岩塩/好塩性古細菌分布データベース作成

创建石盐/嗜盐古菌分布数据库

基本信息

  • 批准号:
    09214207
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.7万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1997
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1997 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

種々の場所から集めた(古い時代のものだけでなく新しい時代のものを含めた)岩塩を用いて、注意深く滅菌操作を行い、(1)好塩性古細菌の培養と,(2)PCR法による16SrRNA遺伝子の増幅を試みた。その結果、各地から集めた12の試料の内、3つの岩塩から好塩菌の増殖に成功し、脂質分析から確かに古細菌であることは確認できた。さらに、その16SrRNA遺伝子の塩基配列を、現存する種々の好塩菌と比較した結果、Haloferax属、Haloarcula属、Halococcus属に近いことは判断できたが、系統樹上で明らかに古いものとはならなかった。手に入った岩塩の中で、古い地質時代(カンブリア紀やペルム紀)からのものと思われる試料からは、まったく増殖が観察できなかった。また、抽出試料の直接PCRも、まったく増幅が観察されなかった。岩塩中での好塩菌の生存曲線は明らかではなく、ある一定期間以前の試料からの再生は望めないのかもしれないが、まだ分析した試料の量が少ないので、好塩菌の岩塩中での局在化の問題も含め、検討の余地はある。現存する好塩菌については、そのレチナ-ルタンパクのアミノ酸配列から分子系統樹を作成し、遺伝子重複によって増えたと思える4種類の同族体の関係を明らかにした(投稿中)。この遺伝子重複の時点は進化の時間軸において一つのマーカーとなり、分化時期の推定を確かなものにできるかもしれない。さらに、ATPaseやシトクロームオキシダーゼのような重要なタンパクにも重複が見られることがわかった。この中には、好塩菌の種分化以降に重複を起こしているものがあり、生物間の分岐順序を決めるのにも役立つものと考えられる。
(1) Culture of pathogenic archaea,(2) Amplification of 16S rRNA gene by PCR The results showed that the samples collected from 12 places were successfully cultured in 3 rocks, and the lipid analysis confirmed the archaea. 16S rRNA gene alignment, comparison results of existing species, Haloferax, Haloarcula, Halococcus, etc. In the middle and ancient geological ages of the rock, the author thinks that the material is not suitable for the study. The sample was extracted and detected by direct PCR. The survival curve of the good bacteria in the rock is not clear, the sample before a certain period of time is not regenerated, the sample quantity is small, the problem of the good bacteria in the rock is not included, and the room for discussion is not included. The phylogenetic tree of the four species of the extant strains was constructed, and the relationship between the four species was clarified (in submission). The Timeline of the Evolution of the Sequence Repeat and the Estimation of the Differentiation Period For example, if you want to see a picture of a mouse, you can see a picture of it. In this way, the species differentiation of good bacteria is repeated in the descending direction, and the order of differentiation between organisms is determined.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kunio Ihara: "Identification of proteolipid from an extremely halophilic archaeon Halobacterium salinarum as an N,N'-dicyclohexyl-carbodiimide binding subunit of ATP synthase" Archives of Biochemistry and Biophysics. 341・2. 267-272 (1997)
Kunio Ihara:“鉴定来自极端嗜盐古菌盐杆菌的蛋白脂质作为 ATP 合酶的 N,N-二环己基碳二亚胺结合亚基”,生物化学和生物物理学档案 341・2(1997)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kunio Ihara: "Haloarcula argentinesis sp.nov.and Haloarcula mukohataei sp.nov.,Two new splecies of extremely halophilic archaea collected in Argentina." International Journal of Systematic Bacteriology. 47. 73-77 (1997)
Kunio Ihara:“Haloarcula argentinesis sp.nov.和Haloarcula mukohataei sp.nov.,在阿根廷收集的两个新的极端嗜盐古菌物种。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 作者:
    岡 大椰;兒島 孝明;井原 邦夫;小林 哲夫;中野 秀雄
  • 通讯作者:
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    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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    $ 0.7万
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    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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