Molecular Anatomy of Transcription Apparatus

转录装置的分子解剖学

基本信息

  • 批准号:
    07044106
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.22万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for international Scientific Research
  • 财政年份:
    1995
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1995 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The promoter selectivity of Escherichia coli RNA polymerase is determined by two steps of molecular interaction with transcription factors : (1) association of core enzyme with one of various sigma subunits, each recognizing a group of unique promoters, to constitute different forms of holoenzyme ; and (2) association of holoenzyme with one of about 100 species of accessory transcription factors.The intracellular concentration of each sigma subunit was determined using a quantitative immunoblot method.Results indicate that the concentration of sigma subunits and their affinity to core enzyme are subject to control depending on the cell growth conditions.In order to reveal the second step modulation of RNA polymerase specificity, the contact site on RNA polymerase was determined for more than 20 transcription factors.Results indicate that each factor interacts with RNA polymerase at a narrow region consisting of about 10 amino acid residues and that the contact sites are clustered within a regulatory domain of each subunit.Fine mapping has been done for the contact sites on alpha subunit with class-I factors.Furthermore, the contact surface of the class-I factor on the alpha subunit was found to participate in binding DNA enhancer element.
大肠杆菌RNA聚合酶的启动子选择性是由与转录因子的分子相互作用的两个步骤决定的:(1)核心酶与各种σ亚基之一结合,每个亚基识别一组独特的启动子,构成不同形式的全酶; (2)全酶与约100种辅助转录因子之一的结合。使用定量免疫印迹法测定每个σ亚基的细胞内浓度。结果表明,σ亚基的浓度及其与核心酶的亲和力受细胞生长条件的控制。为了揭示RNA聚合酶特异性的第二步调节,RNA上的接触位点 测定了20多个转录因子的聚合酶。结果表明,每个因子与RNA聚合酶在由约10个氨基酸残基组成的狭窄区域内相互作用,并且接触位点聚集在每个亚基的调节域内。对α亚基上与I类因子的接触位点进行了精细定位。此外,还发现了α亚基上I类因子的接触面 参与结合DNA增强子元件。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kolb,A.,Kotlarz,D.,Kusano,S.andIsihama,A.: "Selectivity of the Escherichia coli RNA polymerase Eσ^<38> for overlapping promoters and ability ot support CRP activation." Nucleic Acids Res.23. 819-826 (1995)
Kolb, A.、Kotlarz, D.、Kusano, S. 和 Isihama, A.:“大肠杆菌 RNA 聚合酶 Eσ^<38> 对重叠启动子的选择性和支持 CRP 激活的能力。” 819 -826 (1995)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Jishage, M.and Ishihama, A.: "Regulation of RNA polymerase sigma subunit synthesis in Escherichia coli : Intracellular levels of sigma^<70> and sigma^<38>." J.Bacteriol.177. 6832-6835 (1995)
Jishage, M. 和 Ishihama, A.:“大肠杆菌中 RNA 聚合酶 sigma 亚基合成的调节:细胞内 sigma^<70> 和 sigma^<38> 水平。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kumar,A.,Williamson,H.E.,Fujita,N.,Ishihama,A.and Hayward,R.S.: "S partially functional 245 amino acid internal deletion derivative of Escherichia coli sigma-70" J.Bacteriol.177. 5193-5196 (1995)
Kumar,A.,Williamson,H.E.,Fujita,N.,Ishihama,A. 和 Hayward,R.S.:“大肠杆菌 sigma-70 的 S 部分功能性 245 个氨基酸内部缺失衍生物”J.Bacteriol.177。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kolb, A., Kotlarz, D., Kusano, S.and Ishihama, A.: "Selectivity of the Escherichia coli RNA polymerase Esigma^<38> for overlapping promoters and ability to support CRP activation." Nucleic Acids Res.23. 819-826 (1995)
Kolb, A.、Kotlarz, D.、Kusano, S. 和 Ishihama, A.:“大肠杆菌 RNA 聚合酶 Esigma^<38> 对重叠启动子的选择性和支持 CRP 激活的能力。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ding, Q., Kusano, S.Villarejo, M.and Ishihama, A.: "Promoter selectivity of osmoregulated promoters between E^D and E^S holoenzymes." Mol.Microbiol.16. 649-656 (1995)
Ding, Q.、Kusano, S.Villarejo, M. 和 Ishihama, A.:“E^D 和 E^S 全酶之间渗透调节启动子的启动子选择性。”
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知道了