Study on DNA and related bioinformatics databases

DNA及相关生物信息学数据库研究

• 批准号: 07041155
• 负责人: GOJOBORI Takashi
• 金额: $ 12.42万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for international Scientific Research
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 1997
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07041155/
• 关键词: database; DNA; protein; DDBJ; GenBank; bioinformatics; EBI; Gen Bank

The opiectives of this study was threefold. Firstly, we attended annual meetings of the three nucleotide sequence databanks (DDBJ,EBI,and NCBI). Secondly, we investigated how the nucleotide sequence databases and other biological databases were constructed in various foreign institutions. Thirdly, we investigated the use of various biological database including the DDBJ/EMBL/GenBank international nucleotide sequence database, amino acid sequence database, and so on in foreign countries. In particular, the use of biological information databases in some Asian countries and Australia was investigated. Those research results are useful resources for developing and operating various biological databases at CIB (Center for Information Biology).

本研究的目的有三个。首先，我们参加了三个核苷酸序列数据库（DDBJ，EBI和NCBI）的年度会议。其次，我们调查了核苷酸序列数据库和其他生物数据库是如何在国外各机构的建设。第三，考察了国外各种生物数据库的使用情况，包括DDBJ/EMBL/GenBank国际核苷酸序列数据库、氨基酸序列数据库等。特别是，对一些亚洲国家和澳大利亚使用生物信息数据库的情况进行了调查。这些研究成果是CIB（信息生物学中心）开发和运行各种生物数据库的有用资源。

项目成果

Saitou N.: "Evolution of primate ABO blood group genes and their homologous genes" Mol.Biol.Evol.14・4. 399-411 (1997)

Saito N.：“灵长类ABO血型基因及其同源基因的进化”Mol.Biol.Evol.14・4（1997）。

Tateno Y.: "Evolution of DNA and protein structures" Kyouritsu Publishing Company,Tokyo, (1996)

Tateno Y.：《DNA 和蛋白质结构的进化》共立出版公司，东京，（1996 年）

Endo T.: "Large-scale search for genes on which positive selection may operate." Mol.Biol.Evol.13. 685-690 (1996)

Endo T.：“大规模寻找可以进行正选择的基因。”

Fumihito A.: "Monophyletic origin and unique dispersal patterns of domestic fowls." Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.93・13. 6792-6795 (1996)

Fumihito A.：“家禽的单系起源和独特的扩散模式。”Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.93・13（1996）

Tateno,Y.: "DNA data bank of Japan in the age of information biology." Nucl.Acids Res.25・1. 14-17 (1997)

Tateno, Y.：“信息生物学时代的日本 DNA 数据库。”Nucl.Acids Res.25·1（1997）。