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Identification of Regulation Targets and Analysis of Regulation Modes by Uncharacterized Transcription Factors from Escherichia coli

Identification of Regulation Targets and Analysis of Regulation Modes by Uncharacterized Transcription Factors from Escherichia coli
大肠杆菌非特征性转录因子调控靶点的识别及调控模式分析
批准号：
18310133
负责人：
ISHIHAMA Akira
金额：
$11.67万
依托单位：
Hosei University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18310133/
关键词：
ゲノム調節転写遺伝子細菌発現制御転写因子転写包括制御RNAポリメラーゼプロモーター転写制御ネットワークGENOMIC SELEX大腸菌環境応答転写制御転写調節ネットワークGENONIC SELEX

项目摘要

项目成果

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転写酵素RNAポリメラーゼの転写対象遺伝子群の選択は、転写因子との相互作用によって決定される。約300種類の大腸菌転写因子のうち、約100種は制御機能未知である。本研究では、機能未知転写因子が認識する配列から制御機能を同定するGenomic SELEX法を開発した。純化転写因子を利用した解析から、各転写因子の制御対象遺伝子群の同定に成功したことで、ゲノム転写包括制御の全貌解明の展望が開けた。
英文摘要
転写酵素RNAポリメラーゼの転写対象遺伝子群の選択は、転写因子との相互作用によって決定される。約300種類の大腸菌転写因子のうち、約100種は制御機能未知である。本研究では、機能未知転写因子が認識する配列から制御機能を同定するGenomic SELEX法を開発した。純化転写因子を利用した解析から、各転写因子の制御対象遺伝子群の同定に成功したことで、ゲノム転写包括制御の全貌解明の展望が開けた。
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会议论文
Genomic SELEX法による大腸菌転写因子標的プロモーターの探索
使用基因组SELEX方法搜索大肠杆菌转录因子靶启动子
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [小笠原 寛, 島田友祐, 寺本 潤, 長谷川明子, 梅澤喜正, 矢吹光史郎, 石田雄士, 稲葉達也, 鍛代悠一, 加藤大策, 小林尚貴, 山田佳代子, 郡 彩子, 山本兼由, 石浜 明]
通讯作者： 石浜 明
Global regulation of genome transcription : Multi-factor promoters and multi-factor networks
基因组转录的全局调控：多因子启动子和多因子网络
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Ishihama, A]
通讯作者： A
植物由来の配糖体取り込み系を制御する大腸菌転写因子AscGの機能解明
阐明控制植物源糖苷摄取系统的大肠杆菌转录因子 AscG 的功能
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [石田雄士, 郡彩子, 石浜明]
通讯作者： 石浜明
大腸菌核様体構造蛋白質H-NSのゲノム包括制御における役割
大肠杆菌核状结构蛋白H-NS在全基因组调控中的作用
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [矢吹光史郎, 島田友裕, 三木健良, 石浜 明]
通讯作者： 石浜 明
共 106 条
    Identification of Regulatory Roles of All Transcription Factors from a Single Organism
    • 批准号：
      25430173
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.41万
    • 财政年份：
      2013
    • 负责人：
      ISHIHAMA Akira
    • 依托单位：
      Hosei University
    Regulatory Roles and Networks of the Whole Set of Transcription Factors in Escherichia coli
    • 批准号：
      21241047
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $28.79万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      ISHIHAMA Akira
    • 依托单位：
      Hosei University
    Global regulation of genome expression : Single cell analysis of environmental stress response
    • 批准号：
      17076016
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $62.02万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      ISHIHAMA Akira
    • 依托单位：
      Hosei University
    Global regulation of genome transcription by modulation of RNA polymerase function
    • 批准号：
      15370079
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $9.22万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      ISHIHAMA Akira
    • 依托单位：
      Nippon Institute for Biological Science
    海外基金