N-Dimensionale Trennung zur Charakterisierung von Proteomen

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In der Arbeitsgruppe I soll ein neues Verfahren zur Proteomcharakterisierung (1) erprobt werden, welches die mehrdimensionale Analyse von Proteomen erlaubt. Dazu werden die Proteine des Proteoms unter standardisierten Bedingungen einer Vielzahl von n größer 2 Trennverfahren derart unterworfen, daß jeweils jede der in einem Trennschritt enthaltenen m1 Fraktionen in einem darauffolgenden Trennschritt m2 Fraktionen liefert, so daß am Ende m1 x m2 ...x mn = M Fraktionen in wässriger Lösung vorliegen, die durch Identifikatoren, Quantifikatoren und die Lage im n-dimensionalen Analysenraum charakterisiert sind. Als eine Methode der Identifikation und Quantifikation soll die hochauflösende Massenanalyse mit einem Q-Tof Hybridmassenspektrometer im off- und online Einsatz nach Proteaseverdau zum Erhalt eines Peptide Mass Fingerprints bzw. eines Sequence tags der Peptide sowie der Aufklärung von Modifikationen nach Fragmentierung eingesetzt werden.