ハロロドプシン族のイオン選択性

盐视紫红质家族的离子选择性

• 批准号: 07780569
• 负责人: 井原 邦夫
• 金额: $ 0.51万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07780569/
• 关键词: バクテリオロドプシン; ハロロドプシン; 好塩菌; イオンポンプ

アルゼンチンから持ち帰った塩試料から単離した好塩菌のうち、これまでのどの属にも属さない新たな好塩菌(arg-4)を見つけた。そこで、ハロロドプシン族のヘリックス組換え実験を行う前に、イオンポンプの情報をさらに得るために、arg-4株から光駆動性イオンポンプの単離を行った。arg-4株の光反応(外液のpH変化)は明らかではなかったが、保存領域を利用したPCR法により、プロトンポンプ、アニオンポンプの遺伝子断片が増幅した。これらの断片をプローブとして用いて、ゲノムDNAからプロトンポンプとアニオンポンプの遺伝子をクローニングした。arg-4のプロトンポンプは、既知のどのプロトンポンプとも約50%の相同性を示した。さらに、プロトンポンプに必須と推定されるアミノ酸残基は全て保存されており、この遺伝子がコードする産物は機能性タンパクであると判断した。また、arg-4のアニオンポンプは、既知のどのアニオンポンプとも60〜70%の相同性を示した。これも、機能的に必須と推定されているアミノ酸残基は全て保存されていた。さらに、アニオンポンプの保存性が、プロトンポンプの保存性と比べて高いことは、機能制約のかかったイオンポンプ一般の特徴である事から、これらの2つのバクテリアのイオンポンプの遺伝子は、偽遺伝子ではなく、発現しうるクリプテイック遺伝子と推定した。この新たな2種の細菌レチナ-ルタンパクの遺伝子をバクテリオロドプシンの発現系に相同組み換えを利用して導入し、発現産物の物性を測定する予定である。同時に、この新たなアニオンポンプの構造から、B-Cループの重要性が再認識された。そこで、ハロロドプシンのB-Cループを、ファラオニスハロロドプシンで置き換えた組み換え体を作成中である。得られた成果は、公表する予定である。

The test sample was separated from the original sample and the new sample (arg-4) was found in the original sample. For example, if you want to change the color of the image, you can change the color of the image before you change the color of the image. Arg-4 strain of light reflection (pH change of external solution), the preservation of the field, using PCR method to detect, detect, detect and detect the gene fragments increased. This is the first time that a DNA fragment has been removed from a DNA fragment. arg-4 is about 50% identical to the known arg-4. In addition, it must be presumed that the acid residues are completely preserved and that the products are functional. 60~70% similarity between arg-4 and arg-4 is shown. The function of the enzyme must be presumed to be completely preserved. In addition, the preservation property of the protein, the preservation property, the preservation property The two new bacterial strains were introduced into the reaction system and the physical properties of the reaction products were determined. At the same time, the importance of B-C structure is re-recognized. The B-C model of the system is composed of three parts: The results were obtained and the public table was determined.