Identification of Regulation Targets and Analysis of Regulation Modes by Uncharacterized Transcription Factors from Escherichia coli

大肠杆菌非特征性转录因子调控靶点的识别及调控模式分析

• 批准号: 18310133
• 负责人: ISHIHAMA Akira
• 金额: $ 11.67万
• 依托单位: Hosei University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18310133/
• 关键词: ゲノム調節; 転写; 遺伝子; 細菌; 発現制御; 転写因子; 転写包括制御; RNAポリメラーゼ; プロモーター; 転写制御ネットワーク; GENOMIC SELEX; 大腸菌; 環境応答; 転写制御; 転写調節ネットワーク; GENONIC SELEX

転写酵素RNAポリメラーゼの転写対象遺伝子群の選択は、転写因子との相互作用によって決定される。約300種類の大腸菌転写因子のうち、約100種は制御機能未知である。本研究では、機能未知転写因子が認識する配列から制御機能を同定するGenomic SELEX法を開発した。純化転写因子を利用した解析から、各転写因子の制御対象遺伝子群の同定に成功したことで、ゲノム転写包括制御の全貌解明の展望が開けた。

The selection and interaction of gene expression factors in RNA transcription and gene expression target groups determine the gene expression. About 300 species of E. coli are described as factors, and about 100 species of E. coli have unknown control functions. In this study, the Genomic SELEX method was developed to identify the allocation of unknown writing factors and control functions. The purification factor is used to analyze and determine the identity of the control target group of each factor.

项目成果

Genomic SELEX法による大腸菌転写因子標的プロモーターの探索

使用基因组SELEX方法搜索大肠杆菌转录因子靶启动子

• 发表时间: 2007
• 作者: 小笠原 寛;島田友祐;寺本 潤;長谷川明子;梅澤喜正;矢吹光史郎;石田雄士;稲葉達也;鍛代悠一;加藤大策;小林尚貴;山田佳代子;郡 彩子;山本兼由;石浜 明
• 通讯作者: 石浜 明

Global regulation of genome transcription : Multi-factor promoters and multi-factor networks

基因组转录的全局调控：多因子启动子和多因子网络

• 发表时间: 2008
• 作者: Ishihama;A
• 通讯作者: A

植物由来の配糖体取り込み系を制御する大腸菌転写因子AscGの機能解明

阐明控制植物源糖苷摄取系统的大肠杆菌转录因子 AscG 的功能

• 发表时间: 2008
• 作者: 石田雄士;郡彩子;石浜明
• 通讯作者: 石浜明

大腸菌核様体構造蛋白質H-NSのゲノム包括制御における役割

大肠杆菌核状结构蛋白H-NS在全基因组调控中的作用

• 发表时间: 2007
• 作者: 矢吹光史郎;島田友裕;三木健良;石浜 明
• 通讯作者: 石浜 明

大腸菌転写因子YpdB支配下制御遺伝子群の同定と制御機構の解明

大肠杆菌转录因子YpdB调控基因的鉴定及调控机制的阐明

• 发表时间: 2009
• 作者: 辻野昌広;仲岡雅裕;堀正和;山本智子;奥田武弘;野田隆史;稲葉達也・山田佳代子・郡彩子・石浜明
• 通讯作者: 稲葉達也・山田佳代子・郡彩子・石浜明