が Ming ら か と な っ た. Above の こ と か ら, the strains は, new species likely が の く, the strains の traits を future さ ら に parsing す る こ と は, milk stage where の intestinal bacterial flora を understand す る う え で important で あ る こ と が in stopping さ れ た.