蛋白質のモジュ-ル内及びモジュ-ル間相互作用と立体構造

模块内和模块间相互作用以及蛋白质的三级结构

• 批准号: 03680229
• 负责人: 野口 俊之
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1991
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1991 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03680229/
• 关键词: 蛋白質立体構造; 水素結合ネットワ-ク; 疎水相互作用; モジュ-ル

蛋白質の立体構造はコンパクトなモジュ-ルが要素となって構成される。各モジュ-ルの立体構造が主にその内部の相互作用により決まるのかどうかを明らかにするために,X線結晶解析により明らかになっている蛋白質立体構造を解析し、モジュ-ル内及びモジュ-ル間の、水素結合、疎水相互作用の分布を調べた。次に、モジュ-ル内のネットワ-クのパタ-ンを解析し、そのモジュ-ルの立体構造形成への役割を考察した。バルナ-ゼ、シトクロ-ムP450cam等の蛋白質におけるモジュ-ル内及びモジュ-ル間での水素結合、疎水相互作用を調べた結果、水素結合はモジュ-ル内に集中して分布していることが明らかになった。解析が完了していないが、他のタンパク質への一般化の可能性は高い。このことは、モジュ-ルの立体構造を決定する相互作用は主にモジュ-ル自身に内在していることを示唆する。一方、疎水相互作用の分布からは、モジュ-ル立体構造の安定化に、モジュ-ル間の疎水相互作用が大きく寄与していることが示唆された。バルナ-ゼのモジュ-ル内の水素結合ネットワ-クのパタ-ンを調べた結果、ヘリックスやタ-ンなどの2次構造において主鎖間だけでなく側鎖間及び側鎖増鎖間の水素結合も形成され、モジュ-ルのコンパクトな立体構造形成に寄与していることが明らかになった。水素結合ネットワ-クのパタ-ンを表現するためのコンピュ-タ-言語による構造の記述法の基本部分を開発した。シトクロ-ムP450においてバクテリアの系統で保存されるの残基の側鎖間水素結合ネットワ-クを調べた結果、二組見いだされた。これらは、機能上重要であると考えられる。構造形成上重要な原子間相互作用が分子進化においてどの様に保存されるかは、今後の問題であろう。

The protein is stereoscopic, so that the elements can be used in the process. The interaction between the main components in each computer is determined by the computer. The results of X-ray analysis show that the protein is analyzed by X-ray analysis, the protein is analyzed by X-ray analysis, the interaction between water and water is distributed by the combination of water and water. The second, the second and the second. In this study, the results of the combination of water and water interaction, the concentration of water and the concentration of water in the concentration of water, water and P450cam were analyzed in this paper. After the analysis is done, the possibility of generalization is high. The three-dimensional structure determines the interaction between the main body and the inner part of itself. On the one hand, the distribution of water interaction is related to the distribution of water interaction, the distribution of water interaction and the distribution of water interaction. The contents of water in the air are combined with the results of the experiments, the results of the experiments, the results of the The combination of water and water shows that the basic part of the recording method is different from each other. In combination with the results of the test results, the results of the two groups can be seen in the combination of the water content in the system, which is responsible for the preservation of amino acid residues in the system. Take an important part of the examination and examination of important information on the machine. The formation of important interatomic interactions between molecules is important in the formation of interatomic interaction molecules.