チトクロ-ムPー450の水素結合ネットワ-クと機能発現
チトクロ-ムPー450の水素結合ネットワ-クと機能発現
批准号:
02217207
负责人:
郷 通子
金额:
$0.96万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1990
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1990 至 --
中文摘要
本研究の目的はチトクロ-ムPー450の機能の分子機構と進化を、水素結合のネットワ-クに着目して解明することである。研究実施計画に従って以下の成果が得られた。(1)プチダ菌チトクロ-ムPー450camの立体構造は、X線結晶解析により明らかにされている。九州大学薬学部堀内教授グル-プはヘムの保持が悪いミュ-タントをいくつも得ている。そのうちの一つに286GluがLysに置換されたものがある。水素結合のネットワ-クを調べたところ、286Gluは364Argと水素結合で結ばれており、この364Argは次に360Glnと水素結合で結ばれていた。さらに、このGlnは、ヘムのFeと側鎖で結合している357Cysと水素結合を形成していることがわかっている。すなわち、286Gluは水素結合ネットワ-クを通して、ヘムと結ばれていることが明らかになった。従って、286GluがLysに置き替わっているミュ-タントでは、明らかに364Argと水素結合がつくれない。つまり水素結合ネットワ-クを壊し、ヘムの保持を悪化していると示唆された。さらに、357Cysは350Pheとも水素結合をつくっている。この350Pheはすべてのチトクロ-ムPー450で保存されており、電子伝達に関与している可能性も高い。この点からもこの286Gluー364Argー360Glnー357Cysー350Pheをつなぐ水素結合のネットワ-クの重要性がうかがえた。事実364Argはプチダレドキシンとの静電的結合に重要であろうとされている。286Lysのミュ-タントについてエネル-ギ-極小化を行ったが、立体障害は起こらないことから、水素結合ネットワ-クの破壊がヘムの保持悪化の要因である可能性を支持する。(郷、野口)(2)慶応大学医学部石村教授グル-プとの協同研究により、Pー450camへのプロトン供給源として、252Thrと366Gluおよび3個の水分子を通して形成する水素結合ネットワ-クの重要性を指摘した。(野口)
英文摘要
本研究の目的はチトクロ-ムPー450の機能の分子機構と進化を、水素結合のネットワ-クに着目して解明することである。研究実施計画に従って以下の成果が得られた。(1)プチダ菌チトクロ-ムPー450camの立体構造は、X線結晶解析により明らかにされている。九州大学薬学部堀内教授グル-プはヘムの保持が悪いミュ-タントをいくつも得ている。そのうちの一つに286GluがLysに置換されたものがある。水素結合のネットワ-クを調べたところ、286Gluは364Argと水素結合で結ばれており、この364Argは次に360Glnと水素結合で結ばれていた。さらに、このGlnは、ヘムのFeと側鎖で結合している357Cysと水素結合を形成していることがわかっている。すなわち、286Gluは水素結合ネットワ-クを通して、ヘムと結ばれていることが明らかになった。従って、286GluがLysに置き替わっているミュ-タントでは、明らかに364Argと水素結合がつくれない。つまり水素結合ネットワ-クを壊し、ヘムの保持を悪化していると示唆された。さらに、357Cysは350Pheとも水素結合をつくっている。この350Pheはすべてのチトクロ-ムPー450で保存されており、電子伝達に関与している可能性も高い。この点からもこの286Gluー364Argー360Glnー357Cysー350Pheをつなぐ水素結合のネットワ-クの重要性がうかがえた。事実364Argはプチダレドキシンとの静電的結合に重要であろうとされている。286Lysのミュ-タントについてエネル-ギ-極小化を行ったが、立体障害は起こらないことから、水素結合ネットワ-クの破壊がヘムの保持悪化の要因である可能性を支持する。(郷、野口)(2)慶応大学医学部石村教授グル-プとの協同研究により、Pー450camへのプロトン供給源として、252Thrと366Gluおよび3個の水分子を通して形成する水素結合ネットワ-クの重要性を指摘した。(野口)
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Kenーichi Yoshikawa: "“Hydrogen Bond Network of Cytochrome P450cam: A Network Connecting the Heme Group with Helix K""
Kenichi Yoshikawa:“细胞色素 P450cam 的氢键网络:连接血红素基团与 Helix K 的网络”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Tosiyuki Noguti: "In Protein Engineering “Structural Basis of Hierarchical Multiple Substates of a Protein"" eds.M.Ikehara,T.Oshima and K.Titani(Japan Scientific Societies Prss), 355 (1990)
Tosiyuki Noguti:“蛋白质工程中的“蛋白质分层多重亚基的结构基础””eds.M.Ikehara、T.Oshima 和 K.Titani(日本科学学会出版社),355 (1990)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Tosiyuki Noguti: "“Hydrogenーbond network within and between modules in Barnase""
Tosiyuki Noguti:““Barnase 模块内部和模块之间的氢键网络””
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kei Yura: "“New types of βーturns in Globular Proteins""
Kei Yura:“球状蛋白中新型 β 转角”
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kaoru FukamiーKobayashi: "“Robustness of maximum likelihood tree estimation against different patterns of base substitutions."" J.Mol.Evol.32. 79-91 (1991)
Kaoru Fukami-Kobayashi:““针对不同碱基替换模式的最大似然树估计的鲁棒性。”J.Mol.Evol.32. 79-91 (1991)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
タンパク質の多様性獲得戦略の解明に基づいたゲノム情報の解読
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批准号:16637005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2004
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负责人:郷 通子
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依托单位:
プロテオーム時代の計算情報生物学
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批准号:11898023
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.11万
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财政年份:1999
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负责人:郷 通子
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依托单位:
転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
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批准号:09249208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1997
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负责人:郷 通子
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依托单位:
転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
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批准号:08260208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:郷 通子
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依托单位:
タンパク質モジュールとエクソンとの対応の普遍性
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批准号:08458205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$4.74万
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财政年份:1996
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负责人:郷 通子
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依托单位:
転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
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批准号:08260208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:郷 通子
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依托单位:
転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
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批准号:07268207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1995
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负责人:郷 通子
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依托单位:
転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
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批准号:06276208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1994
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负责人:郷 通子
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依托单位:
チトクロ-ムP-450の立体構造と機能発現
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批准号:01635507
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1989
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负责人:郷 通子
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依托单位:
タンパク質のモジュール構造の自動的同定と視覚化
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批准号:62580222
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1987
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负责人:郷 通子
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依托单位:
モジュール構造の付加および欠失によるタンパク質の進化
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批准号:59580171
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1984
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负责人:郷 通子
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依托单位:
蛋白質の立体構造を構築する構造単位の探索
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批准号:56580203
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1981
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负责人:郷 通子
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依托单位:
蛋白質のおれたたみを規定した時の, アミノ酸置換の可・不可の判定
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批准号:X00095----468105
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
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资助金额:$0.26万
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财政年份:1979
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负责人:郷 通子
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依托单位:
DNAの融解曲線の微細構造から塩基配列に関する情報を得るための理論的方法の開発
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批准号:X00095----268089
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
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资助金额:$0.26万
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财政年份:1977
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负责人:郷 通子
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依托单位: